| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 707,879 | A→T | L11I (TTA→ATA) | mntB ← | ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 707,879 | 0 | A | T | 99.3% | 458.1 / NA | 147 | L11I (TTA→ATA) | mntB | ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (60/86); minor base C (0/1); total (60/87) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
AATTTAGTACCGGTAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGG > CP000730/707734‑708023 | aaTTTAGTACCGGTAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTataaa > 2:706360/1‑149 (MQ=255) ttAGTACCGGTAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACAATTCGGGTCCATGATACCAATTATTTCGCCGAGTACTGGTCTCGATAAGGGAATGTGTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAGACAg > 1:750837/1‑149 (MQ=255) gTACCGGTAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAATATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGAtt < 2:923909/149‑1 (MQ=255) tACCGGTAGCATTAAATTCACCAATTATAGTTTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAACGAAATGTTTTTATGTACATGCTTATTACTTATAAACAGAttt > 2:1224218/1‑149 (MQ=255) tACCGGTAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGAACATGCTTATTACCTATAAACAGAttt > 2:61772/1‑149 (MQ=255) cctcgTAGCATTCAATTCACCAATTAAAGCCTTGATAAGGGCAGCTTTACCAGCACCACTCGGGCCCATGATACCAATTCTTTCGCCGCGTACTGGTATCGATACGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTa < 1:491366/145‑1 (MQ=255) aCCGGTAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTa > 2:1101357/1‑149 (MQ=255) ccGGTAGCATTAAATTCACCAATTCAAGACTTGATAAGGGAAGGTTTACCCGCACCATACGGGCACATGATACCCAGCGTTTCGCCGCGTCCCGGGATGGATAAGAGAATGTGTTTAAGTACACGATCATTACCGGTAAACAGCCTTaa > 2:153820/1‑149 (MQ=255) ccGGTAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTaa > 2:1525050/1‑149 (MQ=255) ccGGTAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTaa > 1:1520354/1‑149 (MQ=255) aGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACTGATTTAAATCtt < 2:1190850/149‑1 (MQ=255) aGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCAGTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCtt < 2:91205/149‑1 (MQ=255) aaaTTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGttt < 2:1538519/149‑1 (MQ=255) aaaTTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGttt < 1:766882/149‑1 (MQ=255) aaaTTCACCAATTAAACACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGttt < 1:341333/149‑1 (MQ=255) aaatCACAAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGAACCATTCGGGCCCATGAGACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTc < 1:577204/146‑1 (MQ=255) aTTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCt > 1:256188/1‑149 (MQ=255) ttCACCAATTAAAGACTTGGAAAGAGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTa < 1:1622134/149‑1 (MQ=255) tCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATTTTTTGTTTCTaa < 1:1176160/149‑1 (MQ=255) cAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACaaa < 2:1227523/149‑1 (MQ=255) aaGGCTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTta < 2:931926/149‑1 (MQ=255) gACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTAATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTtata > 1:26944/1‑149 (MQ=255) aCTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATCATTTAGCAGCGCCCTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGCACATGCTTATTACCGATACGCAGATTTAAAGCGTTTGTTACTAACAAACGTTTATAc > 2:1000909/1‑149 (MQ=255) cTTGATAAGGTAAGATTTACCAGCACGAGTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATAcc < 1:705741/149‑1 (MQ=255) cTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCCATTCTGTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATAcc < 1:983865/149‑1 (MQ=255) cTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGCACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTACATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATAcc < 1:892220/149‑1 (MQ=255) ttGATAAGGGAAGATTTACCCGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATAcct < 2:1114130/149‑1 (MQ=255) tAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCAAGACGTACGGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTa > 1:757737/1‑149 (MQ=255) aGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTTTTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAAt < 2:1414201/149‑1 (MQ=255) aGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAAt > 2:1451187/1‑149 (MQ=255) ggAAGATTTACCAGCACGATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTAATAGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTactga > 2:1107192/1‑145 (MQ=255) ggAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCTCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTCCCTATACACAGATTTAAATTTTTTGTTTTTAACAAACGTTtatagttactattta > 1:173598/1‑138 (MQ=255) ggAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAAtga > 1:25685/1‑147 (MQ=255) ggAAGATTTACCAGCACCATTCGGACCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAAGAAATGTTTTTAAGTACAGGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCATatata > 2:750136/1‑145 (MQ=255) aaGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTaaa < 1:483075/149‑1 (MQ=255) tttACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGtt > 2:1627070/1‑149 (MQ=255) tttACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGtt < 2:1367239/149‑1 (MQ=255) tttACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGtt > 1:287995/1‑149 (MQ=255) tttACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGtt < 1:1723054/149‑1 (MQ=255) tttACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGAATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTCACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGtt > 1:1016884/1‑149 (MQ=255) tttACCAGAATCATTCGGGCCAATGATATCAATTATTTCGCAGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGtt < 1:357678/149‑1 (MQ=255) tACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTCATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGtttg > 1:352588/1‑148 (MQ=255) gCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTa < 1:428984/149‑1 (MQ=255) gCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTa < 1:1018342/149‑1 (MQ=255) aCCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAAc > 2:618068/1‑149 (MQ=255) gggCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCtaatta < 1:1106369/149‑1 (MQ=255) gggCCCAGGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCtaatta < 1:1301426/149‑1 (MQ=255) ggCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCtaattaa < 1:1134628/149‑1 (MQ=255) gCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCtaattaat < 2:810993/149‑1 (MQ=255) gCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCCAACCtaattaat < 2:1193424/149‑1 (MQ=255) cccATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGATATGTTTTTAACTACATTCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTACCTAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTaattaatt < 2:1516565/149‑1 (MQ=255) cccATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTaattaatt < 1:852438/149‑1 (MQ=255) ccATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAAGCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTg < 1:1144370/149‑1 (MQ=255) cATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTCATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGt < 2:715857/149‑1 (MQ=255) cATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGt < 1:533593/149‑1 (MQ=255) aTGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGta < 2:434545/149‑1 (MQ=255) aTGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGta < 1:706360/149‑1 (MQ=255) aTGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGta < 2:508780/149‑1 (MQ=255) tACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCTATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTataat < 2:740752/149‑1 (MQ=255) aaTTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGCAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTCTAAACAGATTCAAAGCTTTTGTGTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTCATTGTATAATAAAc > 2:430854/1‑149 (MQ=255) aaTTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAAc > 1:651929/1‑149 (MQ=255) tttCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTAATAAGTACATGCGTAGTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTgaga < 2:1031584/149‑1 (MQ=255) tGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAATTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATGAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGt < 1:162885/149‑1 (MQ=255) tGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGt < 1:980443/149‑1 (MQ=255) tgTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTATGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTc < 2:1348691/148‑1 (MQ=255) tATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCaa > 1:274646/1‑149 (MQ=255) tATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCaa > 1:649912/1‑149 (MQ=255) cGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTa > 2:1077789/1‑149 (MQ=255) gATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTaa < 2:1433308/149‑1 (MQ=255) gATAAGGAAATGTTTTTAAGCACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTGGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCGAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTaa < 1:241816/149‑1 (MQ=255) aaGTAAATGTTTTCAAGTACTCTCTTATTACCTATAAACATATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTGATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAAtt < 2:866489/149‑1 (MQ=255) aaGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAAtt > 1:1430418/1‑149 (MQ=255) aaGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAAtt < 2:136938/149‑1 (MQ=255) ggAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCg < 1:1451187/149‑1 (MQ=255) ggAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCg < 1:230251/149‑1 (MQ=255) ggAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCg < 1:118122/149‑1 (MQ=255) ggAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGCTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCg > 2:251443/1‑149 (MQ=255) ggAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATATTTTGTATCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGCATATTTATCATGTCAAGTAAATTCg > 2:1096510/1‑149 (MQ=255) aaaTGTTTGTAAGTACATGCTTATTCCCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTg < 1:448849/149‑1 (MQ=255) ctGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAAGAAACTGAGAATATTTATCATGTCAACTAAATTCGTGat < 2:1048086/148‑1 (MQ=255) aTGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGat > 1:1537151/1‑149 (MQ=255) gTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGatat < 1:1105593/149‑1 (MQ=255) ttttAAGTACATGCTTATTATCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAATAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCACGGGAATTGGTGatataa < 2:1486214/149‑1 (MQ=255) ttttAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGTTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGatataa < 2:640144/149‑1 (MQ=255) aaGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGatataatata > 1:856346/1‑149 (MQ=255) aaGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTGTTAGCTTACCTAATGAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGatataatata > 1:1350517/1‑149 (MQ=255) aGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAg > 1:1379093/1‑149 (MQ=255) gTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGa < 1:1291072/149‑1 (MQ=255) aCATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAGGTAAATTCGTGATATAATATAGACa > 2:808440/1‑149 (MQ=255) cATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACaa > 1:107201/1‑149 (MQ=255) cATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACaa < 2:648381/149‑1 (MQ=255) tGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAatg < 2:1316166/149‑1 (MQ=255) tGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAatg < 2:1676096/149‑1 (MQ=255) tGCGTATTACGCATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAAACTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTACCATGTCAAGTAAATTCTTGATATAATATAGACAatg < 2:553371/149‑1 (MQ=255) gCTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAatgt > 1:164924/1‑149 (MQ=255) cTTATTACCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAatgta > 2:503634/1‑149 (MQ=255) taCCTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGa < 2:251366/149‑1 (MQ=255) taCCTATAAACAGAGTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGa < 2:521543/149‑1 (MQ=255) ccTATAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTAATCCCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAgg < 1:743558/149‑1 (MQ=255) ccTATAAACAGATTTAAATCTTTGGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAgg < 1:1638758/149‑1 (MQ=255) | AATTTAGTACCGGTAGCATTAAATTCACCAATTAAAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGG > CP000730/707734‑708023 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |