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aTTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAA‑AAAGCAT‑A‑AAAAGCTAATTACaaa > 2:300365/1‑141 (MQ=39) tGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAA‑AAAGCAT‑A‑AAAAGCTAATTACAAATg > 1:109112/1‑141 (MQ=38) agctATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAAAGTTCATCATTCACCGATCTACCGTTGGGTTCAAGACTATGCCACAATTTTATATCAAATATGGAAGAG‑ACAGCAT‑AGAAAAGCTCATTAAAAATgg > 2:11005/4‑141 (MQ=1) gctatatCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAA‑AAAGCAT‑A‑AAAAGCTAATTACAAATGGCGTATtgatg > 2:45668/3‑141 (MQ=39) aaGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCACTTTTATATCAAATTTGGAAGAACCACACCA‑A‑AAAAGCAAATTACACATGATGTAAAGATTAGACGTACATCAAAAt > 1:276165/1‑141 (MQ=11) ggAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAA‑AAAGCAT‑A‑AAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATaaaa < 1:231594/141‑1 (MQ=40) gaCGTGGTGTAAACGTTCAGCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGACTATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAACAA‑AGAGCAA‑A‑AAAAGCTAATTACAAATGGCGGATTGAGGAGACGTACATCAAGAGAAAAgg < 2:145259/140‑1 (MQ=11) aCGTGGTCTAAACGTTCATCATTCAGCGCTCTACCGTTGGGTTTAAGAATATGCGCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAA‑AAAGCATAA‑AAAAGCTAATTACAAATGGCGGTTTGATGAGACGTATATCAAAATAAAAgg < 2:181612/141‑1 (MQ=1) atcatTCAACGGACTACCGTTGGGTTGCCGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAA‑AAAGCAT‑A‑AAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATGGAGCTATTtata > 2:350702/1‑141 (MQ=255) cGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAA‑AAAGCAT‑A‑AAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATGGAGCTATTTATATCGTGCCAt > 1:362244/1‑141 (MQ=40) | GTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAA‑AAAGCAT‑A‑AAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATGGAGCTATTTATATCGTGCCAT > CP000730/76213‑76491 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |