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Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
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cagagactcagacccagacagcgactcagc‑ctcagaCAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACGCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATtcagactc < 2:887483/141‑1 (MQ=255) gcgactcagactcagacagcgacttaga‑ctcagacaGTGATTCAGATTCAGACAGCGACtcagattcaga > 1:770212/1‑70 (MQ=255) gcgactcagactcagacagcgactcaga‑ctcagacaGTGATTCAGATTCAGACAGCGActcagactcaga < 2:770212/70‑1 (MQ=16) cgagtcagactcagacagcgactcagc‑ctcagacagTGATGCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATtcagactcaga < 2:72702/141‑1 (MQ=255) cgactcagactcagacagcgactcaga‑ctcagacagTGATTCAGATTCAGACAGCGACtc > 1:1024462/1‑60 (MQ=38) cgactcagactcagacagcgactcaga‑ctcagacagTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATtcagactcgga > 1:103402/1‑141 (MQ=255) cgactcagactcagacagcgactcaga‑ctcagacagTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATtcagactcaga < 2:694776/141‑1 (MQ=255) | ACAACTGAAGATGATAAAGATGCAGATGGTGGCGAAGTTGACGTAACAATTACGGATCATGATGATTTCACACTTGATAACGGATACTTCGAAGAAGATACATCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGTGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGA‑CTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCAGACTCAGA > CP000730/622156‑622436 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |