| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP000730 | 1,330,093 | T→A | G430G (GGT→GGA) | glpD → | glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 1,330,093 | 0 | T | A | 98.9% | 585.9 / ‑5.7 | 191 | G430G (GGT→GGA) | glpD | glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/2); major base A (105/82); minor base C (1/1); total (106/85) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.60e-01 | |||||||||||
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
TCAGGTTTATTAACTATTGCAGGTGGTAAATTAACAGGCTATCGTCACATGGCTCAAGACAT‑TGTTGATTTAGTATCTAAACGCTTGAAAAAAGACTACGGTTTAACATTTAGTCCATGTAATACAAAAGGTCTGGCAATTTCAGG‑TGGCGATGTAGGTGGTAGCAAGAACTTTGATGCGTTTGTAGAGCAAAAAGTAGATGTAGCTAAAGGATTCGGCATTGATGAAGATGTTGCAAGACGTTTAGCATCTAAATATGGTTCAAATGTTGATGAATTGTTCAACATTGCGC > CP000730/1329947‑1330238 | acAGGTTTATTAACTATTGCAGGTGGTAAATTAACAGGCTATCGTCACATGGCTCAAGACAT‑TGTTGATTTAGTATCTAAACGCTTGAAAAAAGACTACGGTTTAACATTTAGTCCATGTAATACAAAAGGTCTGGCAATTTCagg‑agg < 2:1025262/148‑1 (MQ=255) cAGGTTTATTAACTATTGCAGGTGGTAAATTAACAGGCTATCGTCACATGGCTCAAGACAT‑TGTTGATTTAGTATCTAAACGCTTGAAAAAAGACTACGGTTTAACATTTAGTCCATGTAATACAAAAGGTCTGGCAATTTCAGG‑AGGc < 1:158587/149‑1 (MQ=255) aGGTTTATTAACTATTGCAGGTGGTAAATTAACAGGCTATCGTCACATGGCTCAAGACAT‑TGTTGATTTAGTATCTAAACGCTTGAAAAAAGACTACGGTTTAACATTTAGTCCATGTAATACAAAAGGTCTGGCAATTTCAGG‑AGGCg < 2:1953559/149‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |