| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 2543221 = | 209 (1.220) | 4 (0.030) | 4/270 | 13.4 | 2.1% | intergenic (+15/‑49) | hlgA/USA300HOU_2403 | gamma‑hemolysin component A/hypothetical protein |
| ? | CP000730 | 2543266 = | 187 (1.190) | intergenic (+60/‑4) | hlgA/USA300HOU_2403 | gamma‑hemolysin component A/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
TGCTTACGTGACAAGACATCGTTTAGCCGTTGATAGAAAACATGATGCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACA > CP000730/2543074‑2543369 | tGCTTACGTGACAAGACATCGTTTAGCCGTTGATAGAAAACATGATGCTTTTAAAACCCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCtt > 2:1498357/1‑149 (MQ=255)tGCTTACGTGACAAGACATCGTTTAGCCGTTGATAGAAAACATGATGCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCAAACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCtt > 2:693930/1‑149 (MQ=255) gattACGAGAAAAGACATCGTTTAGCCGTTGATAGAAAACATAATGCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAATAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTa < 2:241759/147‑1 (MQ=255) gCTTACGTGACAAGACATCGTTTAGCCGTTGATAGAAAACATGATGCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTa > 1:849586/1‑149 (MQ=255) gCTTACGTGACAAGACATCGTTTAGCCGTTGATAGAAAACATGATGCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGAAAACAGTTCAATCATCTTa > 2:1553169/1‑149 (MQ=255) cGTGACAAGACATCGTTTAGCCGTTGATAGAAAACATGATGCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACAAGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTaaaaaa > 1:47995/1‑149 (MQ=255) gTGACAAGACATCGTTTAGCCGTTGATAGAAAACATGATGCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAAt > 2:661828/1‑149 (MQ=255) aCAAGACATCGTTTAGCCGTTGATAGAAAACATGATGCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCt > 1:1196814/1‑149 (MQ=255) aCAAGACACCGTTTAGCCGTTGATAGAAAACATGATGCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAATAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCt < 1:1021671/149‑1 (MQ=255) cGTTTAGCCGTTGATAGAAAACATGATGCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACtt < 2:32812/149‑1 (MQ=255) cGTTTAGCCGTTGATAGAAAACATGATGCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACtt < 2:472475/149‑1 (MQ=255) cGTTTAGCCGTTGATAGAAAACATGATGCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACtt > 2:1176163/1‑149 (MQ=255) cGTTTAGCCGTTGATAGAAAACATGATGCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTAAAAAAAAAAAAAAAATCCTGGGACACtt < 2:201791/149‑1 (MQ=255) cGTTTAGCCGTGGATAGAAAACATGATGCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGGGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACtt < 1:606492/149‑1 (MQ=255) tttAGCCGTTGATAGAAAACATGATGCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCa < 1:159049/149‑1 (MQ=255) ccGTTGATAGAAAACATGATGCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACtt > 1:542842/1‑149 (MQ=255) aaaaCATGATGCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGAt > 2:1225296/1‑149 (MQ=255) aaaaCATGATGCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTAAAAAACACATTAAAGAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGAt > 2:1214948/1‑149 (MQ=255) aaaCATGATGCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGAtt < 1:1114133/149‑1 (MQ=255) aaaCATGATGCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGAtt < 2:1249648/149‑1 (MQ=255) aaaCATGATGCTCTTAAAAACCGAAATGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGAtt < 1:1053549/149‑1 (MQ=255) aaCATGATGCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGAttt > 1:500458/1‑149 (MQ=255) atgatgCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTACACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGAtttttt < 1:909906/149‑1 (MQ=255) atgatgCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGAtttttt < 1:1451046/149‑1 (MQ=255) atgatgCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGAtttttt < 1:1432311/149‑1 (MQ=255) atgatgCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGAtttttt < 1:1123846/149‑1 (MQ=255) tgatgCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACTCCTTCACAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACGTGTCTCAGGATTTTTTa < 2:1651336/149‑1 (MQ=255) gatgCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGCAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATAGTTGTCGCAGGATTTTTTaa > 2:87391/1‑149 (MQ=255) gatgCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTaa < 2:90324/149‑1 (MQ=255) gatgCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGAAACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTaa > 1:1413465/1‑149 (MQ=255) atgCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGGTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTaaa > 1:925605/1‑148 (MQ=255) aCCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAg > 2:538723/1‑149 (MQ=255) aCCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAg < 2:1428211/149‑1 (MQ=255) aCCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAg < 1:445039/149‑1 (MQ=255) ccGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGc > 2:389539/1‑149 (MQ=255) ccGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGc > 2:925285/1‑149 (MQ=255) cGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGcc < 2:263606/149‑1 (MQ=255) cGAAACGTTACAGGTAAATATGAAGTGAACTTGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGcc < 2:1341297/149‑1 (MQ=255) gAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCt < 2:1144966/149‑1 (MQ=255) gAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCt < 1:1233783/149‑1 (MQ=255) aaaCGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCtt < 1:64141/149‑1 (MQ=255) gTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACTCTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATaa < 1:1229327/149‑1 (MQ=255) gTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATaa < 1:988976/149‑1 (MQ=255) ttACAGTTAAATATGAACTAAACTTGAAAACACGTTAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAATTAAACATTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGCACACTTCATACTTTTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAAc < 1:556928/149‑1 (MQ=255) tGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTAtttt > 2:778104/1‑149 (MQ=255) tGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTAtttt > 1:1560754/1‑149 (MQ=255) gAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTa > 1:115900/1‑149 (MQ=255) aaatcatcTGGAAAACAGATGAAGTAAAAATTAAAAGCAGCACAACTTATTACACAGTTCAATCATCTTACAAAAGCCTGTGACACTTCATAATTTTCGCAGGATTTTTTAAGAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTAt < 2:107402/142‑1 (MQ=255) aaGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTAt < 1:731440/149‑1 (MQ=255) aaGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTAt > 2:835019/1‑149 (MQ=255) aaGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCACCCTTATAACATTAAATTATTTTAt > 2:1262693/1‑149 (MQ=255) gtaaaCTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCg < 1:1498384/146‑1 (MQ=255) gTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCg > 2:1410583/1‑149 (MQ=255) tgaccgggAAAACACCTGAAGCAAAAGTTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGTCACTTCATACTTGGCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGt < 1:591181/143‑1 (MQ=255) tGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATTACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGt < 2:499104/149‑1 (MQ=255) tGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGt < 1:677066/149‑1 (MQ=255) tGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGt < 1:950521/149‑1 (MQ=255) tGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGt < 2:1293054/149‑1 (MQ=255) accggAAAACACATGAAGTGAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATTAGCCTTATACCATTAAATTATTTTATCGTACa < 1:1097299/146‑1 (MQ=255) tGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACAtt < 2:42230/149‑1 (MQ=255) gAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCGAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAACTTATTTTATCGTACATTaa < 1:1212686/149‑1 (MQ=255) aaaCACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAAt > 2:971384/1‑149 (MQ=255) aaaCACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAAt > 1:1519319/1‑149 (MQ=255) aaaCACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAAt > 1:1301854/1‑149 (MQ=255) aaCACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACATATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAAtt < 2:849586/149‑1 (MQ=255) aaCACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAAtt < 1:1064016/149‑1 (MQ=255) cacaTGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTta < 1:25168/149‑1 (MQ=255) caaTGAAGTAAAAATTAAAAGCATCATACCTGAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACGCTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATTAGTCTTATATCATTAAATTATTTTATCGTACATTGCATTtaa < 2:1043956/147‑1 (MQ=255) acaTGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTtaa < 2:1604666/149‑1 (MQ=255) acaTGAAGCAAAAACTAAAAGCATCACACCTGAGTAAACAGTTCAATCCTCTTAAAAAATCCTGGGTCACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACCTTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTtaa < 2:602632/149‑1 (MQ=255) acaTAAACTAAAAATTAAAAACATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTCAATTAGTTTATCGTACATTAAATTtaa < 2:1228443/149‑1 (MQ=255) tGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTtaataa < 2:81784/149‑1 (MQ=255) tGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTtaataa > 1:381885/1‑149 (MQ=255) aaGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTtaataata > 2:400160/1‑149 (MQ=255) aaTTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTg > 1:627153/1‑149 (MQ=255) aaaaGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGAttt < 1:1639459/149‑1 (MQ=255) aaaGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATTGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGAtttt < 1:1256343/149‑1 (MQ=255) aGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTta > 1:1316653/1‑149 (MQ=255) gCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTtat < 1:854608/149‑1 (MQ=255) cacaCCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACCCTTCATACGTGGCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGa > 1:758154/1‑149 (MQ=255) cacaCCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAAAAATTACAACTGATTTTTATAAGa > 1:648885/1‑149 (MQ=255) acacCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGaa > 1:318595/1‑149 (MQ=255) ccTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATaa < 1:337321/149‑1 (MQ=255) ccTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACACTAAATTCAATAACCACTACTGCTCTTTCTAAGAATaa < 2:1703173/149‑1 (MQ=255) aaaCAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCg > 1:1634561/1‑149 (MQ=255) aaaCAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCg < 2:1316653/149‑1 (MQ=255) aaaCAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCg < 2:1674446/149‑1 (MQ=255) aaaCAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCg > 1:1677108/1‑149 (MQ=255) aaCAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACGGATTTTTATAAGAATAAGGTATCGa > 1:184481/1‑149 (MQ=255) cAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAAc < 1:1372374/149‑1 (MQ=255) cAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAAc < 1:538723/149‑1 (MQ=255) aGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAAcc < 1:426936/149‑1 (MQ=255) aGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAAcc < 2:184232/149‑1 (MQ=255) gTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTAAATTCACTTTGATCATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAAACa > 1:1602195/1‑149 (MQ=255) gTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATGATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCa > 1:1689542/1‑149 (MQ=255) tCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCAta > 1:29169/1‑149 (MQ=255) tCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCAta < 1:1176163/149‑1 (MQ=255) tcatcTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGCATAAAGTATCGAATCAtagtag > 1:201062/1‑149 (MQ=255) ttAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCATCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATaca < 1:232004/149‑1 (MQ=255) ttAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATaca < 1:1453283/149‑1 (MQ=255) | TGCTTACGTGACAAGACATCGTTTAGCCGTTGATAGAAAACATGATGCTTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTTAAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACA > CP000730/2543074‑2543369 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |