| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,232,465 | G→C | A124P (GCG→CCG) | prkC → | non‑specific serine/threonine protein kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,232,465 | 0 | G | C | 98.7% | 529.6 / NA | 161 | A124P (GCG→CCG) | prkC | non‑specific serine/threonine protein kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); major base C (80/75); minor base T (1/1); total (83/78) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
AAGAAGATGACTGTTACTACTTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATGCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCTTTAACTCAGACTAATCATGTGT > CP000730/1232328‑1232603 | aagaagATTACTGTTAATACGTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGGCTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATAGCATTAAACATCCGCATGATATg < 1:1482331/149‑1 (MQ=255) gaagaTGACTGTTACTACTTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCg < 2:865360/149‑1 (MQ=255) gaagaTGACTGTTACTACTTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCg > 1:1110352/1‑149 (MQ=255) aagaTGACTGTTACTACTTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGt > 1:255683/1‑149 (MQ=255) aagaTGACTGTTACTACTTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGt > 1:1832573/1‑149 (MQ=255) agaTGACTATTACTACTTAATAATGGAATATAGCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCACTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTa < 1:737428/149‑1 (MQ=255) aaggACTGTTACTACTTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTGTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTAt < 2:963349/146‑1 (MQ=255) ttaCTGTTACTACACAATAATGAAAAAAATCAAAGGTTCGACTTTGTCGGAATATATTGAAAGTCATGGGCCATTAATTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTg < 1:246902/147‑1 (MQ=255) tGACTGTTAACACTAAGTAATGGAATAAATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTg < 1:617716/149‑1 (MQ=255) gACTGTTACTACTTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGt < 1:1306676/149‑1 (MQ=255) acttgtactaaTTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTa < 2:1641000/144‑1 (MQ=255) aCTGTTACTACTTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTa < 2:1081390/149‑1 (MQ=255) tttACTACTTAGTAATGAAATAAATCGAAGGTACAACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCACGGGCCATTAAGTTTTGACACAGTGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACAt < 1:767308/148‑1 (MQ=255) ttACTACTTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCTAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATa < 1:1888785/149‑1 (MQ=255) ctactTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATagag > 1:832405/1‑149 (MQ=255) ctactTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATACGCATGATATGCGTATTGTACACagaa > 2:1898719/1‑148 (MQ=255) ctactTAGTAATAGAATATACCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGACATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTAGATGGGATTAAACATCCGCATGATATGAGTATTGTACATagag > 1:1411376/1‑149 (MQ=255) tactTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATAGTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAgaga > 1:283196/1‑149 (MQ=255) ctTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGata > 1:1772768/1‑149 (MQ=255) ttAGTAATGTAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCCGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGatat < 1:156574/149‑1 (MQ=255) ttAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGatat > 2:1037340/1‑149 (MQ=255) ttAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGACAGGGGGCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGatat > 1:1374323/1‑149 (MQ=255) gaaTGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAg < 2:1564728/148‑1 (MQ=255) aaTGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGc > 1:1672611/1‑149 (MQ=255) aTGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGcc < 2:1212241/149‑1 (MQ=255) aTGCAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGcc < 2:1345148/149‑1 (MQ=255) ggAATCTATCGAAGGCCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCTCGGGCGGCACAGCGATGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCcac < 1:57977/149‑1 (MQ=255) ggAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATGAGGGTATTAAACcac > 2:866871/1‑149 (MQ=255) ggAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCcac > 2:1185137/1‑149 (MQ=255) ggAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTAAGTATATTGAAAGTCATGGGCCAATAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGCTGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTAAATAGGGATATTAAGCcac > 2:1098105/1‑149 (MQ=255) ggAATAAATCGAAGCTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATGTTACGAATCAAATATGGGATGGCATTAAACAGCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCcac < 2:1957550/149‑1 (MQ=255) gAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCCTGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCcaca > 1:1108425/1‑149 (MQ=255) gAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGACATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCcaca > 1:1334679/1‑149 (MQ=255) gAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAACTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCcaca > 2:1293058/1‑149 (MQ=255) aaTATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTAGATAGAGATATGAAGCCACaa > 1:925307/1‑149 (MQ=255) aaTATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGGTATTAAGCCACaa > 2:1851446/1‑149 (MQ=255) atatatCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCGTTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACaaa > 1:1233373/1‑149 (MQ=255) atatatCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACaaa < 1:1235144/149‑1 (MQ=255) atatatCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACaaa > 1:17541/1‑149 (MQ=255) tatCGAAGGTCCTACTTTTTCTGAGTATATGGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGATACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAata < 2:1712686/149‑1 (MQ=255) tatCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAata < 2:611690/149‑1 (MQ=255) tCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAatata < 1:212895/149‑1 (MQ=255) tCGAAAGTCTCACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCCATCAGTGCTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGCGAGTCTGGAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAatata < 1:1159562/149‑1 (MQ=255) cGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCGATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAatatat > 2:1319368/1‑149 (MQ=255) cGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAatatat > 1:105314/1‑149 (MQ=255) aaGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTa > 2:301396/1‑149 (MQ=255) cGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACCTCGAGATATTAGGCCACAAAATATATTAATTGAc > 1:1802681/1‑149 (MQ=255) aCTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAg < 2:556934/149‑1 (MQ=255) ttGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGCTATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACacaca > 2:305071/1‑145 (MQ=255) gTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATCGGGAGACTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATa < 1:1986436/149‑1 (MQ=255) tCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCTAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATaa > 2:1219924/1‑149 (MQ=255) tCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATaa < 2:1719236/149‑1 (MQ=255) aGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACg > 2:1855317/1‑149 (MQ=255) atatTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATGTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTg < 2:366700/149‑1 (MQ=255) atTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGaa > 1:209172/1‑149 (MQ=255) ttGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGaaa > 2:1970479/1‑149 (MQ=255) tGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAGATATTGGATGGCATTAAACCTCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAGACGTTGaaaa > 2:1685000/1‑149 (MQ=255) tGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGaaaa < 1:1602168/149‑1 (MQ=255) tGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGaaaa > 1:232444/1‑149 (MQ=255) gAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGaaaaa > 1:1284493/1‑148 (MQ=255) gAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTAGTGTACATAGAGAAATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTTAAAat > 1:1489118/1‑149 (MQ=255) aaaGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGaaaaaa > 2:33468/1‑147 (MQ=255) aaGTCATGGGCCATTAAGAGTGAACACAGCGATAAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAatat < 1:493976/149‑1 (MQ=255) aGTCAAGGGCCAATAAGTGTTGCCACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATGCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATAtt < 2:96753/149‑1 (MQ=255) gCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGCTGGCATTAAACATCCGCATGATCTGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTg > 2:961523/1‑149 (MQ=255) gCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTg > 2:1163526/1‑149 (MQ=255) aaGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTg < 2:1574604/149‑1 (MQ=255) aaGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTg < 2:592901/149‑1 (MQ=255) aaGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTg < 1:1727248/149‑1 (MQ=255) aaGTGTTGACACAGCGATTAAGTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAACATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTg < 2:1000206/149‑1 (MQ=255) attgtTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGc < 2:508413/147‑1 (MQ=255) gtgtTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCt > 1:1863234/1‑149 (MQ=255) gtTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATGTATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGCTTTTGGAATTGCTaa > 2:1589982/1‑149 (MQ=255) ttGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTaaa > 1:530612/1‑149 (MQ=255) ttGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTaaa < 2:1772768/149‑1 (MQ=255) gcatagtgATTAATGTTACGAATTAAATATTGGATGGCATGAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGTTATGAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCt < 2:266066/142‑1 (MQ=255) gcacaGCGATTAACTTTACGAATCAAATATTGGATTGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACCTAGAGATATTTCTTTACAATATATATTATGTATCAGCGATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCt < 2:911060/148‑1 (MQ=255) acacAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCt < 2:1148140/149‑1 (MQ=255) cacaGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCtt > 1:973344/1‑149 (MQ=255) cacaGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATAATCGACTTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAGAATAGTTGATTTGGGAGTTGCTAAAGCtt > 1:667628/1‑149 (MQ=255) aacaGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATATTGGAATTGCTAAAGCtt < 1:1451640/148‑1 (MQ=255) caGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTa < 2:1832573/149‑1 (MQ=255) ggATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGTCAGCAATAAAACGTTGAATATATTCGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGt < 1:1094507/148‑1 (MQ=255) ggaggagttgaCGAAGCAAATATGGGAGGGCATTAAACACCCGCATGATACGCGTATTGTACATAGATATATTAAGCCACAAAATATACTAATTGACAGCAATAACACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTg < 2:381299/139‑1 (MQ=255) gATTAATTTTACAAAGCAAATGTTGGATGGCATTAAACACTGGCATTATCCGAGTCCTCAAACGCGCTTTGTTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTg > 2:1411454/1‑149 (MQ=255) gATTAAGTTTACGAATCAAATATTGAAGGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCAAAAAATAAAATAATGGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTg < 2:227325/149‑1 (MQ=255) aTTAATTTTACGAATCAAATAGTGGATGGCACTAAACATCCCCATGATATGCGTATTGAACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTga < 2:1338989/149‑1 (MQ=255) tttACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTc > 2:498418/1‑149 (MQ=255) tCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCTTTAACTc < 2:1939380/149‑1 (MQ=255) tCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCTTTAACTc > 1:1188837/1‑149 (MQ=255) aaaTATTGGTTGGCATTAACAATTCGAATAATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCAAAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCTTTAACTCAg < 1:1510141/149‑1 (MQ=255) aaaTATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCTTTAACTCAg < 2:1755252/149‑1 (MQ=255) aaaTATTGGATGGCATTAAACATCAGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCTTTAACTCAg < 1:46803/149‑1 (MQ=255) tatTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCTTTAACTCAGACt > 2:1290494/1‑149 (MQ=255) tatTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCTTTAACTCAGACt > 1:406688/1‑149 (MQ=255) ggATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCTTTAACTCAGACTAATc > 1:117622/1‑149 (MQ=255) aTGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCTTTAACTCAGACTAATCAt > 1:916176/1‑149 (MQ=255) gCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCTTTAACTCACACTAATCAtgtg > 2:442449/1‑149 (MQ=255) gCATTAAACATCCGAATGATATGCGTATTGTACATAGAAATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCTTTAACTCAGACTAATCAtgtg < 2:268230/149‑1 (MQ=255) cATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAGTAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCTTTAACTCAGACTAATCATgtgt < 1:1831809/149‑1 (MQ=255) | AAGAAGATGACTGTTACTACTTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATGCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCTTTAACTCAGACTAATCATGTGT > CP000730/1232328‑1232603 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |