| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,679,650 | G→A | C45Y (TGT→TAT) | cbpD → | possible secretory antigen |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,679,650 | 0 | G | A | 98.7% | 241.9 / NA | 74 | C45Y (TGT→TAT) | cbpD | possible secretory antigen |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (33/40); minor base T (1/0); total (34/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.59e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AAAAATGGAATATAAAAAGATACTAATTCGTTTATTAATTGCTTTTGCAGTACTTTTCTCAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATGTACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGCGACTGGTCGTACACCAAGAAAATTTGCTG > CP000730/2679513‑2679784 | aaaaaTGGAATATAAAAAGATACTAATTCGTTTATTAATTGCTTTTGCAGTACTTTTCTCAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATAc > 2:479096/1‑141 (MQ=255) aaaTGGAATATAAAAAGATACTAATTCGTTTATTAATTGCTTTTGCAGTACTTTTCTCAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACAt < 1:726835/141‑1 (MQ=255) aaTGGAATATAAAAAGATACTAATTCGTTTATTAATTGCTTTTGCAGTACTTTTCTCAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACAtg < 1:811911/141‑1 (MQ=255) aaTGGAATATAAAAAGATACTAATTCGTTTATTAATTGCTTTTGCAGTACTTTTCTCAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACAtg < 1:59665/141‑1 (MQ=255) aaTGGAATATAAAAAGATACTAATTCGTTTATTAATTGCTTTTGCAGTACTTTTCTCAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACAtg < 1:811834/141‑1 (MQ=255) aTGGAATATAAAAAGATACTAATTCGTTTATTAATTGCTTTTGCAGTACTTTTCTCAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACAtgg < 2:422350/141‑1 (MQ=255) aTGGAATATAAAAAGATACTAATTCGTTTATTAATTGCTTTTGCAGTACTTTTCTCAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACAtgg > 2:51351/1‑141 (MQ=255) ggAATATAAAAAGATACTAATTCGTTTATTAATTGCTTTTGCAGTACTTTTCTCAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACAtggtg > 2:117000/1‑141 (MQ=255) gAATATAAAAAGATACTAATTCGTTTATTAATTGCTTTTGCAGTACTTTTCTCAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACAtggtgg < 2:693607/141‑1 (MQ=255) gAATATAAAAAGATACTAATTCGTTTATTAATTGCTTTTGCAGTACTTTTCTCAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACAtggtgg < 1:533765/141‑1 (MQ=255) taAAAAGATACTAATTCGTTTATTAATTGCTTTTGCAGTACTTTTCTCAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCAtt < 1:309060/141‑1 (MQ=255) aTACTAATTCGTTTATTAAGTGCTTTTGCAGTACCTTTCTCAGCAGATTTCCCTTAGCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCCCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGt < 1:502152/141‑1 (MQ=255) aaTTCGTTTATTAATTGCTTTTGCAGTACTTTTCTCAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCgcgc > 1:288331/1‑141 (MQ=255) gTTTATTAATTGCTTTTGCAGTACTTTTCTCAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAg < 1:241948/141‑1 (MQ=255) ttattaATTGCTTTTGCAGTATTTTTCTGAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCTCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTc < 2:525552/141‑1 (MQ=255) tattaATTGCTTTTGCAGTACTTTTCTCAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCg > 1:319573/1‑141 (MQ=255) tattaATTGCTTTTGCAGTACTTTTCTCAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCg > 1:944394/1‑141 (MQ=255) taATTGCTTTTGCAGTACTTTTCTCAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTa < 1:421838/141‑1 (MQ=255) aaaTTGCTTTTGCAGTACTTTTCTCAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTa < 2:232828/140‑1 (MQ=255) aaTTGCTTTTGCAGTACTTTTCTCAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTaa < 2:931781/141‑1 (MQ=255) aaTTGCTGTTGCAGTACTTTTCTCAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTaa < 2:536628/141‑1 (MQ=255) gCTTTTGCAGTACTTTTCTCAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCt < 1:295188/141‑1 (MQ=255) ttttGCAGTACTTTTCTCAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGt > 1:598088/1‑141 (MQ=255) gCAGTACTTTTCTCAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCt > 1:945180/1‑141 (MQ=255) gTACTTTTCTCAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAACAACCCCTATACATGGTGGGAATTTAAACGTCGCGCACACGTCGGTAAACCTGTTTCTAAt > 1:815099/1‑141 (MQ=255) tctcAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATggg > 2:101271/1‑141 (MQ=255) gcagATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAAt > 2:260863/1‑141 (MQ=255) cagATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATg < 2:184622/141‑1 (MQ=255) agATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGc < 1:295370/141‑1 (MQ=255) gATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCt < 1:968055/141‑1 (MQ=255) ttCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTaaa > 2:633204/1‑141 (MQ=255) aCTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTCTAGGAAAAACCAAGATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAAt > 1:946423/1‑141 (MQ=255) aCTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAAt > 2:357219/1‑141 (MQ=255) tATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTgg < 2:710065/141‑1 (MQ=255) cAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTAt < 1:345675/141‑1 (MQ=255) tCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTAc < 1:462056/141‑1 (MQ=255) ccGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACa > 2:563531/1‑141 (MQ=255) gTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAAt < 2:25960/141‑1 (MQ=255) tctaaCAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATg < 1:341537/138‑1 (MQ=255) cGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGc > 1:636960/1‑141 (MQ=255) aCAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACg > 1:143776/1‑141 (MQ=255) aCAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACg > 1:448302/1‑141 (MQ=255) aCGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTaaa > 1:736331/1‑141 (MQ=255) gCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATc < 2:10790/141‑1 (MQ=255) gCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATc < 2:10825/141‑1 (MQ=255) tCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAAGATACATGGTGGGCATTTGATCGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGGATTACAATGCACGAAAATCAAAatat > 2:818489/1‑141 (MQ=255) cGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAGACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATg < 1:114352/141‑1 (MQ=255) cGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATg < 1:956582/141‑1 (MQ=255) gCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGc > 2:455408/1‑141 (MQ=255) gCATGCCGCAGTTAATAATTAAAGGAATAACCAATTTACATGGTAGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGc > 2:95864/1‑141 (MQ=255) aTGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGCGa > 2:600052/1‑141 (MQ=255) aTGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGCGa > 2:12725/1‑141 (MQ=255) tGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGCGAc < 2:495519/141‑1 (MQ=255) gCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGCGACt > 2:402237/1‑141 (MQ=255) gCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGCGACt > 2:249378/1‑141 (MQ=255) gCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGCGACt > 2:402421/1‑141 (MQ=255) ccGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGCGACTg < 2:454317/141‑1 (MQ=255) ccGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATCGTGGGCATTTGAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAATTTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGCGACTg < 2:259129/141‑1 (MQ=255) cGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGCGACTgg > 2:207532/1‑141 (MQ=255) gCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTaaa < 2:62776/123‑1 (MQ=255) gCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTaaa > 1:62776/1‑123 (MQ=255) gTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGCGACTGGTCGt > 1:365067/1‑141 (MQ=255) gTTAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGCGACTGGTCGt < 2:603939/141‑1 (MQ=255) ttAATTATTATAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGCGACTGGTCGTa > 1:881538/1‑141 (MQ=255) ttattaTAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGCGACTGGTCGTACAcc > 1:284179/1‑141 (MQ=255) ttattaTAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGCGACTGGTCGTACAcc < 1:878766/141‑1 (MQ=255) ttatAGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGCGACTGGTCGTACACCAAg < 2:821328/141‑1 (MQ=255) gagcacaaaCCAATAAAAAGGGTGGGCATTTAAACGTCGCGAACAAGTAAGTAAACCTGTTTCTAATAGAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGCGACTGGTCGTACACCAAGaaa < 2:570686/135‑1 (MQ=255) aGTAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGCGACTGGTCGTACACCAAGaaaa > 2:356516/1‑141 (MQ=255) tAAAAACCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGCGACTGGTCGTACACCAAGAAAAtt < 1:111170/141‑1 (MQ=255) aaaaaCCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGCGACTGGTCGTACACCAAGAAAAttt > 2:597687/1‑141 (MQ=255) aaCCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGCGACTGGTCGTACACCAAGAAAATTTGCt < 1:596765/141‑1 (MQ=255) aaCCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGCGACTGGTCGTACACCAAGAAAATTTGCt < 2:884479/141‑1 (MQ=255) aCCAATATACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGCGACTGGTCGTACACCAAGAAAATTTGCTg < 2:149218/141‑1 (MQ=255) | AAAAATGGAATATAAAAAGATACTAATTCGTTTATTAATTGCTTTTGCAGTACTTTTCTCAGCAGATTTCACTTATCAATCCGTCGAACAAACGCATCAATCGCATGCCGCAGTTAATTATTATAGTAAAAACCAATGTACATGGTGGGCATTTAAACGTCGCGCACAAGTCGGTAAACCTGTTTCTAATAGATGGGGCAATGCTAAAAATTGGTATTACAATGCACGTAAATCAAAATATGCGACTGGTCGTACACCAAGAAAATTTGCTG > CP000730/2679513‑2679784 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |