| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP000730 | 1,513,930 | A→T | L413F (TTA→TTT) | USA300HOU_1379 → | hypothetical membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 1,513,930 | 0 | A | T | 99.1% | 334.6 / NA | 106 | L413F (TTA→TTT) | USA300HOU_1379 | hypothetical membrane protein |
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Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
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tCATAAGATGTTTTATTGTAGTAGGATTATTAATGCCATTATTTGGATTATCCCTTATCCTTGTATTTATAATTGAATTAATATTATATATTAAAGATCGTCGTGCTAAACAATAATTCAATTAAAGTTTTGAACTGACGCAATTTACa > 2:877142/1‑149 (MQ=255) ataataTGTTTTATTGTATTAGGATTATTAATGCCTTTATTTGGATTATCACTTATCCTTGTATTTATAATTGAATTAATATTATATATTAAAGATCGTCGTGCTAAACAATAATGCACTTAAAGTTTTGAACTGACGAAATTGACaaa > 2:371922/1‑149 (MQ=255) ataataTGTTTTATTGTATTAGGATTATTAATGCCATTATTTGGATTATCACTTATCCTTGTATTTATAATTGAATTAATATTATATATTAAAGATCGTCGTGCTAAACAATAATGCACTTAAAGTTTTGAGCTGACGAAATTTAGaaa > 2:1154318/1‑149 (MQ=255) ataataTGTTTTATTGTATTAGGATTATTAATGCCATTATTTGGATTATCACTTATCCTTGTATTTATAATTGAATTAATATTATATATTAAAGATCGTCGTGCTAAACAATAATGCACTTAAAGTTTTGAACTGACGAAATTTACaaa < 1:51621/149‑1 (MQ=255) aataTGTTTTATTGTATTAGGATTATTAATGCCATTATTTGGATTATCACTTATCCTTGTATTTATAATTGAATTAATATTATATATTAAAGATCGTCGTGCTAAACAATAATGCACTTAAAGTTTTGAACTGACGAAATGTaaaacaa > 2:1715274/1‑146 (MQ=255) 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gTTTTATTGTATTAGGATTATTAATGCCACTATTTGGATTATCACTTATCCTTGTATTTATAATTGAATTAATATTATATATTAAAGATCGTCGTGCTAAACCATAAAACACTTAAAGTTTTGAACTGACGAAATTTACAAAATGATtc > 1:896855/1‑149 (MQ=255) | AAAATCATTAATTTATTTGTATGTATCGCTTTATTAGTAGCCATTGGCATGGGGTTTGTCTCTTGGATAAAGCGTACAAAAAATACTGCAATAAAAGTACCACATCGCGTAAAAAAACCAGCATCTATATCACTCATAATATGTTTAATTGTATTAGGATTATTAATGCCATTATTTGGATTATCACTTATCCTTGTATTTATAATTGAATTAATATTATATATTAAAGATCGTCGTGCTAAACAATAATGCACTTAAAGTTTTGAACTGACGAAATTTACAAAATGATTC > CP000730/1513784‑1514074 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |