Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*CP000730512,6430AG45.5% 41.4 / 225.0 179intergenic (+711/‑150)recR/rrs1recombination protein RecR/16S ribosomal RNA
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (50/47);  new base G (45/36);  total (96/83)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.52e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold.

Only 100 of 186 total aligned reads displayed.

GGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTATGAGCTAATCAAACATCATAA  >  CP000730/512504‑512783
                                                                                                                                           |                                                                                                                                            
   gaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTACATGTtgataa                                                                                                                                          <  1:743972‑M1/28‑1 (MQ=255)
     agttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggctaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATaaaa                                                                                                                                        <  1:493499‑M1/30‑1 (MQ=255)
             ttcgtagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttggtaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTAtaat                                                                                                                                >  2:492911‑M1/104‑141 (MQ=255)
             cTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaat                                                                                                                                >  1:615308/1‑141 (MQ=255)
              tgtaattAAGAAATTTTAAAGCCTGTATAGTATTAATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACCCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAAAAAATATAAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaatt                                                                                                                               <  2:922005/136‑1 (MQ=255)
               gttgttAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTTtatttt                                                                                                                              >  2:245725/1‑140 (MQ=255)
               gttgttAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGGTAATAAAGTGTAtaatta                                                                                                                              >  1:54783/1‑141 (MQ=255)
                ttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTAtaattaa                                                                                                                             >  1:245639‑M1/101‑141 (MQ=255)
                 tagcgtagatggtagccgaagttacgttccggtagagtagaactttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTAtaattaat                                                                                                                            >  1:457931‑M1/100‑141 (MQ=255)
                      aGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATATATAATTAATTCTTg                                                                                                                       >  1:528365/1‑141 (MQ=255)
                           tttGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGt                                                                                                                  <  1:580557/141‑1 (MQ=255)
                           tttGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATGTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGt                                                                                                                  <  2:421046/141‑1 (MQ=255)
                               aaaGCTTGTAAAGTATTAATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTACAATTTATTCTTGTCGGTAAGa                                                                                                              <  1:509098/141‑1 (MQ=255)
                               aaaGCCTTTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAAAAACACAAAAAAAGAAATAACTTGAATTACTAAAGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGATTTAAATGTTAATAAAATGTATaattaattaaaaaaaaaaaaa                                                                                                              <  2:748804/141‑14 (MQ=255)
                               aaaGCCTGTATAGTAGTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGa                                                                                                              >  1:739646/1‑141 (MQ=255)
                                tcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGaa                                                                                                             >  1:865778‑M1/85‑141 (MQ=255)
                                 aGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATACAATGTATAATTAATTATTGTCGTTAAGaaa                                                                                                            >  1:694092/1‑141 (MQ=255)
                                 aGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTCTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGaaa                                                                                                            >  1:54054/1‑141 (MQ=255)
                                     cttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggtaaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATg                                                                                                        <  1:342105‑M1/62‑1 (MQ=255)
                                       tataGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGaa                                                                                                      >  2:412070/1‑141 (MQ=255)
                                       tacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGaa                                                                                                      >  2:656685‑M1/78‑141 (MQ=255)
                                         cgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTGGGTAAGAAAAATGAACa                                                                                                    <  1:365148‑M1/66‑1 (MQ=255)
                                          gttctgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACAt                                                                                                   >  2:524361‑M1/75‑141 (MQ=255)
                                          gttacgatagaggagaacgtggtcagtcagttttttaatccaattatcgttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGAGAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTATGAAAAATGAACAt                                                                                                   >  2:946029‑M1/75‑141 (MQ=255)
                                           ttccgctagagtagaacgttgccaggccgttttttaatcaaattttggttaaaaaaaaaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAACGTTGATAAAATGAATAATTAATTCATGTCGGTAAGAAAACTGAACAtt                                                                                                  <  2:60482‑M1/68‑1 (MQ=255)
                                            tccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTg                                                                                                 >  2:950600‑M1/73‑141 (MQ=255)
                                            tatttattTGTTTAGGCAAATAAAACAATTATACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTg                                                                                                 <  1:300810/141‑1 (MQ=255)
                                            tatttattTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTg                                                                                                 <  2:594475/141‑1 (MQ=255)
                                                  tttGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACt                                                                                           <  1:102679/141‑1 (MQ=255)
                                                  tagagtagaacgttgccaggcagttttttgatcaaattttggttaaaaaataaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACt                                                                                           >  1:798434‑M1/67‑141 (MQ=255)
                                                  tagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACt                                                                                           >  1:853091‑M1/67‑141 (MQ=255)
                                                  tagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACt                                                                                           >  1:848062‑M1/67‑141 (MQ=255)
                                                  agagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAAGGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGTTAAGAAAAATGAACATTGAAAACt                                                                                           >  1:726218‑M1/67‑141 (MQ=255)
                                                   ttgttgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGGAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATAAAAATTGAAAACTg                                                                                          >  2:874142/1‑141 (MQ=255)
                                                   ttgttgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTg                                                                                          >  2:802153/1‑141 (MQ=255)
                                                   ttgttgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTg                                                                                          >  1:989926/1‑141 (MQ=255)
                                                   ttgttgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTg                                                                                          >  2:368258/1‑141 (MQ=255)
                                                        gaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGa                                                                                     <  1:807455‑M1/81‑1 (MQ=255)
                                                          ggCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACa                                                                                   >  1:950385/1‑141 (MQ=255)
                                                          ggCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTAAAATACTAAAGAAAATTAATTATAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTATTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACAGAATAACa                                                                                   >  2:315529/1‑141 (MQ=255)
                                                           gCAAACAATACAACTCAACTTTAGAAATAAATTGAATTACTAACGAAAAAAAATAAAAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAACAAGTTGTTTTGTTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACaa                                                                                  <  2:391763/141‑1 (MQ=255)
                                                           cgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACaa                                                                                  >  1:909750‑M1/58‑141 (MQ=255)
                                                              aacaaaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAatat                                                                               >  1:390401/1‑141 (MQ=255)
                                                              aacaaaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGAAAatat                                                                               >  1:298772/1‑141 (MQ=255)
                                                                 caggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTc                                                                            <  1:647128‑M1/90‑1 (MQ=255)
                                                                  aggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCa                                                                           >  1:964564‑M1/51‑141 (MQ=255)
                                                                  aaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCa                                                                           <  1:638216/141‑1 (MQ=255)
                                                                  aaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACAAACGAAAATCAATTCTAAAAATTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCa                                                                           <  1:376878/141‑1 (MQ=255)
                                                                      agttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGt                                                                       >  1:808861‑M1/47‑141 (MQ=255)
                                                                      aggtttttaataaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGt                                                                       >  1:104790‑M1/47‑141 (MQ=255)
                                                                       gctttctaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGtt                                                                      >  1:465330‑M1/46‑141 (MQ=255)
                                                                       actcaactTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGtt                                                                      >  2:10863/1‑141 (MQ=255)
                                                                          ttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAAt                                                                   <  2:64026‑M1/99‑1 (MQ=255)
                                                                          ttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAAt                                                                   >  1:417639‑M1/43‑141 (MQ=255)
                                                                          ttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAAAAAAATGAACATTGAAAACTGAATAACAATATGTCAACGttatt                                                                   <  2:264593‑M1/99‑3 (MQ=255)
                                                                            ttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTc                                                                 >  2:42588‑M1/41‑141 (MQ=255)
                                                                               tAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaa                                                              <  2:299227/141‑1 (MQ=255)
                                                                               tAAGAAATAACTTAAATTACTAATGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAATACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaa                                                              <  1:245924/141‑1 (MQ=255)
                                                                                 aGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTAAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAAAAAAATGAACATTGAAAACTAACTGACAATATGTCACCGTAAATTCCaaaa                                                            >  2:28011/1‑141 (MQ=255)
                                                                                  aaattttggttaaaaaataaaaaggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaaa                                                           >  2:732729‑M1/35‑141 (MQ=255)
                                                                                   aattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaaaa                                                          <  2:515355‑M1/108‑1 (MQ=255)
                                                                                      tttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGt                                                       <  2:24299‑M1/111‑1 (MQ=255)
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                                                                                         ggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAAc                                                    <  2:18861‑M1/114‑1 (MQ=255)
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                                                                                                               gataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTa                              <  1:443306‑M1/136‑1 (MQ=255)
                                                                                                                   aAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTAAAAACATTATTTAGTAt                          <  1:778781‑M1/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                                    aaaaaGTTATTTACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTAtt                         <  2:309514/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                        aGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTATg                     <  1:929480/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                         gTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGATACAAACATTATTTAGTATTTATGa                    >  2:93674/1‑141 (MQ=255)
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                                                                                                                              tGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTATGAGCTaa               >  2:407804/1‑141 (MQ=255)
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                                                                                                                                           |                                                                                                                                            
GGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTATGAGCTAATCAAACATCATAA  >  CP000730/512504‑512783

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑