| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,709,297 | T→A | K544* (AAA→TAA) | oatA ← | possible acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,709,297 | 0 | T | A | 93.9% | 274.1 / 7.8 | 82 | K544* (AAA→TAA) | oatA | possible acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/4); new base A (37/40); total (38/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.66e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.00e-01 | |||||||||||
ATCAGTCAGCGCTTTACTACCTGCATATTCTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTTATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCTTTCGTAAATGCCCCATTTGTACCAAGCTCTACTACAACTT > CP000730/2709160‑2709431 | atcaGTCAGCGCTTTACTACCTGCATATTCTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAaattaattaatt < 1:646355/141‑1 (MQ=255) agtcagCGCTTTACTACCTGCATATTCTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATtaatttat > 1:8595/1‑141 (MQ=255) gtcagCGCTTTACTACCTGCATATTCTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTaatttatt < 2:592496/141‑1 (MQ=255) tcagCGCTTTACTACCTGCATATTCTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTCTACCCATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATtaatttatga < 2:82672/141‑3 (MQ=255) tcagCGCTTTACTACCTGCATATTCTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTc > 1:440430/1‑141 (MQ=255) gcgcTTTACTACCTGCATATTCTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTAc > 1:199895/1‑141 (MQ=255) cgcTTTACTACCTGCATATTCTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTAcc < 2:378937/141‑1 (MQ=255) cgcTTTACTACCTGCATATTCTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTAcc > 2:679940/1‑141 (MQ=255) cgcTTTACTACCTGCATATTCTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTAcc > 2:14007/1‑141 (MQ=255) gcTTTACTACCTGCATATTCTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTTATTTATTCTACCt < 2:645017/141‑1 (MQ=255) tttACTACCTGCATATTCTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTc < 1:211945/141‑1 (MQ=255) tactacCTGCATATTCTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCAt < 1:763563/141‑1 (MQ=255) tactacCTGCATATTCTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCAt < 1:309581/141‑1 (MQ=255) ctacCTGCATATTCTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATaa > 2:396403/1‑141 (MQ=255) tacCTGCATATTCTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAAt < 2:500573/141‑1 (MQ=255) cTGCATATTCTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAAtctc < 1:634908/141‑1 (MQ=255) cATATTCTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAg < 1:385477/141‑1 (MQ=255) atatTCTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAAGTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAgg < 2:858609/141‑1 (MQ=255) tatTCTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTTATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGt < 2:586342/141‑1 (MQ=255) tatTCTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGt < 1:549304/141‑1 (MQ=255) tatTCTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGt > 1:17169/1‑141 (MQ=255) tCTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTTATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTAct < 1:49633/141‑1 (MQ=255) tCTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTAct < 2:492786/141‑1 (MQ=255) cTAAGTGAATATCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTActc < 2:229710/141‑1 (MQ=255) cTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTActc > 1:101919/1‑141 (MQ=255) cTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTActc < 2:318695/141‑1 (MQ=255) aaGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTa > 1:203172/1‑141 (MQ=255) tGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATa < 2:488231/141‑1 (MQ=255) aaTACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGa > 2:366257/1‑141 (MQ=255) aTACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGaa < 2:72835/141‑1 (MQ=255) aCCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAAc < 2:582129/141‑1 (MQ=255) aCCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAAc < 2:609393/141‑1 (MQ=255) aCCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAAc > 2:825939/1‑141 (MQ=255) aCCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAAc > 1:743847/1‑141 (MQ=255) cctCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGCAGCTTTCTACCCATCGACTAGACGAAAATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTa < 1:436755/139‑1 (MQ=255) cGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTa > 2:522038/1‑141 (MQ=255) gTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGC‑TTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTaaa < 2:819766/141‑1 (MQ=255) tCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCGGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTaaa < 2:787077/141‑1 (MQ=255) atatGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAata < 2:46148/141‑1 (MQ=255) tGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAatatat < 1:468207/141‑1 (MQ=255) aaGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCt > 2:540293/1‑141 (MQ=255) aGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTg < 1:114113/141‑1 (MQ=255) tATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAGTCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCt < 1:493762/141‑1 (MQ=255) aTTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCtt > 2:573705/1‑141 (MQ=255) aTTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCtt > 1:4487/1‑141 (MQ=255) ccGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTTATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTc > 2:149243/1‑141 (MQ=255) ccGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCtttta > 1:833816/1‑140 (MQ=255) ccGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTc > 1:41191/1‑141 (MQ=255) cGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATAAGTCTGCTTTTcc > 1:311761/1‑141 (MQ=255) tGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATc > 2:150353/1‑141 (MQ=255) gCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATcc > 1:54226/1‑141 (MQ=255) gAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAAt < 2:133055/141‑1 (MQ=255) aaGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATa < 2:419815/141‑1 (MQ=255) gCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGt < 2:383149/141‑1 (MQ=255) gCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGt < 2:292617/141‑1 (MQ=255) gCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGt > 2:436250/1‑141 (MQ=255) ttATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTTATTTATTCTACCGTCGTAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCa < 1:824728/141‑1 (MQ=255) ataCCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCAtt < 2:732141/141‑1 (MQ=255) ataCCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCAtt > 2:657585/1‑141 (MQ=255) ccAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTaa < 2:317046/141‑1 (MQ=255) gACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATc > 1:148735/1‑141 (MQ=255) aCTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCt > 1:294118/1‑141 (MQ=255) cTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCtt > 2:260957/1‑141 (MQ=255) cTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTAAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGa < 1:277263/85‑1 (MQ=255) cTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTAAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGa > 2:277263/1‑85 (MQ=255) aGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCTTTc > 2:399507/1‑141 (MQ=255) gATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCTTTCg > 1:333063/1‑141 (MQ=255) aCATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAAATAACGATAGGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCTTTCGTAAAt < 1:16135/141‑1 (MQ=255) cATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCTTTCGTAAATg > 1:839620/1‑141 (MQ=255) ttAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCTTTCGTAAATGcc < 2:122102/141‑1 (MQ=255) agagCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCTTTCGTAAATGcccc < 2:367427/141‑1 (MQ=255) agCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCTTTCGTAAATGCCCCAt > 1:239292/1‑141 (MQ=255) cgcTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCTTTCGTAAATGCCCCAttt < 2:325608/141‑1 (MQ=255) gcTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCTTTCGTAAATGCCCCATTTg > 2:385321/1‑141 (MQ=255) ttCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCTTTCGTAAATGCCCCATTTGTAcc > 2:631834/1‑141 (MQ=255) ttCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCTTTCGTAAATGCCCCATTTGTAcc > 2:631890/1‑141 (MQ=255) ttCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCTTTCGTAAATGCCCCATTTGTAcc < 1:291163/141‑1 (MQ=255) ttCAGCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCTTTCGTAAATGCCCCATTTGTAcc < 1:246823/141‑1 (MQ=255) gCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCTTTCGTAAATGCCCCATTTGTACCAAGc > 2:131543/1‑141 (MQ=255) gCTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCTTTCGTAAATGCCCCATTTGTACCAAGc > 1:335796/1‑141 (MQ=255) cTGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCTTTCGTAAATGCCCCATTTGTACCAAGct < 1:647630/141‑1 (MQ=255) tGCCTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCTTTCGTAAATGCCCCATTTGTACCAAGctc > 2:665905/1‑141 (MQ=255) cTCATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCTTTCGTAAATGCCCCATTTGTACCAAGCTctac > 1:330502/1‑141 (MQ=255) cATAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCTTTCGTAAATGCCCCATTTGTACCAAGCTctacta < 1:256390/141‑1 (MQ=255) aTAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCTTTCGTAAATGCCCCATTTGTACCAAGCTCtactac < 2:744377/141‑1 (MQ=255) tAAATTAATTAATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCTTTCGTAAATGCCCCATTTGTACCAAGCTCTACTACa < 2:525424/141‑1 (MQ=255) attaattaATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCTTTCGTAAATGCCCCATTTGTACCAAGCTCTACTACAACt > 1:486664/1‑141 (MQ=255) ttaattaaTTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCTTTCGTAAATGCCCCATTTGTACCAAGCTCTACTACAACtt < 1:553392/141‑1 (MQ=255) | ATCAGTCAGCGCTTTACTACCTGCATATTCTAAGTGAATACCGTCATATGCAAAGTATTCCGGATGACCTGCAGAAGCTTTATACCAATCGACTAGATGTACATTAGAGCGCTTTTCAGCTGCCTCATAAATTAATTTATTTATTCTACCTTCATAATCTCTAGGTACTCTAATAGAAACTAAATATATGTCTGCTTTTCCAAAACTATCCAATAGTTCATTTAATTGATCTTTCGTAAATGCCCCATTTGTACCAAGCTCTACTACAACTT > CP000730/2709160‑2709431 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |