New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | 705321 = | 188 (1.000) | 5 (0.030) | 5/278 | 16.8 | 2.7% | intergenic (+1071/+89) | nhaK/psaA | possible CPA1 family monovalent cation (K+ or Na+):proton (H+) antiporter‑1/ABC superfamily ATP binding cassette transporter, binding protein |
? | CP000730 | 705378 = | 189 (1.070) | intergenic (+1128/+32) | nhaK/psaA | possible CPA1 family monovalent cation (K+ or Na+):proton (H+) antiporter‑1/ABC superfamily ATP binding cassette transporter, binding protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
AACTGCATAAGAACTTCTAGCTTTTCTCTTTCGTTCAAAGAGAAGTTCTAATACCACCATATCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGTTTCAATATTTGATTTCATCATTTTGTAGTAAGAGT > CP000730/705173‑705468 | aCTGCATAAGAACTTCTAGCTTTTCTCTTTCGTTCAAAGAGAAGTTCTAATACCACCATATCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTAt > 2:392871/1‑149 (MQ=255) gCATAAGAACTTCTAGCTTTTCTCCTTCGTTCAAAGAGAAGTTCTAATACCACCATATCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGtt < 1:98044/149‑1 (MQ=255) aTAAGAACTTCTAGCTTTTCTCTTTCGTTCAAAGAGAAGTTCTAATACCACCATATCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCCCGATAGGGGACTATTAGCCTTCGCCTTTGTTATGTTGa > 2:212255/1‑149 (MQ=255) aTAAGAACTTCTAGCTTTTCTCTTTCGTTCAAAGAGAAGTTCTAATACCACCATATCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGa > 1:956188/1‑149 (MQ=255) aaCTTCTAGCTTTTCTCTTTCGTTCAAAGAGAAGTTCTAATACCACCATATCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGTtgtgt > 1:1203580/1‑149 (MQ=255) cTTCTAGCTTTTCTCTTTCGTTCAAAGAGAAGTTCTAATACCACCATATCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGTGGTTAATATATATTTACCGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTgg < 1:242346/149‑1 (MQ=255) gCTTTTCTATTTCGTTCAAAGGCAATTTCTAATACCACCATATCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTaaa < 2:1789641/149‑1 (MQ=255) ttttCTCTTTCGTTCAAAGAGAAGTTCTAATACCACCATATCGTGCGATCGGGAACGGTATATATCTTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATGAGCCTTCGACTTTGTTATATTGCTGTGTGGCCTAAAat > 2:931829/1‑149 (MQ=255) tttCTCTTTCGTTCAAAGAGAAGTTCTAATACCACCATATCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAata < 2:235945/149‑1 (MQ=255) tttCTCTTTCGTTCAAAGAGAAGTTCTAATACCACCATATCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAata > 1:1883421/1‑149 (MQ=255) tctcTTTCGTTCAAAGAGAAGTTCTAATACCACCATATCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATAtt < 2:642290/149‑1 (MQ=255) tctcTTTCGTTCAAAGAGAAGTTCTAATACCACCATATCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTGAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATAtt < 1:1295914/149‑1 (MQ=255) tctTTCGTTCAAAGAGAAGTTCTAATACCACCCTATCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATAACTTCCAAGGAAGATATGGGACTCTTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTgg < 2:423308/149‑1 (MQ=255) tctTTCGTTCAAAGAGAAGTTCTAATACCACCATATCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTgg > 1:297138/1‑149 (MQ=255) tctTTCGTTCAAAGAGAAGTTCTAATACCACCATATCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTgg < 2:677954/149‑1 (MQ=255) tctTTCGGCCTAGGAGAAGTTCGAATACCCCCATACCGTACGATCGGGAACGGTATATGTCTTAATCGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGCTGATGTGTGGCCTAAAATATTgg < 1:1026749/149‑1 (MQ=255) aaaaaaaaaGTTCTAATACCATCATATCGTGCGATCTGAAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATTTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGgagtccttga < 2:1741262/142‑8 (MQ=255) aaGAGAAGTTCTAATACCACCATATCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGCTATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGGGCTActactg > 2:1487592/1‑144 (MQ=255) agaAGTTCTAATACCACCATATCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATAttt > 1:1773668/1‑149 (MQ=255) tCTAATACCACCATATCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGtt > 1:1683459/1‑149 (MQ=255) tCTAATACCACCATATCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGtt > 1:1075040/1‑149 (MQ=255) tCTAATACCACCATATCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCAACTTGGTTATGTTGCTGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGtt > 1:1252659/1‑149 (MQ=255) tAATACCCACATATCGGGCGATCGGGAACGGTATATATATTGATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGc < 2:5183/149‑1 (MQ=255) aaTACCACCATATCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGca < 1:1929743/149‑1 (MQ=255) tACCACCATATCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGcatc > 1:853697/1‑149 (MQ=255) tACCACCATATCATGCGATCGGTAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGcatc > 2:1678125/1‑149 (MQ=255) ccagcaTATCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGcatcaa < 2:1459730/149‑1 (MQ=255) ccaccaAACCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGcatcaa < 1:476480/149‑1 (MQ=255) ccaTACCGTGCGAACAAGAACGCTATATATAATAAAAGGAGGGTAATATACATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGcatcaacat < 2:801615/149‑1 (MQ=255) atatCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGcatcaacatca < 1:1810030/149‑1 (MQ=255) atagCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGcatcaacatca < 1:920928/149‑1 (MQ=255) aatCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGcatcaacatcaa < 2:1894606/148‑1 (MQ=255) tCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGGCTATTAGCCTTCGACTTTGTTTTGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATAACAATATTTTAAGTTGAGTCAACATCAAtt > 1:1413944/1‑149 (MQ=255) tCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAAtt > 2:648784/1‑149 (MQ=255) cGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTc > 2:82469/1‑149 (MQ=255) aTCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTa < 2:853697/149‑1 (MQ=255) ggAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTc > 1:195282/1‑149 (MQ=255) ggAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATAGATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTc < 2:696675/149‑1 (MQ=255) gTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTaaa < 2:297138/149‑1 (MQ=255) atTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCTTTAAAACACAGCg > 1:639551/1‑149 (MQ=255) ttAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCgt < 1:494680/149‑1 (MQ=255) tAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCACTTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCgtg > 1:1764317/1‑149 (MQ=255) tAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCgtg > 2:9464/1‑149 (MQ=255) aaTAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCgtgt > 2:1625775/1‑149 (MQ=255) aTAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGtt > 2:1470209/1‑149 (MQ=255) aTAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGtt > 1:513999/1‑149 (MQ=255) aTAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGGGtt > 2:1632866/1‑149 (MQ=255) gaggGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGGAGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTTATCTTACTTCATTAAAAGACAGAGTGTTAttt > 2:222258/1‑149 (MQ=255) gaggGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTAttt > 1:792522/1‑149 (MQ=255) gaggGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTAttt > 1:674684/1‑149 (MQ=255) gaggGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTAttt > 1:1708318/1‑149 (MQ=255) gaggGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTAttt > 2:1633745/1‑149 (MQ=255) gaggGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGGGTTAttt > 1:1530925/1‑149 (MQ=255) aggGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTc < 2:1508563/149‑1 (MQ=255) aggGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTc > 2:1233057/1‑149 (MQ=255) aggGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTc > 1:202876/1‑149 (MQ=255) aggGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTc > 1:1510993/1‑149 (MQ=255) tatatatTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACAAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCAttcttc > 2:398184/1‑149 (MQ=255) tatatTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCg < 1:298823/149‑1 (MQ=255) atatTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCgt < 1:392871/149‑1 (MQ=255) atatTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCgt < 1:1165363/149‑1 (MQ=255) tttAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTa > 1:32478/1‑149 (MQ=255) ttAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTAc > 2:579560/1‑149 (MQ=255) ttAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTAc > 2:1330218/1‑149 (MQ=255) ttAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTAc > 1:1648142/1‑149 (MQ=255) ttAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTAc > 2:482646/1‑149 (MQ=255) ttAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTAc > 1:1726942/1‑149 (MQ=255) ttAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACAGCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTAc > 2:1101323/1‑149 (MQ=255) ttAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAAAATCAATTCATCTTACTTAATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTTTAc > 2:1357460/1‑149 (MQ=255) aaCGCAGGATATGGTACTATTAGCCTTCGAATTTGTTATGTTGATGTGTCGCCTAAAATATTGGATATACCAATATTTTAGTTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAg < 2:35789/149‑1 (MQ=255) aaCGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCCTTAAAAAACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCgttgacat > 1:593354/1‑143 (MQ=255) aaCGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTCCAg > 2:115113/1‑149 (MQ=255) aCGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGt > 2:1206202/1‑149 (MQ=255) aCGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTAGACTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGAGTGTTATTTTATGCTTCCGTGTTCAGt > 2:1301292/1‑149 (MQ=255) cGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGtt > 1:1119827/1‑149 (MQ=255) tcACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGttt < 2:1186125/148‑1 (MQ=255) gCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGttt > 1:1633682/1‑149 (MQ=255) cACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGTTTc > 2:1020830/1‑149 (MQ=255) cACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGACCTAAAATATTGGAGATACCAAAATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCAACTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATATCATGCTTCCGTGTACAGttgc > 2:1551510/1‑147 (MQ=255) cACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACCTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGTTTc > 1:1495065/1‑149 (MQ=255) gcGATATGCGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCGAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACAACAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGTTTCa < 2:848122/148‑1 (MQ=255) aCGATCTCGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGTTTCa < 1:135275/149‑1 (MQ=255) aCGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGTTTCa < 2:1013125/149‑1 (MQ=255) cGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCCTTAAAACATTGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGTTTCaa < 1:1470209/149‑1 (MQ=255) gggACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTGGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTCCTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTTTACAGTTTCAATATTTg > 1:218541/1‑149 (MQ=255) ggACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGTTTCAATATTTGa > 1:1849092/1‑149 (MQ=255) ggACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTATAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGTTTCAATATTTGa > 1:1849117/1‑149 (MQ=255) gACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGTTTCAATATTTGAt > 2:185079/1‑149 (MQ=255) aTTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTCAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGTTTCAATATTTGATTtca > 1:1268728/1‑149 (MQ=255) aTTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGTTTCAATATTTGATTtca > 1:456569/1‑149 (MQ=255) aGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGTTTCAATATTTGATTtcatca < 1:1590981/149‑1 (MQ=255) gCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGTTTCAATATTTGATTTcatgat > 2:337285/1‑149 (MQ=255) ccTTGGACTTTGGTATGTTTATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTGCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGTTTCAATATTTGATTTCATCAtt < 2:843109/149‑1 (MQ=255) ccTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGTTTCAATATTTGATTTCATCAtt > 1:711138/1‑149 (MQ=255) cTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGTTTCAATATTTGATTTCATCAttt < 1:1554412/149‑1 (MQ=255) tCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGTTGCAATATTTGATTTCATCATTTTg < 1:1004143/149‑1 (MQ=255) aCTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGTTTCAATATTTGATTTCATCATTTTgtag < 1:579560/149‑1 (MQ=255) tttGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGTTTCAATATTTGATTTCATCATTTTgtagta > 2:1606499/1‑149 (MQ=255) ttGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCTTGTACAGTTCCACTATTAGCTTTCATCActtttttgaaa > 2:1886123/1‑142 (MQ=255) tATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCGATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGTTTCAATATTTGATTTCATCATTTTGTAGTAAGAGt > 1:65652/1‑149 (MQ=255) | AACTGCATAAGAACTTCTAGCTTTTCTCTTTCGTTCAAAGAGAAGTTCTAATACCACCATATCGTGCGATCGGGAACGGTATATATATTAATAGGAGGGTAATATATATTTAACGCACGATATGGGACTATTAGCCTTCGACTTTGTTATGTTGATGTGTGGCCTAAAATATTGGAGATACCAATATTTTAGGTTGCATCAACATCAATTCATCTTACTTCATTAAAACACAGCGTGTTATTTCATGCTTCCGTGTACAGTTTCAATATTTGATTTCATCATTTTGTAGTAAGAGT > CP000730/705173‑705468 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |