New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | = 1205323 | 104 (0.790) | 26 (0.270) +AGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAG |
8/218 | 6.1 | 27.4% | intergenic (+459/‑365) | yfiE/lspA | possible lactoylglutathione lyase/A8 family signal peptidase II |
? | CP000730 | 1426517 = | 82 (0.620) | intergenic (‑248/+724) | pstS/yitL | phosphate ABC superfamily ATP binding cassette transporter, binding protein/hypothetical protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
TACATAAAAAATTGTTAAGAAAATGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTTGATGACGGGTCCCTTC > CP000730/1426370‑1426662 | tACATAAAAAATTGTTAAGAAAATGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTaaaaaa < 2:809266/148‑1 (MQ=255) tACATAAAAAATTGTTAAGAAAATGTAAATATTAAATGTAAGTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTaaaaaa < 1:1314970/148‑1 (MQ=255) aactgaaaaaaTTGTTAAAAAAATGTAAAGATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGATTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGAACATAAATCCCTaaaaaa < 2:670208/143‑1 (MQ=255) aaaaaaTTGTTAAGAAAATGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAAcagc < 1:831878/148‑1 (MQ=255) aaaaaaTTGTTAAGAAAATGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAAcagc > 1:479153/1‑148 (MQ=255) aaaaTTGTTAAGAAAATGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAAcagcag < 2:741178/148‑1 (MQ=255) aaTTGTTAAGAAAATGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATAAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTa < 1:545507/148‑1 (MQ=255) tGTTAAGAAAATGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGa < 2:1120084/148‑1 (MQ=255) ttaaaGAAAA‑GTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATa > 2:585857/4‑148 (MQ=255) tAAGAAAATGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATaa > 1:1097788/1‑148 (MQ=255) gAAAATGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAAttt > 1:188576/1‑148 (MQ=255) gAAAATGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAAAAGCAGTAAGATAAttt > 2:497605/1‑148 (MQ=255) aaaaTGTACATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAAtttt < 1:1128260/148‑1 (MQ=255) aaaaTGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTTACAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAACTGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAAtttt > 2:1000982/1‑148 (MQ=255) aaaaTGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAAtttt > 2:537059/1‑148 (MQ=255) aaaaTGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAAtttt < 1:1201534/148‑1 (MQ=255) aaTGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCa < 2:1340924/148‑1 (MQ=255) tGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAAt < 1:451283/148‑1 (MQ=255) tGTAAATATTAATTTTTGTTAATCAAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAAt < 2:832840/148‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAg < 2:31164/148‑1 (MQ=255) tatTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGaaa < 2:521329/148‑1 (MQ=255) gatgaaTTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGaaa < 2:1410127/144‑1 (MQ=255) ttAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAat < 1:1203847/148‑1 (MQ=255) tttttGTTAATATAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCt < 1:29136/148‑1 (MQ=255) ttGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGTACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTAc < 2:619705/148‑1 (MQ=255) tAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTActgct > 2:167000/1‑148 (MQ=255) tAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATAACTTActgct > 2:543592/1‑148 (MQ=255) aaaaaaTATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTtctc < 1:1152075/148‑1 (MQ=255) aaaaaaTATTGCCTCCTTAGTAAACTTAAAATGCTTACTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGCTAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTtctc < 1:1250121/148‑1 (MQ=25) aaaaaaTTGTCTAATTATTAAAATTAAAATGATAAATAAAAAATCATCGAAATTTAAAAATAAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTa < 2:313470/148‑1 (MQ=18) aaaaTATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCGTACTGCTGTTCTCTa < 2:567047/148‑1 (MQ=255) aaaaTATTGCTTCAGTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCAGCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTa < 2:184564/148‑1 (MQ=255) aaaTATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTAt < 2:1056766/148‑1 (MQ=255) aaTATTGCTTCATAAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAACACATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATCAACCCATCAAAAACCATCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTAtt < 2:924992/148‑1 (MQ=25) aTTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACt > 1:812113/1‑148 (MQ=255) aTTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACt > 1:812426/1‑148 (MQ=255) aGTAAAAATAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACAAAAAAAAATAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCg < 2:1088722/148‑1 (MQ=21) gTAAAATTAAAATGGTTGATGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCGGTTCTCTATTTATACAATACTTCGt > 1:1034354/1‑148 (MQ=255) taaaattaaaatGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATCCAATACTTCGTa > 1:1125916/1‑148 (MQ=255) taaaattaaaatGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTa > 2:682953/1‑148 (MQ=255) aaaattaaaatGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTAt > 2:289779/1‑148 (MQ=255) aaaattaaaatGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTAt < 1:1169660/148‑1 (MQ=255) attaaaatGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAAATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGa > 1:463770/1‑148 (MQ=255) ttaaaatCCTTCCTGAAAAATCACCGAAATTAAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGaa < 1:447334/148‑1 (MQ=255) ataaaatGCATACTGAAAAATCATCGAAAGTTAAATATGAATAAAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGaa < 2:426417/147‑1 (MQ=255) aatGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTTGTATTGAATGGc < 1:959905/148‑1 (MQ=255) cTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCg > 2:28680/1‑148 (MQ=255) ggAAAAATCTTCGAAATTGAAAAAAGAAAACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTg < 2:1081026/147‑1 (MQ=14) cGAAATATAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTca < 2:807506/148‑1 (MQ=255) gAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTcac < 1:1303498/148‑1 (MQ=255) ttcaaatcagAAAACAAAAATGGCTGGGACACAAATCCCTAAAAAATCAGCATTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGGTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTa < 2:38690/139‑1 (MQ=17) tatGAATACAAAATTGGCTGAAACATAAATCCCTAAAACACCTACAGTAAGATCATTTTTATACGTAAAAAATCTAACTACTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTaa > 2:641566/1‑148 (MQ=17) tatGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCCCATTAATTTaa > 2:1327249/1‑148 (MQ=255) tatGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTATTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTaa > 2:151799/1‑148 (MQ=255) 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aaaaaTGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTAAAATTCtata > 2:706173/1‑148 (MQ=255) aaaaaTGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTAAAATTCtata > 2:972835/1‑148 (MQ=255) aaaaaTGGCTGGGACATAAATCACTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTAAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTTTAAAATTCtgta > 2:737492/1‑148 (MQ=255) aaaaTGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTAAAATTCTATaa > 2:484712/1‑148 (MQ=255) gggACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAAttt < 1:1272772/148‑1 (MQ=255) 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aaaaaCAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTTGATGACGGGTCCCtt > 2:744765/1‑148 (MQ=38) aaaaaCAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTTGATGACGGGTCCCtt > 1:413432/1‑148 (MQ=39) aaaaCAGCATGAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTTGATGACGGGTCCCTTc < 2:264164/148‑1 (MQ=255) | TACATAAAAAATTGTTAAGAAAATGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTTGATGACGGGTCCCTTC > CP000730/1426370‑1426662 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |