| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 736 total aligned reads displayed.
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aacgtctggcccTCTGTATCACTGGCACGATATAAATAGCTCCATTTTCCTTTTATTTTGATATACGTCTCATCAATACGCAATGTGTAATAGGGTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATATAATTggg < 2:252617/126‑1 (MQ=11) aaTGTATGTCACTCTGTATCAATGGCACGATATAAATAGCTCCATTTTCCTTTTATTTTGATATACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTggg < 2:291026/135‑1 (MQ=255) tgtatgtCCCTCTGTATCAATGGCACGATATAAATAGCTCCATTTTCCTTTTATTTTGATATACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTTGGGc > 1:644542/1‑135 (MQ=255) tatgtCCCTCTGCATCAATGGCACGATATAAATAGCTCCATTTTCCTTTTATTTTGATGTACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAACTTGGGGCat < 1:382422/135‑1 (MQ=255) tgtCCCTCTGTATCAATGTCACGATATAAATAGAACCATTTTCCTTTTATTTTGATATACGTCTCATCAATACGCCATTTATAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTAGTATAAAATTGGGGCatat > 1:128499/1‑135 (MQ=11) tgtCCCTCTGTATCAATGGCACGATATAAATAGCTCCATTTTCCTTTTATTTTGATATACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAACTGGGGAatat > 2:243327/1‑135 (MQ=11) | CTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAATGGCACGATATAAATAGCTCCATTTTCCTTTTATTTTGATGTACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCC > CP000730/36135‑36403 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |