| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP000730 | 2082368 = | 82 (1.260) | 3 (0.050) | 3/238 | NT | 3.9% | intergenic (+9/+616) | USA300HOU_1940/mapW2 | aminotransferase/cell surface protein MapW2 |
| ? | CP000730 | 2082406 = | 73 (1.230) | intergenic (+47/+578) | USA300HOU_1940/mapW2 | aminotransferase/cell surface protein MapW2 | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
ATTGAAAAATATTCAATTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTGTCAAACACTATACCTAATTAGTTTTATACATCTCTC > CP000730/2082228‑2082504 | aTTGAAAAATATTCAATTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCa < 2:293985/141‑1 (MQ=255) ttGAAAAATATTCAATTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCaa > 1:201398/1‑141 (MQ=255) ttGAAAAATATTCAATTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCaa > 1:217589/1‑141 (MQ=255) ttGAAAAATATTCAATTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGAGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCaa > 1:501240/1‑141 (MQ=255) ttGAAAAATATTCAATTGGTGTTATTGCACATAATGCAACAGACAATCGTAGAGCGTTTAGCTGTATAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGGGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCaa > 2:151562/1‑141 (MQ=255) tGAAAAATATTCAATTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAAc > 2:189274/1‑141 (MQ=255) ttttacttttcatctgtccgattttttgattttgttaggagagatgtataaaactaattaggtatagtgtttgacaagttgctgaataaaatatatcttatgatactttgaaagaaggaataattttaaaaaaaaaaAAcc < 1:710812‑M1/4‑1 (MQ=255) tttacttttcatctgtccgattttttgattttgttaggagagatgtataaacctaattaggtatagtgtttgacaagttgctgaataaaatatatcttttggtactttgaaggaaggaataatttttaaaataaaaAACCa < 1:65363‑M1/5‑1 (MQ=255) tttacttttcatctgtccgattttttgattttgttaggagagatgtataaaactaattaggtatagtgtttgacaagttgctgaataaaatatatcttatgatactttgaaagaaggaataattttaaaaataaaaAACCa < 1:354091‑M1/5‑1 (MQ=255) ttacttttcatctgtccgattttttgactttgttaggagtgatgtataaaactaattaggtatagtgtttgacaagtagctgaataaaatatatcttatgatactttgaaagaaggaataattttaaaaataaaaAACCaa < 2:231413‑M1/6‑1 (MQ=255) acttttcatctgtccgattttttgattttgttaggagagatgtataaaactaattaggtatagtgtttgacaagttgctgaataaaatatatcttatgatactttgaaagaaggaataattttaaaaataaaaAACCaata < 1:581802‑M1/8‑1 (MQ=255) acttttcatctgtccgattttttgattttgttaggagagatgtataaaactaattaggtatagtgtttgacaagttgctgaataaaatatatcttatgatactttgaaagaaggaataattttaaaaataaaaAACCaata < 2:75889‑M1/8‑1 (MQ=255) aaTATTCAATTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCaata < 2:495292/141‑1 (MQ=255) atatTCAATTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCaataa > 1:82590/1‑141 (MQ=255) atTCAATTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATc > 1:74932/1‑141 (MQ=255) cAATTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCtga > 2:602215/1‑141 (MQ=255) aaTTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACATATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCtgat < 1:95129/141‑1 (MQ=255) aaTTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCtgat > 2:380686/1‑141 (MQ=255) aTTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCtgatg < 1:703275/141‑1 (MQ=255) tgtTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTGTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTAAAAAAGCGATCAGTATGGCGACGTGATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTAt < 1:370938/141‑1 (MQ=255) gtTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATg > 1:393239/1‑141 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cAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAATCAATAATCTGATGAGTATTACGCGGATTATTGGttttt < 1:431784/141‑1 (MQ=255) atTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTtttttattt < 1:554767/141‑1 (MQ=255) atTCGTATTCCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTtttttattt > 2:733059/1‑141 (MQ=255) tCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATTCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTtttttattttt < 1:419448/141‑1 (MQ=255) tCGTAATTCGGTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACCTGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTtttttattttt < 1:52249/141‑1 (MQ=255) cGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTtttttattttta < 2:446332/141‑1 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1:231413/1‑140 (MQ=255) tAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTGTCagaaa > 1:253438/1‑137 (MQ=255) aaaGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCGACTTGTCAAacac > 1:290230/1‑141 (MQ=255) aaaGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTGTCAAacat > 2:419819/1‑140 (MQ=255) aGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCGTCAACTTGTCAAAAACta > 2:376744/1‑141 (MQ=255) gaaagaagctattattttaaacataaaaTACTCATCATCTGATGAGTATGCCGCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCATTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTGTCAAACACtata > 1:92474‑M1/29‑141 (MQ=255) 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2:392011/1‑141 (MQ=255) atgaCTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCATTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGGAACTTGTTAAAGATAATACCTAAt > 1:58462/1‑141 (MQ=255) tgaCTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTGTCAAACACTATACCTAAtt < 2:742704/141‑1 (MQ=255) cTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTGTCAAACACTATACCTAATTAGt < 1:512349/141‑1 (MQ=255) ttAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGTTTATTGGTTTTTTATTTTTATAATTATTTCTTCTTTCAAAGTATCATTAGATTTATTTTATTTTGCAACTTGTCAAACACTATACCTAATTAGtt > 2:65363/1‑141 (MQ=255) gATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTGTCAAACACTATACCTAATTAGTTTtat < 2:79757/141‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) | ATTGAAAAATATTCAATTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTGTCAAACACTATACCTAATTAGTTTTATACATCTCTC > CP000730/2082228‑2082504 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |