| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,709,600 | (T)5→4 | coding (1327/1812 nt) | oatA ← | possible acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,709,596 | 0 | T | . | 98.9% | 415.0 / ‑1.6 | 87 | coding (1331/1812 nt) | oatA | possible acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base . (36/50); minor base C (0/1); total (36/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 | |||||||||||
TATATTGCGATTTCACAATTGGTGTAGCATCAACGAGTTGCCGTCCAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTG‑TTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAA > CP000730/2709456‑2709732 | tataTTGCGATTTCACAATTGGTGTAGCATCAACGAGTTGCCGTCCAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACt < 1:217764/141‑1 (MQ=255)tataTTGCGATTTCACAATTGGTGTAGCATCAACGAGTTGCCGTCCAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACt > 1:691326/1‑141 (MQ=255) tatTGCGATTTCACAATTGGTGTAGCATCAACGAGTTGCCGTCCAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACttt > 1:813315/1‑141 (MQ=255) atTGCGATTTCACAATTGGTGTAGCATCAACGAGTTGCCGTCCAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACtttt > 2:655649/1‑141 (MQ=255) atTGCGATTTCACAATTGGTGTAGCATCAACGAGTTGCCGTCCAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACtttt > 2:49764/1‑141 (MQ=255) tGCGATTTCACAATTGGTGTAGCATCAACGAGTTGCCGTCCAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACttttaa > 1:208807/1‑139 (MQ=255) tGCGATTTCACAATTGGTGTAGCATCAACGAGTTGCCGTCCAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACttttaa < 1:352128/141‑3 (MQ=255) ttCACAATTGGTGTAGCATCAACGAGTTGCCGTCCAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCct > 2:660615/1‑141 (MQ=255) aTTGGTGTAGCATCAACGAGTTGCCGTCCAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGc > 1:123047/1‑141 (MQ=255) ttGGTGTAGCATCAACGAGTTGCCGTCCAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCt < 2:454149/141‑1 (MQ=255) ttGGTGTAGCATCAACGAGTTGCCGTCCAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCt < 2:119678/141‑1 (MQ=255) tGGTGTAGCATCAACGAGTTGCCGTCCAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTa > 2:539293/1‑141 (MQ=255) tgtAGCATCAACGAGTTGCCGTCCAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTc < 2:123047/141‑1 (MQ=255) gtAGCATCAACGAGTTGCCGTCCAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCg > 2:597707/1‑141 (MQ=255) gCATCAACGAGTTGCCGTCCAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTg > 2:111644/1‑141 (MQ=255) cATCAACGAGTTGCCGTCCAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGt < 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tGCCGTCCAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCct > 1:47181/1‑141 (MQ=255) gCCGTCCAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCctc > 2:956751/1‑141 (MQ=255) gCCGTCCAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCctc > 1:775183/1‑141 (MQ=255) ccGTCCAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATACCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCctct > 1:422441/1‑141 (MQ=255) gTCCAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTg > 1:783707/1‑141 (MQ=255) tCCATCTTTACCCTCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAACGCCAATACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTCGTGATG‑CCTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCGTATCCTCTTGc < 2:449298/141‑1 (MQ=255) ccAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCt < 1:961294/141‑1 (MQ=255) ccAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCt < 2:207644/141‑1 (MQ=255) ccAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCt < 1:637101/141‑1 (MQ=255) ccAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCt < 1:569412/141‑1 (MQ=255) gccATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCtttt < 1:636044/140‑1 (MQ=255) aTCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTa > 1:174082/1‑141 (MQ=255) aTCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTa < 1:623601/141‑1 (MQ=255) tCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTaa > 1:4746/1‑141 (MQ=255) cAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAAc < 1:450477/141‑1 (MQ=255) tttGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGAc < 1:61618/141‑1 (MQ=255) ttGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCCATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACt < 1:262290/141‑1 (MQ=255) ttGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACt < 2:365377/141‑1 (MQ=255) tgtgCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACtt < 2:38748/141‑1 (MQ=255) gCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACttttt > 2:285363/1‑141 (MQ=255) aTTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTttc < 1:872888/141‑1 (MQ=255) ttGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTacttggtcttttggt > 2:859494/1‑127 (MQ=255) ttGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTttctt < 2:766672/141‑1 (MQ=255) ttGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTttctt < 2:739055/141‑1 (MQ=255) ttATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCgt < 1:947544/140‑1 (MQ=255) tATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCgtt < 2:237064/141‑1 (MQ=255) ttttCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCgttg‑t < 2:199994/141‑1 (MQ=255) ttCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTG‑ttt > 2:930010/1‑141 (MQ=255) tCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTG‑tttt > 1:284453/1‑141 (MQ=255) tCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTG‑tttt > 2:714206/1‑141 (MQ=255) tAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGACACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCCTATCTTTTTTCACGACTTTTTTCTTCGTTG‑TTTTaaa > 2:802854/1‑141 (MQ=255) aGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTG‑TTTTAAAt < 1:430946/141‑1 (MQ=255) aGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTG‑TTTTAAAt > 2:306402/1‑141 (MQ=255) 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2:339837/141‑3 (MQ=255) cAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTG‑TTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGttt < 2:161413/141‑1 (MQ=255) cAATTAATAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTGCGTTG‑TTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGttt < 1:309169/141‑1 (MQ=255) aaTAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTG‑TTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCaa < 2:776849/141‑1 (MQ=255) aTAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCtt < 1:539693/60‑1 (MQ=255) aTAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCtt > 2:539693/1‑60 (MQ=255) aTAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTG‑TTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAg < 1:517704/141‑1 (MQ=255) aTAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTG‑TTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAg < 2:775183/141‑1 (MQ=255) aTAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTG‑TTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAg < 1:232045/141‑1 (MQ=255) tAGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTG‑TTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGt > 2:59388/1‑141 (MQ=255) aGTGGTGATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTG‑TTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTg < 1:298392/141‑1 (MQ=255) aGTGGTGATGAC‑TTTTAACATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTG‑TTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTg > 1:599475/1‑141 (MQ=255) gtggtgATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTGAAACGAGTTTTGGGTT‑GTTGTTTTTTAATTTCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTGGTTTGCCAAGTGc > 1:335303/1‑141 (MQ=255) tggtgATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTG‑TTTTAAATTCCGCCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCa > 1:762165/1‑141 (MQ=255) ggtgATGNC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTG‑TTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCAt < 2:727404/141‑1 (MQ=255) ggtgATGAC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTG‑TTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCAt < 2:792257/141‑1 (MQ=255) tgatgaC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTG‑TTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCa < 2:343734/141‑1 (MQ=255) atgaC‑TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTG‑TTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCaaa < 1:397601/141‑1 (MQ=255) | TATATTGCGATTTCACAATTGGTGTAGCATCAACGAGTTGCCGTCCAACTTTACCATCAATTTGTGCATTTGGTATTTTCTTAGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTG‑TTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAA > CP000730/2709456‑2709732 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |