| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,119,528 | 0 | C | T | 65.8% | 75.5 / 58.6 | 76 | D240N (GAT→AAT) | USA300HOU_1992 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (10/16); new base T (23/27); total (33/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.28e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATTGTCTTCTATGCGTTTCAATTCTGATTGTTTATCAGCTAATTGATTACGTAAATTAATTTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATCATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAATATCTTTGATATCTTTGTTAATCTGTTTTATCTTGTCCGTAAGAATCTTTTTCTTTGTTTCAATTTCATGATCTC > CP000730/2119391‑2119662 | tttGTCTTCTATGCGTTTCAATTCTGATTGTTTATCAGCTAATTGATTACGTAAATTAATTTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTattatt < 1:1100020/140‑1 (MQ=255)tttGTCTTCCATGCGTTTCAATTCTGATTGTTTATCAGCTAATTGATTACGTAAATTAATTTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTattatt < 2:87099/140‑1 (MQ=255) tGTCTTCTATGCGTTTCAATTCTGATTGTTTATCAGCTAATTGATTACGTAAATTAATTTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTTAAGTTGCTCAATTTCTTGATTGATAATTGGGTATCtattattat < 1:657523/141‑1 (MQ=255) tATGCGTTTCAATTCTGATTGTTTATCAGCTAATTTATTACGTAAATTAATTTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATCATTATCGAATTc < 1:219403/141‑1 (MQ=255) tATGCGTTTCAATTCTGATTGTTTATCAGCTAATTGATTACGTAAATTAATTTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATCATTATCGAATTc < 1:317527/141‑1 (MQ=255) gCGTTTCAATTCTGATTGTTTATCAGCTAATTGATTACGTAAATTAATTTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTgg > 1:1104363/1‑141 (MQ=255) cGTTTCAATTCTGATTGTTTATCAGCTAATTGATTACGTAAATTAATTTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTggg > 1:574698/1‑140 (MQ=255) tttCCATTCTGATTGTTTATCAGCTAATTGATTACGTAAATTTGTTTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTAc < 1:685839/141‑1 (MQ=255) tttCAATTCTGCTTGTTTATCAGCTAATTGATTACGTACATTAATTTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATCATTATCGAATTCTGGTAc < 1:448867/141‑1 (MQ=255) tttCAATTCTGATTGTTTATCAGCTAATTGATTACGTAAATTAATTTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTAc < 2:410423/141‑1 (MQ=255) aaTTCTGATTGTTTATCAGCTAATTGATTACGTAAATTAATTTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTAGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATcc < 2:196975/141‑1 (MQ=255) ttCTGATTGTTTATCAGCTAATTGATTACGTAAATTAATTTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATCATTATCGAATTCTGGTACATCCTg > 1:1083275/1‑141 (MQ=255) ttCTGATTGTTTATCAGCTAATTGATTACGTAAATTAATTTCTTCATTACCGTTTTGAATATCTGTACGCTCATTTTCCAGTTGCTCATTTTCTCGTTTGATAATTGCGTAGCGATCATTATCGAATTCTGGTACCTCCTg > 1:1207695/1‑141 (MQ=255) ttCTGATTGTTTATAAGCTAATTGATTACGTAAATTAATTTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTg > 2:818787/1‑141 (MQ=255) tCTGATTGTTTATCAGCTAATTGATTACGTAAATTAATTTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGc < 1:650352/141‑1 (MQ=255) cTGATTGTTTATCAGCTAATTGATTACGTAAATTAATTTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCGATTTCTTGTTTGATTATTGCGTATCTATCATTATCGAGTTCTGGTACATCCTGCt > 1:391121/1‑141 (MQ=255) gATTGTTTATCAGCTAATTGATTACGTAAATTAATTTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTa < 1:775356/141‑1 (MQ=255) tATCAGCTAATTGATTCCGTAAATTAATTTCTTCCTTCCCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTttgtt < 1:61492/141‑1 (MQ=255) tATCAGCTAATTGATTACGTAAATTAATTTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTttgtt < 1:551480/141‑1 (MQ=255) tATCAGCTAATTGATTACGTAAATTAATTTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCCCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTAGTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATtttttt > 2:94108/1‑141 (MQ=255) ttccgttatttGCTTACGTAAATTTATTTCTTTCTTTCCGTTTTGAATATCTATTCGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGCTATTTGCGTATCTATCATTATCGACTTCTGGTACATCCTGCTTATTttgttg < 2:999529/132‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) aTTACGTAAATTAATTTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAAt < 2:918766/141‑1 (MQ=255) aTTACGTAAATTAATTTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATCATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAAt < 2:734457/141‑1 (MQ=255) aCGTAAATTAATTTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACg < 1:1040081/141‑1 (MQ=255) attaattTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCgg < 1:969802/141‑1 (MQ=255) ttaattTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGa < 1:945459/141‑1 (MQ=255) ttaattTCTTCCTAACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGa < 1:503307/141‑1 (MQ=255) taattTCTTCCTTCCCGTTTTGAATATCTCTACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATCATTATCGAATTCTGGTACATCCCGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGaa < 2:1117613/141‑1 (MQ=255) aattTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAat > 1:1013025/1‑141 (MQ=255) attTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATCATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTCATACGTATCGGAgta > 2:1149572/1‑141 (MQ=255) tttttcCTTGCCGTTTTTAATATCTATACGCTTATTTTCCAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAatatc < 2:762178/138‑1 (MQ=255) tcttcCTTACCGTTTTGAATATCTATCCGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAatatct < 1:915703/141‑1 (MQ=255) tcttcCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAatatct > 1:1036370/1‑141 (MQ=255) cttcCTTACCGTTTTGAATGTCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAatatctt < 1:72843/141‑1 (MQ=255) ttcCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAatatcttt < 1:655151/141‑1 (MQ=255) ttcCGTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATGTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAatatcttt < 2:973335/141‑1 (MQ=255) ccTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATCATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAatatctttga < 2:130464/141‑1 (MQ=255) cTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCGTGTTTGATAATTGCGTATCGATCATTAGCGTACTCTGGTACATCCTGCTTATTTTTTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAatatctttgtt < 2:533788/141‑3 (MQ=255) aCCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATCATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAatatctttgatatc < 1:437041/141‑1 (MQ=255) ttGAATATCTATTCGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAATATCTTTGATATCTTTGtt < 2:26293/141‑1 (MQ=255) atatCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATCATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAATATCTTTGATATCTTTGTTAATc < 1:523664/141‑1 (MQ=255) atatCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTAACTATCATTATCGAATTCTGGTACAGCCTACTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCCGAATATCTTTGATATCTTTGTGaagt > 1:118040/1‑139 (MQ=255) atCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAATATCTTTGATATCTTTGTTAATCTg > 1:386490/1‑141 (MQ=255) tCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGCATCGGAATACCTTTGATATCTTTGTTAATCTGt > 2:863558/1‑141 (MQ=255) tataCGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATCATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAATATCTTTGATATCTTTGTTAATCTGttt < 1:184512/141‑1 (MQ=255) aCGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATCATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAAGACGTATCGGAATATCTTTGATATCTTTGTTAATCTGTTTTAt < 1:1136957/141‑1 (MQ=255) tCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTCATTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAATATCTTTGATATCTTTGTTAATCGGTTTTATCTTg > 2:563898/1‑141 (MQ=255) tCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATCATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAATATCTTTGATATCTTTGTTAATCTGTTTTATCttt > 2:949422/1‑140 (MQ=255) tCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATCATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGAAATATCTTTGCTATCTTTGTTAATTTGTTTTATCttt > 2:622134/1‑140 (MQ=255) tattCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATCATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAATATCTTTGTTATCTTTGTTAACCTATTTTATCTTGTcc > 2:1001931/3‑141 (MQ=255) tttCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATCATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAATATCTTTGATATCTTTGTTAATCTGTTTTATCTTGTCCg > 1:54724/1‑141 (MQ=255) tCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAGTTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTTTCGGCATATCTTTGATATCTTTGTTAATCTGTTTTATCTTGTCCGtt > 2:452425/1‑140 (MQ=255) tCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGGATCGGAATATCTTTGTTATGTTTGTTAATCTGTGTGATCTTGTCCGTa > 1:1111806/1‑141 (MQ=255) tCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATCATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAATATCTTTGATATCTTTGTTAATCTGTTTTATCTTGTCCGTa < 1:1098017/141‑1 (MQ=255) aaGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATCATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAATATCTTTGATATCTTTGTTAATTCGTTTTATCTTGTCCGTAAg > 1:767993/1‑141 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2:506412/1‑139 (MQ=255) tCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAATATCTTTGATATCTTTGTTAATCTGTTTTATCTTGTCCGTAAGAATCTTTTTCttt < 1:131450/141‑1 (MQ=255) tGTTTGATAATTGCGTATCTATCATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTGATGCGAATCGGAAAACCGCCCTCTGCTGTGGTAATCTGTTTTATTTTGTCGGTAAGAATCTTTGTCTTGGtt > 1:521349/1‑141 (MQ=255) gTTTGATAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAATATCTTTGATATCTTTGTTAATCTGTTTTATCTTGTCCGTAAGAATCTTTTTCTTTGttt > 1:137073/1‑141 (MQ=255) tAATTGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAACATCTTTGATATCTTTGTTAATCTGTTTTATCTTGTCCCTAAGAATCTTTTTCTTTGTTTCAAttt < 2:1073034/141‑1 (MQ=255) acttgtttaactctcATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAATATCTTTGATATCTTTGTTAATCTGTTTTATCTTGTCCGTAAGAATCTTTTTCTTTGTTTCAATTTc < 2:1150684/128‑1 (MQ=255) aaTTGCGTATCTATCATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAATATCTTTGATATCTTTGTTAATCTGTTTTATCTTGTCCGTAAGAATCTTTTTCTTTGTTTCAATTTc < 2:225755/141‑1 (MQ=255) tGCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAATATCTTTGATATCTTTGTTAATATGTTTTAGCTTGTCCGTAAGAATCTTTTTCTTTGTTTCAATTTCAtt > 1:221704/1‑140 (MQ=255) tGCGTATCTATCATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAATATCTTTGATATCTTTGTTAATCTGTTTTATCTTGTCCGTAAGAATCTTTTTCTTTGTTTCAATTTCATg < 1:67576/141‑1 (MQ=255) gCGTATCTCTCATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAATATCTTTGATATCTTTGTTATTCTGTTTTATCTTGTCCGTAAGAATCTTTTTCTTTGTTTCAATTTCATGa < 2:33498/141‑1 (MQ=255) gCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAATATCTTTGATATCTTTGTTAATCTGTTTTATCTTGTCCGTAAGAATCTTTTTCTTTGTTTCAATTTCAtta > 1:41658/1‑139 (MQ=255) gCGTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAATATCTTTGATATCTTTGTTAATCTGTTTTATCTTGTCCGTAAGAATCTCTTTCTTTGTTTCAATTTCATGa < 2:880368/141‑1 (MQ=255) ggTATTTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAATATCTTTGATATCTTTGTTAATCTGTTTTATCTTGTCCGTAAGAATCTTTTTCTTTGTTTCAATTTCATGAt < 2:810381/140‑1 (MQ=255) gTATCTATTATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAATATCTTTGATATCTTTGTTAATCTGTTTTATCTTGTCCGTACGAATCTTTTTCTTTGTTTCAATTTCATGAtc > 2:769129/1‑141 (MQ=255) tatctattATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAATATCTTTGATATCTTTGTTAATCTGTTTTATCTTGTCCGTAAGAATCTTTTTCTTTGGTTCAATTTCATGAtct < 1:742592/141‑1 (MQ=255) atctatcATTATCGAATTCTTGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAATATCTTTGATATCTTTGTTAATCTGTTTTATCTTGTCCGTAAGAATCTTTTTCTTTGTTTCAATTTCATGAtctc < 1:1058811/141‑1 (MQ=255) | ATTGTCTTCTATGCGTTTCAATTCTGATTGTTTATCAGCTAATTGATTACGTAAATTAATTTCTTCCTTACCGTTTTGAATATCTATACGCTCATTTTCAAGTTGCTCAATTTCTTGTTTGATAATTGCGTATCTATCATTATCGAATTCTGGTACATCCTGCTTATTTTGTTGTGTTTGGTTAATACGTATCGGAATATCTTTGATATCTTTGTTAATCTGTTTTATCTTGTCCGTAAGAATCTTTTTCTTTGTTTCAATTTCATGATCTC > CP000730/2119391‑2119662 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |