BRESEQ :: Evidence

New junction evidence
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*	?	CP000730	512620 =	102 (0.950)	69 (0.900) +TTATCTTGTCCATTTTATTTTTTAACCAAAATTTGATTAA	47/200	0.4	48.7%	intergenic (+688/‑173)	recR/rrs1	recombination protein RecR/16S ribosomal RNA
*	?	CP000730	1998278 =	NA (NA)	69 (0.900) +TTATCTTGTCCATTTTATTTTTTAACCAAAATTTGATTAA	47/200	0.4	48.7%	intergenic (‑6/+5)	USA300HOU_t0050/rrf4	tRNA‑Val/5S ribosomal RNA

Only 100 of 215 total aligned reads displayed.

AGGGCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTAT  >  CP000730/512480‑512759

gtcacacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttaccgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaa                                                                                                                                             <  2:883557‑M1/1‑1 (MQ=255)

  cacacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaaaa                                                                                                                                           <  1:452944‑M1/3‑1 (MQ=255)

   gCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTaaaa                                                                                                                                          <  1:75251/141‑1 (MQ=255)

    cacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaaaaaa                                                                                                                                         <  2:183414‑M1/5‑1 (MQ=255)

         aGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTAt                                                                                                                                    <  2:1047677/141‑1 (MQ=255)

          ttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTAtt                                                                                                                                   >  1:1082331‑M1/131‑141 (MQ=255)

           tcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatgatagccgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTg                                                                                                                                  <  1:526334‑M1/12‑1 (MQ=255)

           tACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTg                                                                                                                                  >  2:967043/1‑141 (MQ=255)

           tACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTg                                                                                                                                  >  1:396/1‑141 (MQ=255)

            aCAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGTCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGa                                                                                                                                 <  1:1014624/141‑1 (MQ=255)

            aCAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGa                                                                                                                                 >  2:327441/1‑141 (MQ=255)

             ccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGAc                                                                                                                                >  1:469123‑M1/128‑141 (MQ=255)

                  ccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTaaa                                                                                                                           <  1:51122‑M1/19‑1 (MQ=255)

                   aCAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAAt                                                                                                                          >  2:402578/1‑141 (MQ=255)

                    cAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATg                                                                                                                         >  1:561149/1‑141 (MQ=255)

                     aatacagaagttaagcttcttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGt                                                                                                                        >  2:153578‑M1/120‑141 (MQ=255)

                     aacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGt                                                                                                                        >  1:663396‑M1/120‑141 (MQ=255)

                     aaaGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAACTGt                                                                                                                        >  2:454741/1‑141 (MQ=255)

                       aGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTta                                                                                                                      >  2:1083250/1‑141 (MQ=255)

                         gtgtAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTtaat                                                                                                                    <  1:60868/141‑1 (MQ=255)

                         gtgtAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTtaat                                                                                                                    <  2:135188/141‑1 (MQ=255)

                         cagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAatgttgat                                                                                                                    <  1:42196‑M1/26‑4 (MQ=255)

                           ttAATTTTTACTGTTGTAAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTtaataa                                                                                                                  <  2:48886/140‑1 (MQ=255)

                           gtAATTTTTACTGTTGTTAAGCGGGTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAAAGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTtaataa                                                                                                                  >  2:856976/1‑141 (MQ=255)

                           gcggtggaggtccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTtgataa                                                                                                                  >  2:897040‑M1/114‑141 (MQ=255)

                             agttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttcagctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaACAAAGTTATTGACTTAAAtgttgatagaa                                                                                                                <  2:409434‑M1/30‑4 (MQ=255)

                               tttgtACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATg                                                                                                              <  1:458677/141‑1 (MQ=255)

                                 acgtaccttagcgtcgatagtagtcgaacttacgatccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGta                                                                                                            >  1:315028‑M1/108‑141 (MQ=255)

                                   tACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGtata                                                                                                          >  2:620925/1‑141 (MQ=255)

                                         tagggtcgatggtagtcgaacttacgttctgatagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatgaaaaagaaaaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTAtaattaat                                                                                                    >  2:360253‑M1/100‑141 (MQ=255)

                                          agcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATaattaatt                                                                                                   >  1:1190792‑M1/99‑141 (MQ=255)

                                            tAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCt                                                                                                 <  2:504033/141‑1 (MQ=255)

                                            cgtcgatggtagtcgaacttacgttccgatagagtagagcgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCt                                                                                                 <  1:775484‑M1/45‑1 (MQ=255)

                                                 aGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCg                                                                                            >  1:1028525/1‑141 (MQ=255)

                                                  atttGAAAACCTGTATAGTATTTATTAGTTGACGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCgg                                                                                           <  2:1099827/140‑1 (MQ=255)

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                                                   tttGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAACCAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTGTTCGGt                                                                                          >  2:283476/1‑141 (MQ=255)

                                                    gtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaactggcaaaggcaaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTa                                                                                         <  1:876271‑M1/53‑1 (MQ=255)

                                                    gtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatgaaaagggtaaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTa                                                                                         <  1:570340‑M1/53‑1 (MQ=255)

                                                     tGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTaa                                                                                        <  1:124102/141‑1 (MQ=255)

                                                               tacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAAAGaa                                                                              <  2:529604‑M1/64‑1 (MQ=255)

                                                                acgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAAc                                                                             <  1:308128‑M1/65‑1 (MQ=255)

                                                                acgttccgctagagtagaacgtagccagccagtttcccaatcacatcctgtgtaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAATTGTTGATAAAATGTATAATTAATTGTTGTCGGTAAGAAAAATGAAc                                                                             >  1:624501‑M1/77‑141 (MQ=255)

                                                                 cgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACa                                                                            <  1:86362‑M1/66‑1 (MQ=255)

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                                                                     atttatttGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGa                                                                        <  2:1000554/141‑1 (MQ=255)

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                                                                        tatttGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGaaaa                                                                     <  2:696318/141‑1 (MQ=255)

                                                                        tatttGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAACAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGATCATTGaaaa                                                                     <  2:773194/141‑1 (MQ=255)

                                                                          tttGTTGAGGCAAACAAAACTACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACt                                                                   >  1:733246/1‑141 (MQ=255)

                                                                            tgttgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGa                                                                 <  1:1047448/141‑1 (MQ=255)

                                                                             gttgAGGCAAACAAAAAAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAACCTGaa                                                                >  2:75929/1‑141 (MQ=255)

                                                                               tgAGGCAAACAAAACAACTAATCTTAAGAAATAACTTGAATTTCTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATg                                                              <  2:790498/141‑1 (MQ=255)

                                                                                      tgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAatat                                                       <  1:262473‑M1/87‑1 (MQ=255)

                                                                                      aacaaaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAatat                                                       <  2:399761/141‑1 (MQ=255)

                                                                                      aacaaaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGATATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGGAAACTGAATGAAAatat                                                       >  2:37068/1‑141 (MQ=255)

                                                                                       gccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggaccagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATg                                                      <  2:1161552‑M1/88‑1 (MQ=255)

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                                                                                       acaaaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATg                                                      >  1:658370/1‑141 (MQ=255)

                                                                                          tggtagttttttaatcaagttttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGTTAAAATGTATAATTAATTCTGGTCGGTAAGAAAAATGAAAATTGAAGGCTTTATGACAATATGTCa                                                   >  2:259272‑M1/51‑141 (MQ=255)

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                                                                                                       attaaatttaggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaa                                      >  2:70405‑M1/38‑141 (MQ=255)

                                                                                                         caaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTACAAGCTGATAAAATGTATAATTAATTATTGTCGGTAAGAAAAATTAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaa                                    <  2:192344‑M1/106‑1 (MQ=255)

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                                                                                                         aGAAATAAATTGAATTACTAACTAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaa                                    <  2:1028441/141‑1 (MQ=255)

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                                                                                                            aaTAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATGCAAAAAAAc                                 >  1:144188/1‑141 (MQ=255)

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                                                                                                               aaCTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGGCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTa                              >  2:872405/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                aCTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTaa                             >  2:718362/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                 ggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTACAAAAAACGTAAc                            <  2:348537‑M1/114‑1 (MQ=255)

                                                                                                                 ggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTAAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAAAGTAAc                            <  2:569075‑M1/114‑1 (MQ=255)

                                                                                                                 ggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAAAATGCAACTTAAGTGTTGATGAAATGTATAAGTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGtaaa                            <  2:252714‑M1/114‑2 (MQ=255)

                                                                                                                  gttaaaaaataaaatggacaagatacAAATACATGTTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATCTGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACt                           <  2:498798‑M1/115‑1 (MQ=255)

                                                                                                                      aaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATaa                       >  1:594496‑M1/23‑141 (MQ=255)

                                                                                                                       aaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGCCTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATGCTTGTCGGTAAGAAACATGTAATTACAGAATGGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAg                      <  1:34160‑M1/120‑1 (MQ=255)

                                                                                                                       aaaaacaaacagacaagataaAAAAAGCCATTGACTCAAATGTTCATAAAATGTCTAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAg                      >  1:1156150‑M1/22‑141 (MQ=255)

                                                                                                                        tACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGt                     <  1:176707/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                        aaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGt                     >  1:1007900‑M1/21‑141 (MQ=255)

                                                                                                                        aaataaaatggaaaagataaAAAAAGTTATAGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAAcgtaacttatagt                     >  2:690181‑M1/21‑135 (MQ=255)

                                                                                                                          cTAACGAAAATTCATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCATGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACGGATTGACAATATGTCAACGTTAATTCTAAAAAACGTAACtatacttta                   >  2:126011/1‑136 (MQ=37)

                                                                                                                            aaCGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACa                 <  1:402578/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                aaaaTTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACa             <  1:1043420/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                  aattaattTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACatt           >  2:317518/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                  aattaattTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACatt           >  2:1195051/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                   acaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACatta          >  1:1149094‑M1/10‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                      aattTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATACGTTACAACCATTAttt       >  1:121603/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                      aattTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTAttt       >  2:834284/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                      aattTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTAttt       >  1:442489/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                        ttgaaaaatGGTATGGACTTGAACTTTGACAAAATGTATAATGAATTTTTCTAGGTAAGAAACATTATCATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAGCGGTAATTACAAAAGACGCAACTTTGAGTTACAAACATTATTTAg     <  2:169344/137‑1 (MQ=9)

                                                                                                                                        ataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAg     >  1:531369‑M1/5‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                          aaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTa   <  1:967023‑M1/139‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                           aAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATCACCCCCAGACAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTAt  <  1:521329‑M1/140‑1 (MQ=255)

AGGGCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTAT  >  CP000730/512480‑512759

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 12 ≤` `ATCG/ATCG` `< 13 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.