| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP000730 | 614118 = | 122 (2.130) | coding (2430/2844 nt) | sdrC | Ser‑Asp rich fibrinogen/bone sialoprotein‑binding protein SdrC | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
CGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAG‑ATAGCGACTCAG‑ATTC‑TGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAG > CP000730/613986‑614251 | cGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAAACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAG‑ATAGCGa > 1:77509/1‑135 (MQ=255) tcatgttCGCATTGCGAACCAGACTCAGTGTGAGACGTAGATACGGATAGCGACTTAGACTTAGATACCGATTCAGATTCAGATAGCGACTGGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAG‑ATAGCGACTCa < 2:275089/129‑1 (MQ=12) tCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAG‑ATAGCGACTCa > 1:509628/1‑135 (MQ=255) tCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTAAGACAGTGATTCAGATTCAGACACAG‑AGAGCGATTCa > 2:513938/1‑135 (MQ=255) tCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCG‑ACAGCGACTcg > 2:177720/1‑134 (MQ=11) aGACTCGGATAGCCACTCGGATTCTGATTGCGACTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAG‑ATAGCGACTCAG‑a < 2:280320/135‑1 (MQ=18) gACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGCTTCAGATTCAGACTCCG‑ATAGGGACTCAG‑At > 2:135917/1‑135 (MQ=255) aCTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAG‑ATAGCGACTCAG‑Att < 1:71133/135‑1 (MQ=255) tCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGATTCAGATTCAGACCCCG‑ATAGCGACTCAG‑Attac > 2:144980/1‑133 (MQ=255) tCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGAGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCCG‑GTGCCGACTCAG‑ATTC‑t > 2:37612/1‑135 (MQ=18) 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CGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAG‑ATAGCGACTCAG‑ATTC‑TGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAG > CP000730/613986‑614251 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |