| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP000730 | = 614093 | 163 (0.950) | 11 (0.070) +CGATTCAGAT |
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| ? | CP000730 | 622324 = | 192 (1.120) | coding (2887/3465 nt) | sdrE | Ser‑Asp rich fibrinogen/bone sialoprotein‑binding protein SdrE | |||||
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| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
CGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAT > CP000730/613950‑614241 | cGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTgatt < 1:1697422/149‑1 (MQ=255) gattcagattcaGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCgattc > 2:880956/1‑149 (MQ=255) attcagattcagACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTgattca < 1:1013129/149‑1 (MQ=255) ttcagattcaggCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTgattcag < 1:874912/149‑1 (MQ=255) tcagattcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTgattcaga < 1:1257044/149‑1 (MQ=255) cagattcagaCAGCGACTCCGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGAGAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTgattcagat < 1:1018648/149‑1 (MQ=255) agattcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGGTTCGGATAGCGACTGGGAAGCGGAGAAGGATTACGATTCAAATAGCGATTCGGACTCGGACAGAgattcagata > 2:784293/1‑148 (MQ=17) agattcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGGAAGGGATTCTGACTCAGACAGCgattcagatt > 2:95110/1‑149 (MQ=17) agattcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTgattcagatt > 2:1352170/1‑149 (MQ=255) agattcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTgattcagatt < 2:1604809/149‑1 (MQ=255) agattcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTgagccagatt > 2:1356678/1‑149 (MQ=255) agattcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACCGAGACTCGGATAGGGATTCAGATGCAGATAGCGATTGGGGCTCAGCGAGTgatcaccgtc > 2:424961/1‑142 (MQ=17) agattcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGAATCAGACGCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTgattcagatt > 1:397343/1‑149 (MQ=255) ttcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGAGTCAGAAAGCGACTCAGATTGGGATAGCGACTCAGACGCAGATAGCGATTCAGAGTGTGATAGCGATTCAGAACAAAACAGTGattaagattcag > 2:399145/1‑149 (MQ=17) ttcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGattcagattcag < 1:207542/149‑1 (MQ=255) ttcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCGGAGTGAGACAGCGattcagattcag > 2:96857/1‑149 (MQ=255) tcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGAttcagagtcaga > 2:1453513/1‑149 (MQ=255) gcccgCGAATCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTc < 1:335290/145‑1 (MQ=255) gaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTc < 1:1723009/149‑1 (MQ=255) 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cGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagaatcagata > 2:75926/1‑149 (MQ=255) cGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATgcaaatggcgactcagactccgata > 2:1525886/1‑149 (MQ=255) ggACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagttagcgactcagactcagatagcgact > 1:1043246/1‑149 (MQ=255) ggACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagagactccgaccacgagaccgact > 1:172002/1‑136 (MQ=17) cAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCGGACAGCGACTCAGATtcagatggcgactcagactcagatggcgactgagat > 2:1034768/1‑148 (MQ=255) cAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagatcgcgactcagac > 1:763781/1‑149 (MQ=255) cAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagaccaagatagcgactcaccc > 2:47681/1‑146 (MQ=255) aGACAGTGATTCAGATGCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagatagcgactcagact < 1:1626455/149‑1 (MQ=255) ggcAGTGATTCAGATCCAGCTTCAGATACCGACTCAGATTGTGACAGCGATTCAGACTCCGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagatagcgactcagactc < 2:12386/147‑1 (MQ=17) aCAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACCCCGTAGCCGCATCCGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcacatagcgactcagactca > 1:406821/1‑149 (MQ=17) cAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagatagcgactcagactcag < 1:1192709/149‑1 (MQ=255) | CGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAT > CP000730/613950‑614241 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |