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Only 100 of 430 total aligned reads displayed.
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(MQ=35) aTCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGACCGAAGTTTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGACGAAAAAGCATa‑aaa < 1:199964/141‑1 (MQ=11) cTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATa‑aaaaa > 2:155894/1‑140 (MQ=21) tAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATa‑aaaaag < 1:370072/141‑3 (MQ=21) tAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATa‑aaaaag > 1:152673/1‑139 (MQ=255) aGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATATGGAAGAAAAAGCATa‑aaaaagct > 1:362020/1‑137 (MQ=11) aatatGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATa‑aaaaagctt < 2:236028/140‑6 (MQ=11) atatGCATTGAGCTATCTTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATa‑aaaaagctta < 1:9284/141‑7 (MQ=11) agctATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAAAGTTCATCATTCACCGATCTACCGTTGGGTTCAAGACTATGCCACAATTTTATATCAAATATGGAAGAGACAGCATAGAAAAGCTCATTAAAAATgg > 2:11005/4‑141 (MQ=1) gTGATATAGCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATA‑AAAAGCTAATTACAAATGGCGTATtga < 1:42141/141‑1 (MQ=255) | ATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATA‑AAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAA > CP000730/76182‑76462 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |