| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 36133 = | 1750 (16.270) | 6 (0.060) | 5/268 | 12.1 | 0.35% | coding (419/675 nt) | tpn | IS431mec transposase |
| ? | CP000730 | 36148 = | 1707 (16.590) | coding (404/675 nt) | tpn | IS431mec transposase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1788 total aligned reads displayed.
TTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAATGGCACGATATAAA > CP000730/36008‑36288 | tttGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTT‑AGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTg < 1:90272/141‑1 (MQ=255) ttGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGc < 1:978958/141‑1 (MQ=255) tGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTT‑AGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGcc < 1:1068869/141‑1 (MQ=255) tGATACCTTGTTTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTTAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGTCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTGGTTGAAGGTGcc > 1:1146559/1‑141 (MQ=11) gATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTT‑AGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCt < 2:356917/141‑1 (MQ=255) atatcTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTT‑AGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTg > 1:104183/5‑141 (MQ=255) aCCTTGTCTTTCTTACCTTGATATGACGGTGATCTTGCGCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGAt > 1:672663/1‑141 (MQ=14) ccTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATc < 2:976577/141‑1 (MQ=255) cTTGTCTTTTTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCt > 1:883533/1‑141 (MQ=255) cTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCt < 2:695182/141‑1 (MQ=255) cTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCt > 2:538180/1‑141 (MQ=255) cTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCt > 2:181246/1‑141 (MQ=255) ttGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTg < 1:411533/141‑1 (MQ=255) ttGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTg > 1:505841/1‑141 (MQ=255) tGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCATGTTTAAGGTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGt < 2:646211/141‑1 (MQ=255) ctttcttACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAAt < 1:787442/141‑1 (MQ=255) ctttcttACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAAt > 1:70790/1‑141 (MQ=255) tttcttACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGTCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAAtt > 1:163922/1‑141 (MQ=255) tttcttACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATCGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAAtt < 2:871565/141‑1 (MQ=255) ttcttACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGCGCCTATTCAGTTATTGCGATGTACAGTGGCAGTCAGGTTTAAGTTTCAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGCTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTa < 2:1123318/141‑1 (MQ=11) ttcttACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTa < 2:1088338/141‑1 (MQ=255) aCTTTAATATGACTGTGATCTTGCTCAATTAGGTTATTCAGATATTTCGATGTAGAATGACAGTCACGTTTAAGTTTAAAATCTTTAATTATTTT‑ATCCATTTCTGCCTTCGTTTAAGGTGCCTAATCTGTAACTACCttt < 2:436633/141‑1 (MQ=11) tttAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTg < 2:516646/141‑1 (MQ=255) ttACTATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGa < 1:433952/141‑1 (MQ=255) ttAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑ACCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGa < 2:801650/141‑1 (MQ=21) ttAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGa < 1:1206077/141‑1 (MQ=21) atatGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGt > 2:59761/1‑141 (MQ=255) ttgccGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTTCTCAGATACTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTTTTTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGACCTTTAATTACCTTTTGAGGttt < 1:584299/137‑1 (MQ=11) atGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTCCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGttt > 1:385307/1‑141 (MQ=255) atGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTT‑AGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAggctt < 1:1184152/141‑4 (MQ=11) gACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTAc < 1:196921/141‑1 (MQ=255) aCGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTAGTTTGATTTATT‑CTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTAcc > 1:275755/1‑141 (MQ=11) tggTGATCTTGTTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCCGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCa < 1:862727/140‑1 (MQ=255) cGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAAATACTTCGATGTACAACGGCAGTAAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCa < 1:1089702/141‑1 (MQ=11) gTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTCATCTGTCATTACCTTTTGAGGTTTACCaaa > 2:1167184/1‑141 (MQ=255) gTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTT‑AGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCaaa < 1:145102/141‑1 (MQ=11) tGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAAt < 2:73698/141‑1 (MQ=17) tGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTT‑AGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAAt > 2:497354/1‑141 (MQ=255) tGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTT‑AGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAAt > 2:1199811/1‑141 (MQ=11) ggaccTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAAt < 1:447167/137‑1 (MQ=255) tCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCCAATTGt > 1:492628/1‑141 (MQ=12) tCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGt > 2:339535/1‑141 (MQ=17) tCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTT‑AGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTTCCTTTTGAGGCTTACCAAATTGt > 1:544779/1‑141 (MQ=11) cTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGtt > 1:249650/1‑141 (MQ=17) cTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGGCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTT‑AGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGtt > 2:1102412/1‑141 (MQ=11) cTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTT‑AGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGtt > 2:841876/1‑141 (MQ=11) ttccTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAGTGACAGTGAGGCTTAAGTTTCAAAGCTTTAATTATTTT‑AGCCATTGCTGCCTTCGGTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGTCTTACCAAATTGttt > 2:62972/4‑141 (MQ=11) ttGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGACAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGttt > 2:4757/1‑141 (MQ=12) ttGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTT‑AGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGttt > 2:55382/1‑141 (MQ=255) tGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTa > 2:1016599/1‑141 (MQ=12) cAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATga < 1:1109434/141‑1 (MQ=17) cAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATga < 1:800114/141‑1 (MQ=17) aaTGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTCAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATgag < 2:822421/141‑1 (MQ=12) aGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGt < 1:463564/141‑1 (MQ=12) ggTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGtt > 2:1148776/1‑141 (MQ=12) ttATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTACGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTg > 1:608415/1‑141 (MQ=12) aTTCAGATATTGCGATGTACAATGGCAGCCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTCCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGAt < 2:21863/141‑1 (MQ=11) tCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGAtca > 2:135941/1‑139 (MQ=12) aGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAAc > 2:410872/1‑141 (MQ=12) gATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTT‑AGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACg < 2:1186561/141‑1 (MQ=11) atatTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGc > 2:1037525/1‑141 (MQ=17) tatTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTCATCTGCAATTACCGTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTACTGAGACGTTTGATAAACGCa < 1:733254/141‑1 (MQ=11) atTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCat < 1:647144/141‑1 (MQ=17) cGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGc > 2:1066282/1‑141 (MQ=12) gATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGGTAAACGCATGTGCt > 1:321324/1‑141 (MQ=255) aTGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTCGATAAACGCATATGCTg > 2:153662/1‑141 (MQ=255) aTGTACAATGGCAGGCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTg < 1:186546/141‑1 (MQ=12) aTGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTT‑AGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTg < 2:613509/141‑1 (MQ=11) tGTACAATGGCAGTGAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCAGATGCTGa > 1:629906/1‑141 (MQ=255) tGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGa > 2:382854/1‑141 (MQ=12) aCAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATg < 1:127517/141‑1 (MQ=17) aCAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATg > 2:919/1‑141 (MQ=12) aaTGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGAt < 2:678688/141‑1 (MQ=14) aaggCTTTAATGACTTT‑AAACCTTGTTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATTGGTAATTACCTTTTGATGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCaa < 2:30382/138‑1 (MQ=1) ttt‑AACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAatgtatg < 1:687521/141‑1 (MQ=11) ttaaccATTGCTACCTTCGTAGACGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACGAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCGACCAAATATCTAgtgtatgt < 1:758215/137‑1 (MQ=11) cttGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGCTCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCctct < 1:962193/140‑1 (MQ=255) tGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAAGCAAATATCAAATGTATGTcctgctgt > 1:564839/1‑135 (MQ=255) tGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGc > 2:201669/1‑141 (MQ=32) gttACATTGGTGGACGGTGACTGTTCTGTAACTATCTTTTGATTTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCa < 1:219860/139‑1 (MQ=11) cTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTgtat > 1:1170851/1‑138 (MQ=17) tACCGTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGTACTACTATCTCTTTGCTTACGCAACCAAATATCTACTGTATGTCCctcttcgtc > 1:820757/1‑136 (MQ=11) gccTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCTAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCa > 1:836512/2‑141 (MQ=11) gccTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCa < 1:1001527/140‑1 (MQ=255) actttCGTGGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACTCATATGCTGTATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAGTTTCTAATGTATGTCCCTCTGTATCa < 2:453625/138‑1 (MQ=11) aCCTTCTTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTAGCTTTTGAGGTGTATCGGTTTGTGTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCCCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCa < 2:249479/141‑1 (MQ=11) ccTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTGCCTAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCaa < 1:358755/141‑1 (MQ=17) ccTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCaa > 1:1024381/1‑141 (MQ=32) ccTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCaa < 2:944681/141‑1 (MQ=12) ccTTCGTCGACGGGGCCTGATCTGTAATTACTGTTTGAGCTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCGCGTTGCTTACGCAACCAAATATCGAATGTATGTCCCTCTGTATCaa < 1:338079/141‑1 (MQ=11) cTTCGTTGAAGGTGCCTGGTCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATCCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAAt < 2:891289/141‑1 (MQ=17) cTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAAt < 1:298783/141‑1 (MQ=17) ttCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCCTATGCTGAATGATTATCTCGATGCTTACGCCACCAAATATCTAATTTATGTACCTCTGCATCAATg > 1:998039/1‑141 (MQ=11) ttCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATg < 2:279667/141‑1 (MQ=255) cGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAATGGc < 2:717144/141‑1 (MQ=32) gTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTCGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATGGCa < 2:785415/141‑1 (MQ=255) ttGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATTTCTAATGTTTGTTCTTCTTTATTAATGGCAc > 1:931164/1‑141 (MQ=11) atGAAGGTACCTGATCTGTAATTACCGTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATCTCTAATGTATGTCCCTCTGGATCaacgcccc > 2:322403/2‑135 (MQ=11) gTGCCTGATCGTCAATTACCTTTTGAGTTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAATGGCACGAtata < 2:766511/141‑1 (MQ=255) gCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAATGGCACGATTTaaa > 1:1129446/1‑141 (MQ=17) | TTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTT‑AGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAATGGCACGATATAAA > CP000730/36008‑36288 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |