Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA CP000730 707,909 A→T M1M (TTG→ATG) † mntB ← ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*CP000730707,9090AT100.0% 467.7 / NA 144M1M (TTG→ATG) †mntBABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein
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                                                                                                                               ttttGTTTCTAACATACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTgaa             <  2:451458/148‑1 (MQ=255)
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                                                                                                                                  tGTTTCTAACATACGTTTATACCTCATAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTgtagaa          >  2:863210/1‑148 (MQ=255)
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                                                                                                                                   gTTTCTAACATACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTGAAGaaa         >  2:477506/1‑148 (MQ=255)
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                                                                                                                                         aaCATACGTTTATACCTCACAATGAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTGAAGAAAAAGAgg   <  1:1376744/148‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                          aCATACGTTTATTCCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACGTAATTAATTGTATACAAAACTGAGAATGTTTAGCATGTCAAGGAAATTCGTGATATAATATAGTCAATCTCTGTGAGTGGAAAGAATGTTAACTGGCGAAAAAGAGGa  <  2:417046/148‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                             |                                                                                                                                                
AAGACTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTGAAGAAAAAGAGGA  >  CP000730/707768‑708053

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑