| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,416,458 | A→T | I216N (ATT→AAT) | oppD ← | oligopeptide ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,416,458 | 0 | A | T | 98.8% | 526.8 / NA | 166 | I216N (ATT→AAT) | oppD | oligopeptide ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base T (93/70); total (94/72) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
GTCACATGTTTTAACTCAATCATAGTAATCCCTCTTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAAATGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAATGATGCAACTGGTTCGTCTGCAAT > CP000730/1416313‑1416603 | ctcccaTGTTTTAACTCAATCATAGTAATCCCCCTTTAATTCTGTTATCTAATCCTTGACACGTTCAGTCTACGGACGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGt < 1:57171/145‑1 (MQ=255) ctGTTTTAACCCAATCATAGTACTCCCTCTTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGa < 1:1170661/148‑1 (MQ=255) gTTTTAACTCAATCATAATAATCCCTCTTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACCGATGCAAATGCTCATACTCGACATGATT‑AATATTACCTCGTTCACTGATTTGCCCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACa < 2:1944850/149‑1 (MQ=255) ttAACTCAATCATAGTAATCCCTCTTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAata > 2:1086864/1‑149 (MQ=255) aaCTCAATCATAGTAATCCCTCTTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATAtt < 1:1089277/149‑1 (MQ=255) aaCCCAATCAAAGTACTCCCTCTTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATAtt < 2:519028/149‑1 (MQ=255) aCTCAATCATAGTAATCCCTCTTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATAttt < 1:734676/149‑1 (MQ=255) cTCAATCATAGTAATCCCTCTTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTCTACTGACAGTAttgc > 2:1054982/1‑147 (MQ=255) tCAATCATAGTAATCCCTCTTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCa > 2:1125645/1‑149 (MQ=255) tCAATCATAGTAATCCCTCTTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTCCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAAATATCCTGACAATATTTCa > 2:554851/1‑149 (MQ=255) aTCATAGTAATCCCTCTTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AACATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATa < 1:1328779/149‑1 (MQ=255) cATAGTAATCCCTCTTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCCTCTTCCTTAACGTGATTGTACTGACAATATTTCAATACa < 1:480268/149‑1 (MQ=255) aTAGTAATCCCTCGTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCTATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACAt < 2:1024068/149‑1 (MQ=255) gTAATCCCTCTTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAAAGCATGaa > 2:1445698/1‑148 (MQ=255) gTAATACCTCTTTAATTGTGTTCTATATTGAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACGTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTGAATGATTGGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGAc > 1:1478447/1‑149 (MQ=255) tAATCCCTCTTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACt > 1:265017/1‑149 (MQ=255) aTCCCTCTTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATTCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTa > 2:1826517/1‑149 (MQ=255) tCCCTCTTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTaa > 1:1872614/1‑149 (MQ=255) tctTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTa > 1:1722522/1‑149 (MQ=255) tctTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTa > 1:416797/1‑149 (MQ=255) ctTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTAt > 2:1334478/1‑149 (MQ=255) tAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTAtg‑tg < 1:1808639/149‑1 (MQ=255) aTTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTAtg‑tgtg < 2:969891/149‑1 (MQ=255) aTTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTAtg‑tgtg < 1:587957/149‑1 (MQ=255) aTTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGAACCTGATTCTATATGGACTTATT‑AATAGTACCTCGTTCAATGATTTGATCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTAtg‑tgtg < 2:909912/149‑1 (MQ=255) gtTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑AGTGataat > 1:1311654/1‑149 (MQ=255) tCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGGCAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGAtaataa > 2:1016753/1‑149 (MQ=255) tCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGAtaataa > 1:1123248/1‑149 (MQ=255) tCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGAtaataa > 1:1536272/1‑149 (MQ=255) cTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATaataaa > 1:115477/1‑149 (MQ=255) cTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATaataaa > 1:633065/1‑149 (MQ=255) tataTTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATaataaat > 1:1973414/1‑149 (MQ=255) tataTTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATaataaat < 1:1840016/149‑1 (MQ=255) tataTTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATaataaat < 1:1604515/149‑1 (MQ=255) agtttaccttcaCGTGCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAACTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAataaataa < 2:1395703/138‑1 (MQ=255) atTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAGTGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGCTTTGGCCTTCTTTTAAAACATAATTGTCCTGACAATATTTCAATACCGTCCTTATGTAATA‑TGTGattctaatttat > 2:1663444/1‑139 (MQ=255) ttAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGt > 1:1750329/1‑149 (MQ=255) tAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGtt > 2:874056/1‑149 (MQ=255) tAATTAGACGTTCAAGATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGtt < 2:801022/149‑1 (MQ=255) aaTTAGACGTTCAGTAAACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGttt > 1:783693/1‑149 (MQ=255) aTTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTg < 1:1334939/149‑1 (MQ=255) aTTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTg < 1:107596/149‑1 (MQ=255) ttAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGa < 1:1590812/149‑1 (MQ=255) tAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGAc > 1:1023225/1‑149 (MQ=255) gACGTTCAGTATACGGATGCAAGTGCTCAGACTTGAAATGATTAAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATTATTGTACTGACAATATTTCAATACATGGATTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGAcc > 2:1371070/1‑149 (MQ=255) gACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCa > 1:832106/1‑149 (MQ=255) gACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACATGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCa > 1:1458400/1‑149 (MQ=255) aCGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCAt > 2:735311/1‑149 (MQ=255) aCGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGCACGGACAAAACGTCAAGACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCAt > 2:909431/1‑149 (MQ=255) ttCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTTACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCAGGtt > 1:385123/1‑149 (MQ=255) ccgTATACGGATGCAAAGGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCt < 1:30066/147‑1 (MQ=255) gTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTaa < 1:508081/149‑1 (MQ=255) ataCGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATa > 2:1883701/1‑149 (MQ=255) cGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGATTTAAGTTATGCTGT‑TTAAGGATTTATGTTTGACAATGTTTTAATACaa > 1:49043/1‑149 (MQ=255) ggATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAat > 2:140485/1‑149 (MQ=255) gATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCGATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGGTATG‑TGTGATAATAAATACTGTTTGACCACGTTCTAATAccaag > 1:844266/1‑145 (MQ=255) gATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAata > 1:1243170/1‑149 (MQ=255) gCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGc < 1:201998/149‑1 (MQ=255) tGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGtaa < 2:728668/149‑1 (MQ=255) cgCTCATCCATGAAATGAAT‑AACATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGtaa < 2:1178170/148‑1 (MQ=255) cTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGCTAAAATATAATATGTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGtaata > 1:857952/1‑149 (MQ=255) cATACTTGAGATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATaaa < 2:1084826/149‑1 (MQ=255) aTACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTTACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAAt < 2:59226/149‑1 (MQ=255) aTACTTGAAATGATA‑AAGATTACCGCGTTCAATGAATTGATCATCTTTTAAAACATAAATGTACTGAAAAAATTTGAATAGAAATCAAAAAAAAAT‑GGAGATACTAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAAAAAAt < 2:226578/149‑1 (MQ=255) aaaTGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCAc < 2:30322/149‑1 (MQ=255) aTGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTCATAAATCCATCACtt > 1:81351/1‑149 (MQ=255) aTGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACtt > 2:1734441/1‑149 (MQ=255) tt‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGAtt < 1:874056/149‑1 (MQ=255) tatTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCg > 1:1245339/1‑149 (MQ=255) ttACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGtt > 2:612497/1‑149 (MQ=255) tACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTc < 1:1179559/149‑1 (MQ=255) tACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTc > 1:1703118/1‑149 (MQ=255) tACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTc < 1:1302032/149‑1 (MQ=255) tACCTCGTTCAATGATTTGACCATCTTGTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTc > 1:1101561/1‑149 (MQ=255) ccTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACTTGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTATCGttgcc > 2:493838/1‑146 (MQ=255) ccTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATTTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCaa < 2:1556468/149‑1 (MQ=255) ccTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGCTTCCCGTTCaa > 1:358321/1‑149 (MQ=255) ccTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGCTTACCGTTCaa > 1:883777/1‑149 (MQ=255) cTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCaaa > 2:1135132/1‑149 (MQ=255) gTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACACTATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTGCCGTTCAAAGCa > 1:1754989/1‑149 (MQ=255) gTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCa > 1:1682479/1‑149 (MQ=255) tGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAat < 2:1144965/149‑1 (MQ=255) tGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAat < 2:1691804/149‑1 (MQ=255) tGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTCCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAat < 1:1886906/149‑1 (MQ=255) aTTTGATTTTTTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTATTACAATATGTTGTAGTAATTTCATACTTTGATTACCGTTCAAAGTTTCCAatgt > 2:341653/1‑148 (MQ=255) aTTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATACTAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAatga > 1:274396/1‑149 (MQ=255) aTTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAatga > 2:601831/1‑149 (MQ=255) aTTTGACCTTCTTTTAAAACATAATAGAAAAGCCATGGTTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAatga > 2:431766/1‑149 (MQ=255) gACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACACTATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAATGATGCa > 2:747872/1‑149 (MQ=255) gACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAATGATGCa > 2:274869/1‑149 (MQ=255) tcttTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAATGATGCAACTgg > 2:371766/1‑149 (MQ=255) tcttTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAATGATGCAACTgg > 2:1161836/1‑149 (MQ=255) tcttTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTGATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAATGAGGCAACTgg > 2:647712/1‑149 (MQ=255) ttttAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAATGATGCAACTGGtt < 2:1973414/149‑1 (MQ=255) ttAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTCATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAATGATGCAACTGGTTCg > 2:1970400/1‑149 (MQ=255) ttAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAATGTTGCAACTGGTTCg > 1:584459/1‑149 (MQ=255) ttAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAATGATGCAACTGGTTCg > 2:1556723/1‑149 (MQ=255) aaaCATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAATGATGCAACTGGTTCGTCt < 2:857360/149‑1 (MQ=255) aaaCATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAATGATGCAACTGGTTCGTCt < 2:1602798/149‑1 (MQ=255) tAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTGCAAAGCATCCAATGATGCAACTGGTTCGTCTGCAAt < 1:1271559/149‑1 (MQ=255) | GTCACATGTTTTAACTCAATCATAGTAATCCCTCTTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATT‑AATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAAATGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATG‑TGTGATAATAAATAATGTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAATGATGCAACTGGTTCGTCTGCAAT > CP000730/1416313‑1416603 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |