| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,232,465 | G→C | A124P (GCG→CCG) | prkC → | non‑specific serine/threonine protein kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,232,465 | 0 | G | C | 99.2% | 429.1 / NA | 125 | A124P (GCG→CCG) | prkC | non‑specific serine/threonine protein kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (71/53); minor base A (1/0); total (72/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
GTTGATGAAGAAGATGACTGTTACTACTTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATGCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCTTTAACTCAGACTAATCATGTGTTAG > CP000730/1232321‑1232606 | tgatgaAGAAGATGACTGTTACTACTTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATg > 1:745305/1‑149 (MQ=255) aagaagATGACTGTTACTACTTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATg < 2:788111/149‑1 (MQ=255) aagaagATCACTGGTACTACTGAGTCGTGGAATATATCGAAGGTCCGTCTGTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGTCACAGATATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTTAACATCCGCATGATATg < 2:1032286/149‑1 (MQ=255) agaagaTCACTGTTACTACTTAGTAAGGCAATATAGCGAACGTCTGACTTTTTTTCAGTATACAGAAAACAATAAGACATTAAATGTTGACACAGCGATTAATTTTACGGATCAAAGATTTGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGc < 2:400/149‑1 (MQ=255) gaagaTGACTGTTACTACTTAGTAATGTAATATATCGAAGTTCCGACTTTGTCGGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCg < 2:390909/149‑1 (MQ=255) gaagaGGACTGTTACAACTTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCg < 1:484589/149‑1 (MQ=255) gaagaCGACTCTTACTACTTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTTAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCg < 2:1027563/149‑1 (MQ=255) aaataTGACTGTTACTACTTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCg < 2:977130/145‑1 (MQ=255) aaagaTGACTGTTACTAATTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCg < 1:768334/148‑1 (MQ=255) aagaTAACTGTAACTACTTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCTGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGGTTTGACTCAGTGATTATTTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCCTGATATGCGt < 2:139898/149‑1 (MQ=255) aTGACTGTTACTACTTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTAtt < 1:1421675/149‑1 (MQ=255) tGACTGTTACTACTGAGTAATGGAATATAAAGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTg < 1:1071606/149‑1 (MQ=255) gACTGTTACTATTTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGt < 2:80119/149‑1 (MQ=255) aCTGTTACTACTTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGTTTAATTTTACGACTCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTa < 2:392761/149‑1 (MQ=255) aCTGTTACTACTTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTa < 1:1403163/149‑1 (MQ=255) tGTTACGACTTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATAAATATTATACa < 2:838254/149‑1 (MQ=255) ctactTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATagag < 2:1587046/149‑1 (MQ=255) atatttAGTAAGGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATagag < 1:802283/145‑1 (MQ=255) tactTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTCAACATCGGCATGATATGCGTATTGTACATAgaga > 1:381717/1‑149 (MQ=255) gTAATGGAATATAACGAAGGTCCGACTTTGGCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTCTTGTACATAGAGATATTaa < 2:413556/149‑1 (MQ=255) tGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGCTGTCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCca > 2:1422520/1‑149 (MQ=255) tGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCca < 1:1175840/149‑1 (MQ=255) tGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCca < 2:1563880/149‑1 (MQ=255) tGGAATATATCGAAGGTCCGAATTTGTCTGAGTATATTGAAGGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTTGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCca < 1:576173/149‑1 (MQ=255) tGGAATATATCGAAGGTCCAACTTTGTCTGAGAATATTGAAAGTCATGCGCCATTAAGTGTTGACGCAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTCTTGTACATAGAAATATTAAGAca > 2:895570/1‑149 (MQ=255) ggAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCcac > 2:1493730/1‑149 (MQ=255) ggAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGAAATTAAGCcac > 2:54650/1‑149 (MQ=255) gAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCAGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCcaca > 1:429414/1‑149 (MQ=255) atatatCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACaaa > 2:1289215/1‑149 (MQ=255) tatatCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTATGTGTTGAGACCGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGCGAGATTAAGCCACaaaa > 2:1216129/1‑149 (MQ=255) tatatCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACaaaa > 2:934675/1‑149 (MQ=255) tatatCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATAGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACaaaa > 2:1701153/1‑149 (MQ=255) tatCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTCAGCCACAAAata < 2:1193650/149‑1 (MQ=255) tatCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAata < 2:543078/149‑1 (MQ=255) atCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACaaacaat > 1:661281/1‑145 (MQ=255) atCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAatat > 2:1491138/1‑149 (MQ=255) atCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTAATGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAataa > 1:131320/1‑148 (MQ=255) tCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGGGGTTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGGATTAAACATCCGCATGATAGGCGTATTGTACAAAGAGATATTAAGCCCCACAataca > 2:1380363/1‑147 (MQ=255) tCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCcacacaccatg > 2:848814/1‑142 (MQ=255) tCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAACatata > 1:1475839/1‑149 (MQ=255) tCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAatata > 1:1361162/1‑149 (MQ=255) cGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAatatat > 1:731920/1‑149 (MQ=255) gAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGACATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGGAGTATTAAGCCACACAatagaat > 2:369348/1‑145 (MQ=255) aaGGTCCGACTTTGTCTGAGTATAATGAAAGACATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTa < 1:572226/149‑1 (MQ=255) tCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTg < 1:693889/149‑1 (MQ=255) aCTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAg < 2:868827/149‑1 (MQ=255) cTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTGATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATGTATTAATTGACAGc < 2:951286/149‑1 (MQ=255) cTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATaaa > 1:1652694/1‑149 (MQ=255) cTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATaaa > 1:727705/1‑149 (MQ=255) cTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCAACAAAATATATTAATTGaacgagataaa > 1:1409647/1‑139 (MQ=255) cTGAGCATATTGAAAGTCCTAGGCCATTAAATGTTGACACAGCGATTAACTTTACGAATCAAATATTGGATGGCCTTAAACATCCGCCTGATATGCCTATTGTAAATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATaaa > 2:696819/1‑149 (MQ=255) gAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAAc > 2:769586/1‑149 (MQ=255) ggTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTATACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACg < 2:1299836/148‑1 (MQ=255) ggTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACg < 2:1449143/148‑1 (MQ=255) aGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCACATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTACGCCACAAAATATATTAATTGACAGCACTAAAACg < 2:1299625/149‑1 (MQ=255) aGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACg < 2:139657/149‑1 (MQ=255) aGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACg < 2:1262522/149‑1 (MQ=255) tGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGaaaa > 2:207195/1‑149 (MQ=255) aGTCATGGGCCATTAAGTGTTGAAAAAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATAtt < 1:1394742/149‑1 (MQ=255) tCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTg < 2:1015865/149‑1 (MQ=255) tCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTg > 1:278774/1‑149 (MQ=255) tCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTg > 1:1036479/1‑149 (MQ=255) tCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTg > 1:994843/1‑149 (MQ=255) tGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAACACGTTGAAAATATTTGAtt > 2:1091656/1‑149 (MQ=255) tGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGAtt > 2:1406526/1‑149 (MQ=255) ggCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGAtttt < 1:864752/149‑1 (MQ=255) ggCCATTAAGTGTTGACACAGCAATAAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATCAAACGTTGAAAATATTTGAtttt < 1:865928/149‑1 (MQ=255) gCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTTACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTg > 1:314528/1‑149 (MQ=255) gCCATTAAGTGATGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGAATGATATGCGTATTGTACATAGAAATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTg < 1:750339/149‑1 (MQ=255) aaGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAAAGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTg > 2:1424491/1‑149 (MQ=255) gtgtTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCt > 1:1276284/1‑149 (MQ=255) gtgtTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCAGGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGATGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCt > 2:1032960/1‑149 (MQ=255) gtTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGGGTTATACTGCCGCATGATTTTCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTaa > 1:1696663/1‑149 (MQ=255) tttacacAGCGATTAATATTACGAATAAAATATTGGATGACATTACACATCCGCATTATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTaaa < 1:1576075/146‑1 (MQ=255) ttGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAAGATTTGATTTTGGAATTGCTaaa < 1:1125936/149‑1 (MQ=255) ttGACACACAGATTAATTTTACAAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTaaa < 2:1321155/149‑1 (MQ=255) tGACACAGCGATTCATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAg > 2:153673/1‑149 (MQ=255) tGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAg > 2:689268/1‑149 (MQ=255) tGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAg < 1:1289215/149‑1 (MQ=255) tGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAAAATTTGAATTTGGAATTGCTAAAg > 1:558445/1‑149 (MQ=255) tGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATACGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTGGGAATTACTaaaa > 1:1412775/1‑148 (MQ=255) cacaGTGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGGATTGCTAAAGCtt < 2:207951/149‑1 (MQ=255) aactgCGATTAATTTTACGAAGCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGAAATTAAGCCAAAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCtt < 1:169759/145‑1 (MQ=255) gATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTg > 2:1444844/1‑149 (MQ=255) gATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTg > 2:1075922/1‑149 (MQ=255) ttttACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGt > 1:1712790/1‑149 (MQ=255) tttACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTc > 1:137322/1‑149 (MQ=255) tttACGAATCAAATATTGGATGGCATAAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAAATGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTc < 1:1021936/149‑1 (MQ=255) aCGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCttt > 1:1263422/1‑149 (MQ=255) aCGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCttt > 1:1684240/1‑149 (MQ=255) gAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCTTTaa > 1:1486169/1‑149 (MQ=255) aaTCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCTTTAAc > 1:350958/1‑149 (MQ=255) aTCAAATATTGGATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCTTTAACt > 1:485176/1‑149 (MQ=255) gATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCTTTAACTCAGACTAATCa > 1:1373620/1‑149 (MQ=255) gATGGCATTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTATTTAACTCAGACTAATCa > 1:1163452/1‑149 (MQ=255) ggCATTAAACATCCGCATGATATCCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATACATTAATTGACAGCAATAAAACTTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCTTTAATTCAGACTAATCAtgt < 1:1085381/149‑1 (MQ=255) aTTAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCTTTAACTCAGACTAATCATGTGtt > 1:1020322/1‑149 (MQ=255) ttAAACAGCCGGATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCTTTAACTCAGACTAATCATGTGTTa < 2:320153/149‑1 (MQ=255) tAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACACAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAACTAATTGAATTTGGAATTACTACAGCTTGAAGAGGCACATCTTTACCTGGGACTAAtggtgggtgag > 2:1333932/1‑139 (MQ=255) tAAACATCCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCTTTAACTCAGACTAATCATGTGTTAg > 1:949327/1‑149 (MQ=255) | GTTGATGAAGAAGATGACTGTTACTACTTAGTAATGGAATATATCGAAGGTCCGACTTTGTCTGAGTATATTGAAAGTCATGGGCCATTAAGTGTTGACACAGCGATTAATTTTACGAATCAAATATTGGATGGCATTAAACATGCGCATGATATGCGTATTGTACATAGAGATATTAAGCCACAAAATATATTAATTGACAGCAATAAAACGTTGAAAATATTTGATTTTGGAATTGCTAAAGCTTTAAGTGAGACGTCTTTAACTCAGACTAATCATGTGTTAG > CP000730/1232321‑1232606 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |