| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,434,968 | G→A | D109N (GAT→AAT) | dapD → | 2,3,4,5‑tetrahydropyridine‑2,6‑dicarboxylate N‑succinyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,434,968 | 0 | G | A | 98.0% | 320.0 / NA | 99 | D109N (GAT→AAT) | dapD | 2,3,4,5‑tetrahydropyridine‑2,6‑dicarboxylate N‑succinyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/0); new base A (48/49); total (50/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TTACGAAGCATATGGTAGTCAATTCGAAGATATAGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCA > CP000730/1434826‑1435111 | ttACGAAGCATATGGTAGTCAATTCGAAGATATAGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAGGCCATTATTGAAGATggg > 1:778248/1‑147 (MQ=255) aCGAATCATATGGTAGTCAATTCGAAGATATAGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGc < 1:261032/148‑1 (MQ=255) aCGAAGCATATGGTAGTCAATTCGAAGATATAGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGc < 1:989915/148‑1 (MQ=255) gAAGCATATGGTAGTCAATTCGAAGATATAGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTg > 2:48395/1‑148 (MQ=255) aGCATATGGTAGTCAATTCGAAGATATAGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTc < 2:204997/148‑1 (MQ=255) aGCATATGGTAGTCAATTCGAAGATATAGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACAAGGTGCGTTAATTAGAGAACAAGCCATAATTGAAAatgatgagatg > 2:768725/1‑143 (MQ=255) gCATATGGTAGTCAATTCGAAGATATAGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATCAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCg < 2:120004/148‑1 (MQ=255) cATATGGTAGTCAATTCGAAGATATAGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTAGt > 1:746858/1‑148 (MQ=255) ggTAGTCAATTCGAAGATATAGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACGAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTatga > 1:382889/1‑148 (MQ=255) gTAGTCAATTCGAAGATATAGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTatgat > 2:430947/1‑148 (MQ=255) gTAGTCAATTCGAAGATATAGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTatgat > 1:445924/1‑148 (MQ=255) tAGTCAATTCGAAGATATAGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTatgatg > 2:446948/1‑148 (MQ=255) tAGTCAATTCGAAGATATAGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTatgatg < 2:778409/148‑1 (MQ=255) aGTCAATTCGAAGATATAGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTCGAGAACAAGCCATTATTGCAGATGCTCTTGTCGTTTTGATgg > 2:932819/1‑148 (MQ=255) aGTCAATTCGAAGATATAGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATgg > 1:57505/1‑148 (MQ=255) aTTCGAAGATATAGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACACGCCATTCTTGAAAATGGTGCTGTCGTGATGATGGGCGca > 1:257949/1‑148 (MQ=255) aTTCGAAGATATAGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTatgatcgcggca > 1:222117/1‑141 (MQ=255) aTTCGAAGATATAGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGca > 2:461797/1‑148 (MQ=255) aTTCGAAGATATAGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCAGTCGTTATGATGGGCGca > 1:228181/1‑148 (MQ=255) cGAAGATATAGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGcaaca < 1:465426/148‑1 (MQ=255) cGAAGATATAGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGcaaca < 2:812628/148‑1 (MQ=255) gAAGATATAGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGcaacaa < 2:935927/148‑1 (MQ=255) tataGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAat > 1:813342/1‑148 (MQ=255) tataGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAat > 2:866353/1‑148 (MQ=255) tataGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATCCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAGTTAat > 1:375932/1‑148 (MQ=255) gAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTg > 1:748229/1‑148 (MQ=255) aaatGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTATAAAATACGAATGCACGAATTGAACGAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGgc < 1:766656/145‑1 (MQ=255) aTTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGgcg > 2:223261/1‑148 (MQ=255) aTTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGgcg > 2:920500/1‑148 (MQ=255) gAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAg > 1:320159/1‑148 (MQ=255) gAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCCCAg > 1:735527/1‑148 (MQ=255) aaaTGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGt > 1:155871/1‑148 (MQ=255) aaaTGGATCGTCGCAATTATGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGt > 1:142990/1‑148 (MQ=255) tgtaTCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGt < 1:719577/145‑1 (MQ=255) gATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTCAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTg > 1:646066/1‑148 (MQ=255) gATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTg > 2:249659/1‑148 (MQ=255) cgtcgCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCg < 1:48395/148‑1 (MQ=255) cgtcgCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCg < 1:285087/148‑1 (MQ=255) gccaTTCTAGTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCAGCGATTGCACCAGGTGCGTTTATTAGAGGACAAGCCATCATTGTAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCTACAATTAATATGGGCGCAGTCGTTGGCGAAgg < 2:396423/145‑1 (MQ=255) taactCTGCTATTCCATTAAAAGAATTGTCAATTACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCTTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGt < 1:668126/144‑1 (MQ=255) cAAGTCTGCTATTCCATGAAAAGACTTAACAAATACCAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTACAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGt < 1:848010/148‑1 (MQ=255) gCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAAtga < 1:739061/148‑1 (MQ=255) cTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAAtgat > 1:701234/1‑148 (MQ=255) aTTCCATTAAAAGACTTAACAAATACTAATGCACGAATTGCACCAGGTGCGTTTATTATAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCCGTCTTTATGATGGGCGAAAAAAATAAAATTGTCACGGTCGTTGGCGATGGCATAAttcttt < 2:259242/148‑6 (MQ=255) aTTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAAtgattg < 2:23732/148‑1 (MQ=255) aTTCCATTAAAAGACTTAAAAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGAGGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAAtgattg < 2:357130/148‑1 (MQ=255) ttCCATTAAAAGATTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCCTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAAtgattga < 1:768725/148‑1 (MQ=255) ttCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAAtgattga < 1:988851/148‑1 (MQ=255) aTTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAAGGATTGATATg > 1:118634/1‑148 (MQ=255) ttAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGa < 1:691699/148‑1 (MQ=255) tAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGaa < 2:293883/148‑1 (MQ=255) tAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAAGGATTGATATGaa > 1:903273/1‑148 (MQ=255) tAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATAGTGGCGCAGGCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGCTATGaa > 1:764810/1‑148 (MQ=255) aaaaGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAAt < 2:940144/148‑1 (MQ=255) aaaaGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAAt > 2:309889/1‑148 (MQ=255) aaaaGACTTAACAAATACGAAGGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAAt < 2:512275/148‑1 (MQ=255) aaaaGAATTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGCATAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCGACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAAt < 2:547612/148‑1 (MQ=255) aaGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTCTTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGAGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGCGATGAAGGc > 1:263214/1‑148 (MQ=255) aGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCt > 2:820071/1‑148 (MQ=255) aGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCt > 2:350182/1‑148 (MQ=255) cTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTAct > 2:417490/1‑148 (MQ=255) aCAAATACGAGTGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATACTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTAGAATGATGGATATGAATGCTACTCTCg < 2:746858/148‑1 (MQ=255) aCAAATACGAAGGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCg < 1:530710/148‑1 (MQ=255) aaTACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCggtg > 2:230228/1‑148 (MQ=255) taaaTGCAAGAATTGAACCAGGGAGGTTTGTCAAATAAAAAGGTATTATTTAAATTTGTGCTGTCGTTATGATGGGCGTAATAATTAATATTGGCGCAGTAGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCg < 2:646959/146‑1 (MQ=255) taaattaaagaataaaCCAGGTGCGTTTATAAGAGAACAACCAAGTATTTAAAATGGTGCTGTCGTCATGATGGGCGCAACACTTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGt < 2:241389/134‑1 (MQ=255) gAATGTACTAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTACTCTTGCATCTATTGTTGTTGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGt < 1:774310/148‑1 (MQ=255) gAATGCACGAATTGGACCGGGTGCGTTTATTGGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGt < 1:7999/148‑1 (MQ=255) gAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCgc > 2:403393/1‑147 (MQ=255) aaTGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGtc > 2:808627/1‑147 (MQ=255) aaTGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTg > 2:319829/1‑148 (MQ=255) aCGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGGTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCgacgtgta > 2:634585/1‑141 (MQ=255) cGAATTGAACCAGGGGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACaa < 1:820635/148‑1 (MQ=255) gAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCgccgtaccat > 2:859904/1‑139 (MQ=255) gAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAAc > 1:852407/1‑148 (MQ=255) gAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAAc < 1:552073/148‑1 (MQ=255) gAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGACGCCCTACaaa > 2:20313/1‑147 (MQ=255) gAATTGAACCAGGTGCGTTTATTACAGAACAAGCCATGTCTGAAAAGGGTGCTGTCGTTATGAGGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAAc < 1:671661/148‑1 (MQ=255) tGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACGAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGTAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGt < 2:305335/148‑1 (MQ=255) tGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAATCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGt < 1:563686/148‑1 (MQ=255) ccAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTaaaa < 1:900046/148‑1 (MQ=255) gTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGt < 1:866353/148‑1 (MQ=255) tGCGTTTATTAGACAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTa < 1:83364/148‑1 (MQ=255) gCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTAc > 1:61340/1‑148 (MQ=255) ggTTTATTAGAGAAAAAGCCATTCTTGAAAATGGTGCGGTCTTTATGATTGGCGCAACAATTAATATTGCCGGAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATTTGCATGCTACTCTCGGGGGTCGGGCTACAACTGGTAAAAATGTACa < 2:778248/147‑1 (MQ=255) gTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATGGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACAt < 2:813342/148‑1 (MQ=255) gTTTATTAGAGAACAAGCAATTATGGAAAATGGTGCTGTCGTTATTATGGGTGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACAt < 2:941730/148‑1 (MQ=255) gTTTATAAGAGACCATGCCATTATTGAAAAGGGTGCTGTCGTTATGATCGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACCATGATTGATATGCATGCTACTCCCGGTGGCCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACAt < 1:621443/148‑1 (MQ=255) ctttATTAGAGACAAAGCCATTATTTGAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGTTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACAt < 1:195840/147‑1 (MQ=255) cttatttaGAGAACAAGCCATTAATGAAAATGGTGCTGTCTCTATTGTGGGGGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACAt < 2:375932/143‑1 (MQ=255) taGAGAACAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAggg > 1:666512/1‑148 (MQ=255) aaCAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCGGTACCACTAGAAAAAAAATACATGTAGGGGCggg > 2:780131/1‑148 (MQ=255) acaagtaattgctGAAAATGGTGCTGTTGTTAGGATGGGCGCAACAATTTATATTAGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGgc < 2:630009/136‑1 (MQ=255) aCAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCCCTATCATTAATAAAAAAATACATGTAGGGGCAGgc > 2:791479/1‑148 (MQ=255) cAAGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGgcg < 1:309889/148‑1 (MQ=255) aagtttgtattGCAAATGGTGGTGGTGTTATGATGGGCGGAAGAATTAATACTGGCGCAGTCTCGGGGGTAGGGATAATGATTGAGATGAATGCTTCTGTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGgtgc < 2:413315/141‑1 (MQ=255) aaGCCATTATTGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGgcgc > 1:748190/1‑148 (MQ=255) tGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTAAATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCa > 1:415940/1‑148 (MQ=255) tGAAAATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCCTTCTTCTTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCa > 1:228580/1‑148 (MQ=255) | TTACGAAGCATATGGTAGTCAATTCGAAGATATAGAAATTGAAATGGATCGTCGCAATTCTGCTATTCCATTAAAAGACTTAACAAATACGAATGCACGAATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCA > CP000730/1434826‑1435111 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |