| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,289,325 | C→A | Q55H (CAG→CAT) | ybbP ← | hypothetical membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,289,325 | 0 | C | A | 98.8% | 242.4 / NA | 87 | Q55H (CAG→CAT) | ybbP | hypothetical membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base A (51/33); total (54/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCAGTAAATCAAGGATACTCGTTACAATTTTTAACGTACTGAG > CP000730/2289187‑2289462 | aaaGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATctgatg > 2:896448/1‑141 (MQ=255) aaGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATAATACTTATCtgatga > 1:800826/1‑141 (MQ=255) tACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCCGTCAAGTTCAATATCATAATAATCTAGTGACCaa > 2:37982/1‑141 (MQ=255) acttctTCCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTATTTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCTCATTGAATAACGATATCGAATAATTTATATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAAt < 2:19744/138‑1 (MQ=255) ccTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGCCCAATa > 1:262007/1‑141 (MQ=255) ccTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATa > 2:270676/1‑141 (MQ=255) ctctACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATaa > 2:515999/1‑141 (MQ=255) aaGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTTGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCAGTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGCTGAAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTAc < 1:436883/141‑1 (MQ=255) gttgttCTAACGCACGCCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTa > 1:553190/1‑141 (MQ=255) ttgttCTAACGCACGTCTAGTTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATAGCATACTTATCTGATGACCAAGAACAATTACTaa > 2:557170/1‑141 (MQ=255) ttgttCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTaa > 2:66154/1‑141 (MQ=255) tttCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATCTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTGATCTGATCACCAATAACAATTACTAata < 1:643275/140‑1 (MQ=255) tcgaaCGCACGTGTAACTTCCTGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATTCTCCCCATTGAATAACGATATCGAATAAGTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATc < 2:372214/138‑1 (MQ=255) aCGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGACTAATTTAGACGTTGCAGTCAAGTGCACTATCATACTTATCTGATGACCACTAACACTTGTTAATATCCCCTTGAg > 1:422358/1‑141 (MQ=255) tattttttgatgggAATATTACTATTCAATCCAATCCCCCTCTTTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATGACTTCTATCCCTTTaattaatt < 2:505673/129‑1 (MQ=255) tAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTTAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAAtt < 1:999377/141‑1 (MQ=255) tAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAAtt < 2:704355/141‑1 (MQ=255) aaTTTCTGTTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTg < 2:704016/141‑1 (MQ=255) aaTTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAATCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAACAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTg < 2:419962/141‑1 (MQ=255) cTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATGGGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCg > 1:819229/1‑141 (MQ=255) tGGTTGGAATATTACTATTAGAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGc > 1:601167/1‑141 (MQ=255) tGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGCCGAATACCAAGTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGc > 1:183061/1‑141 (MQ=255) tGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTATTATCCCTTTAAATAATTGAATCgt > 1:873896/1‑140 (MQ=255) tGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTTTATCGc > 2:99081/1‑141 (MQ=255) tGGTTGGAATATTACGATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGc > 1:739946/1‑141 (MQ=255) gTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCtt < 2:571665/141‑1 (MQ=255) ggAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTat > 1:990656/1‑140 (MQ=255) ggAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAg > 1:855265/1‑141 (MQ=255) atTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTccc < 1:387375/141‑1 (MQ=255) tACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCtt > 2:563959/1‑141 (MQ=255) tcaacgCTAATACCCCCCATTTAATAACGTTATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGa < 1:37982/136‑1 (MQ=255) tAAAGCTCATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTCAGTACGTGTTTCGCTTTAGTTCTCTTAAAGAc < 1:731518/141‑1 (MQ=255) aaGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCTCTTTAGTTCCCTTAAAGACCg > 1:336697/1‑141 (MQ=255) aaGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCg > 1:939790/1‑141 (MQ=255) aaGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCg > 2:804884/1‑141 (MQ=255) aaGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAAACCg > 2:260923/1‑141 (MQ=255) aaGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCACTTAAGTTCCCTTAAAGAcgg > 1:178387/1‑139 (MQ=255) aGCTTATACCCCCTATTGAATAACGATATAGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGt < 1:144805/141‑1 (MQ=255) gCTAATACCCCCCAGTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGtg > 1:551770/1‑141 (MQ=255) aTACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGtgatga > 1:44628/1‑141 (MQ=255) aTACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGAAGTAAACTGACTTAGCATACTTATCTGTGGATCAAGAACAATTACTAATATCCCTTTAAGAAATTGTATCGCTTTATTTCCCTTAAAGACCGtgatga > 1:234209/1‑141 (MQ=255) tACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAACGACCGTGATgag < 1:515999/141‑1 (MQ=255) ccccccATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCGATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGagaa > 1:657709/1‑141 (MQ=255) ccccccATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGagaa > 1:489394/1‑141 (MQ=255) cccccATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTTTATCGCTTTATTTCCCTTAAAAACCGGGATGagaaa > 2:368964/1‑140 (MQ=255) ccccAATGAATAACGATATTGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGagaaga < 1:306800/141‑1 (MQ=255) cccATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGAt > 2:12141/1‑141 (MQ=255) cATTGAATAACGATATCGAATGGTTAAGATTCTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATTTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATGATATCACTTTAGTTCCCTTAAAGTCTGTGACAAGAAGTTaa > 2:456390/1‑141 (MQ=255) cATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTACTATCCCTTTAATTAATTGTATCGTCTTAGTTACCTTAAAGACCGTGCTaataaaataa > 1:44250/1‑141 (MQ=255) aTTCAATAATGCTATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTTATGTCCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATaaa < 1:319109/141‑1 (MQ=255) ttGAATAACGATATCGAAGAATTTAGATGTTGCAGTCAAGATCAATATCATACTTAACTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATAGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAGGATAAAg > 2:76630/1‑141 (MQ=255) gAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTa > 1:283874/1‑141 (MQ=255) gAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATAACATACTCATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAAACGATAAAGTa > 2:112662/1‑141 (MQ=255) gAATAACGATATCGAATAATGTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCCTAAAGTAATTGTATCGCTTTAATTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGCTAAAGTa > 2:545594/1‑141 (MQ=255) aTAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCCTACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGTTGGGAAGATAAAGTACa > 1:260534/1‑141 (MQ=255) gATACCGAATAATTTAAATACTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCCTATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCa < 1:240966/141‑1 (MQ=255) tatCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTCAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCaaa > 2:683924/1‑141 (MQ=255) aataatTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCACTAACAATTACTAATATTCCTTTAAGTAATTGAATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAAATAACGTACATACCAAAccaac > 2:25137/1‑137 (MQ=255) ataatTTAGATGTTGCAGTCCAGTTCAATATCATACTTATCTGACGACCAATAATAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCa < 2:437665/141‑1 (MQ=255) ataatTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCATAATCATATTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCa < 2:902199/141‑1 (MQ=255) ataatTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATACCAATTACTAATATCACTTTAAGTAATTCTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAAACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACAAAACTATCa > 1:949291/1‑141 (MQ=255) ataatTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGGCCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCa < 1:688055/141‑1 (MQ=255) ataatTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCa < 1:789429/141‑1 (MQ=255) ataatTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCa < 1:810355/141‑1 (MQ=255) taatTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCAg > 2:289817/1‑141 (MQ=255) aatTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATCCTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCAGt > 1:240704/1‑141 (MQ=255) tAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCAGTAAAt < 2:553190/141‑1 (MQ=255) gATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTTCCTTAAAGACTGTGATGAGAAGTTAACGTACATTGCAAACTATCAGTAAATCa > 2:594842/1‑141 (MQ=255) gATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATCGAGTACATACCAAACTATCAGTAAATCa < 2:551770/141‑1 (MQ=255) gATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCAGTAAATCa > 2:103250/1‑141 (MQ=255) gCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGAGAAAGTACATACCAAACTATCAGTAAATCAAGGATa > 1:273204/1‑141 (MQ=255) gTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCAGTAAATCAAGGATACTc > 1:964685/1‑141 (MQ=255) tCAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCAGTAAATCAAGGATACTCg > 1:675170/1‑141 (MQ=255) cAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCAGTAAATCAAGGATACTCGt < 2:515123/141‑1 (MQ=255) cAAGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCAGTAAATCAAGGATACTCGt < 2:224258/141‑1 (MQ=255) aaGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTACGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCATTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCAGTAAATCAAGGATACTCGtt < 1:557170/141‑1 (MQ=255) aaGTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTACATTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCAGTAAATCAAGGATACTCGtt < 1:66154/141‑1 (MQ=255) gTTCTATAACATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGCCAAGACAAAGTACATACCAAACTATCAGTAAATCAAGGATACTCGTTAc < 2:652212/141‑1 (MQ=255) gTTCAATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCAGTAAATCAAGGATACTCGTTAc < 1:967437/141‑1 (MQ=255) tatCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCAGTAAATCAAGGATACTCGTTACAAtttt < 1:12141/141‑1 (MQ=255) aTACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCAGTAAATCAAGGATACTCGTTACAATTTTTAAc > 1:246129/1‑141 (MQ=255) aTCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCAGTAAATCAAGGATACTCGTTACAATTTTTAACGTACTg > 1:903866/1‑141 (MQ=255) aTCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCAGTAAATCAAGGATACTCGTTACAATTTTTAACGTACTg > 1:613185/1‑141 (MQ=255) tCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGCAGATAAAGTACATACCAAACTATACGTAAATCAAGGATACTCGTTACAATTTTTAACGTACtca > 2:506991/1‑139 (MQ=255) tCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTTTCAGTAAATCAAGGATACTCGTTACAATTTTTACCGTGCTGa > 1:324406/1‑141 (MQ=255) tCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCAGTAAATCAAGGATACTCGTTACAATTTTTAACGTACTGa > 1:55587/1‑141 (MQ=255) tCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCAGTAAATCAAGGATACTCGTTACAATTTTTAACGTACTGa > 1:673632/1‑141 (MQ=255) tCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCAGTAAATCAAGGATACTCGTTACAATTTTTAACGTACTGa < 2:283874/141‑1 (MQ=255) tCTGATGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCAGAAAATCAAGGATACTCGTTACAATTTTTAACGTACTGa > 1:673600/1‑141 (MQ=255) ctgatgACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCAGTAAATCAAGGATACTCGTTAAAATTTTTAACGTATTGAg > 2:758567/1‑141 (MQ=255) | AAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAGATAAAGTACATACCAAACTATCAGTAAATCAAGGATACTCGTTACAATTTTTAACGTACTGAG > CP000730/2289187‑2289462 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |