| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 707,879 | A→T | L11I (TTA→ATA) | mntB ← | ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 707,879 | 0 | A | T | 99.4% | 552.9 / NA | 181 | L11I (TTA→ATA) | mntB | ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); major base T (82/96); minor base C (0/1); total (83/98) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.78e-01 | |||||||||||
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
CAATTTAGTACCGGTAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGG > CP000730/707733‑708023 | cAATTTAGTACCGGTAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTataa > 2:109810/1‑149 (MQ=255) aaTTTAGTACCGGTAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTataaa > 2:1868349/1‑149 (MQ=255) tAGTACCGGTAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATACGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATCATTTCGCCGCGTACTGGGATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGa > 2:970359/1‑149 (MQ=255) aGTACCGGTAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATCACAGTTATTTCGCCGCGTACTGGTAGCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAAAAGaa > 2:785705/1‑148 (MQ=255) aGTACCGGTAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGAt < 1:1514795/149‑1 (MQ=255) aGTACCGGTAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGAt > 1:1574319/1‑149 (MQ=255) aGTACCGGTAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGAt < 1:1560196/149‑1 (MQ=255) gTACCGGTAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGAtt > 2:569402/1‑149 (MQ=255) tACCGGTAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGAttt > 2:1133134/1‑149 (MQ=255) tACCGGTAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGAttt > 1:1328668/1‑149 (MQ=255) cgttAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTaaa < 1:910795/146‑1 (MQ=255) cGGTAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATCAGAGAACAGTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTaaa > 2:339451/1‑149 (MQ=255) cGGTAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAAAAGATTTagc > 2:494126/1‑147 (MQ=255) cGGTAGCATTAAATTCACCAAGTAAAGACTTCATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACACGCTTATTACCTATAAACAGATTTaaa < 2:414250/149‑1 (MQ=255) gTAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATGCCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAGAAACGGATTTAGATc > 1:904281/1‑149 (MQ=255) gTAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATc > 1:268602/1‑149 (MQ=255) tAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCt < 1:1784409/149‑1 (MQ=255) tAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCt > 1:182543/1‑149 (MQ=255) tAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCt > 1:1040353/1‑149 (MQ=255) tAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATGACCTATGAACGGATTTAAATCt > 1:361905/1‑149 (MQ=255) gtaTTAAATCCCCCAATTAAGGACTTGATAAGGGAAGATCTACCAGGACCATTCGGGCCCAGGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGCATATGTTTATTACCTCTATACAGATTTCAATCttt < 2:1533123/147‑1 (MQ=255) gaTTAGATTAATCAATTAAAGTCTTGATAAGGGAAGATTTTCCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTATTTGTAGCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCtttt < 2:1364447/148‑1 (MQ=255) ttAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTGGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGt > 1:766863/1‑149 (MQ=255) aTTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCt > 1:1154428/1‑149 (MQ=255) aTTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTAACAGCACCATTCGGGCCCATGATACAAATGATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTATGTACATGCTTATTACCTATAGACAGATTTAACTTTTTTGTTTCt > 1:962830/1‑149 (MQ=255) aTTAAAGACTTGATAAGGGAAGACTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAACTCTTTTGTTTCTAACAAACg > 1:1481611/1‑149 (MQ=255) tAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGtt < 1:1371170/149‑1 (MQ=255) aaGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTta > 1:1682658/1‑149 (MQ=255) aaGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTta > 2:805751/1‑149 (MQ=255) aGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTtat > 2:1744798/1‑149 (MQ=255) gACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCGGATGTTACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGCTTTAAATCTTTTGTTTCTAACAGACGTTtata > 2:916850/1‑149 (MQ=255) cTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATAcc < 2:1184727/149‑1 (MQ=255) aGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAAt > 1:829925/1‑149 (MQ=255) ggAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTa < 1:1227331/149‑1 (MQ=255) aaGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTaaa > 2:1990246/1‑149 (MQ=255) ttACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGttt > 1:1886676/1‑149 (MQ=255) ttACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGttt > 1:1123489/1‑149 (MQ=255) tACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTa > 2:637752/1‑149 (MQ=255) tACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTa < 1:109810/149‑1 (MQ=255) caCCAGCCTCATTCGGGCCCATGATGCCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTa < 2:984350/148‑1 (MQ=255) aCCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAg < 1:896137/149‑1 (MQ=255) aCCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGCATCGATGAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAg > 2:1299437/1‑149 (MQ=255) cAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGc > 2:1691676/1‑149 (MQ=255) ccAGTCGGGCCCATGATACAAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAAcc < 2:1353530/149‑1 (MQ=255) gCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCtaattaat < 1:339099/149‑1 (MQ=255) ccccTGATTCCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGGTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACTTTTATACCTCCTAATTAAGAGTTTAGGCTAACCTaattaatt < 2:992287/149‑1 (MQ=255) cccATGATACCAATTTTTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTaattaatt < 2:1785528/149‑1 (MQ=255) aTGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGta < 1:494126/149‑1 (MQ=255) aTACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTataa < 2:1946710/149‑1 (MQ=255) ccAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTAtaataa > 2:1649692/1‑149 (MQ=255) cAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACTGATAAACAGCTTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGTCTAACCTAATTAATTTTGTAATaaa > 1:387024/1‑149 (MQ=255) cAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATaaa > 1:99623/1‑149 (MQ=255) attattTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTACATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTCATTAAAAGTTTAGGCTAACCTCATTCATTCTATAATaaaat > 2:64053/1‑147 (MQ=255) attattTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACt < 2:268602/149‑1 (MQ=255) attattTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACt < 1:677664/149‑1 (MQ=255) attattTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACt > 2:1948930/1‑149 (MQ=255) ttCGCCGAGTACTGGTAAAGAAAAGGAAATGTTTTTAAGGACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGaa < 2:388956/149‑1 (MQ=255) gcgccgcGTACTGGTATCGAGAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCGAACAATCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAACCTGAGAat < 2:4512/148‑1 (MQ=255) gTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAACCGTTTATACATAATAATTAGTGGTTTACGATAACCGAATTAATGGTATAATAAACTGAGAGTATTTATc > 2:905305/1‑149 (MQ=255) ggTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTc < 1:1203384/149‑1 (MQ=255) ggTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTc < 1:1637564/149‑1 (MQ=255) aaGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATTTTATGCTTTGTATATTTATCATGTCAAGTAAAtt < 1:970501/149‑1 (MQ=255) aaGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAAtt < 2:184538/149‑1 (MQ=255) ggAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCg > 2:1873233/1‑149 (MQ=255) ggAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCg > 2:1260203/1‑149 (MQ=255) ggAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCg < 1:981894/149‑1 (MQ=255) ggAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCg < 1:1864227/149‑1 (MQ=255) ggAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCg < 2:964098/149‑1 (MQ=255) ggAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCg < 1:1739271/149‑1 (MQ=255) ggAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCg < 1:1864409/149‑1 (MQ=255) ggAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATAATGTCAAGTAAAtttg > 1:420635/1‑147 (MQ=255) ggAAAGGTTTTTAAGGACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGTTATCCTAATTCCTTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCGTGTCAAGTAAATTCg < 2:1412745/149‑1 (MQ=255) aaTGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGa > 1:1945387/1‑149 (MQ=255) aaTGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGa < 2:682427/149‑1 (MQ=255) tGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGata < 2:1072608/149‑1 (MQ=255) gTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTGATTGTATATTAAACTTAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGagaa > 2:83144/1‑146 (MQ=255) gTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGatat > 1:786631/1‑149 (MQ=255) ttttAAGTACTTGTTTATTACCTATAAACAGCTTTATATCGAATATGTGCCACAAACGTTTATACCCCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAAAATCTTTATCATGTCAAGTAAATTCGGGatataa < 2:904281/149‑1 (MQ=255) tttAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTGTCAGGTCAAGTAAATTCGTGatataat > 1:152584/1‑149 (MQ=255) tttAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTACATTCGTGatataat > 1:1054241/1‑149 (MQ=255) tttAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGAAAATTCGAGatataaa > 2:289336/1‑148 (MQ=255) tttAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCGAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGatataat < 1:1324272/149‑1 (MQ=255) aGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTATCTTCGTGATATAATATAg < 1:1466484/149‑1 (MQ=255) gTACATTCTTATTACGTATAAACAGATTTAAATCTTTCGTTTCCAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTCTATAATAAAATGAGAATATTTATCATGTCAAGTCAATTCGTGATATAATATAGa < 1:1410558/149‑1 (MQ=255) atacgagCTCATTACCTAAAAAAAGATTTAAATCTTTTTTTTAGAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTCGTCTAACCTATTTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGa < 1:795965/143‑1 (MQ=255) tACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGAc > 2:157388/1‑149 (MQ=255) tACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAACTCGTGAGATAAGATAGaa > 1:211122/1‑148 (MQ=255) aTGCTTATTACCTATAAACAGATTTACATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTTATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAat < 1:1223345/149‑1 (MQ=255) aTGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAat < 1:279551/149‑1 (MQ=255) aTGCCTATAACGTACAAAAACATTTAAATTTTTTTTTTCTAACAAACGTTTACACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTATCCTAATTAATTGTATATTAGACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAat < 2:281930/149‑1 (MQ=255) tcTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCGAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAatgt < 1:648872/148‑1 (MQ=255) gCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTACCAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAatgt < 1:491161/149‑1 (MQ=255) gCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTGTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAatgt < 2:1201343/149‑1 (MQ=255) ttattaCCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAatgtat < 2:154087/149‑1 (MQ=255) ttattaCCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAatgtat < 1:9562/149‑1 (MQ=255) taCCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGa < 1:1597142/149‑1 (MQ=255) aCCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAg > 2:1895866/1‑149 (MQ=255) aCCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAg > 1:1800937/1‑149 (MQ=255) ccTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAACTTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTgggg > 1:292965/1‑149 (MQ=255) ccTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAgg > 2:1387559/1‑149 (MQ=255) | CAATTTAGTACCGGTAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGG > CP000730/707733‑708023 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |