BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	CP000730	2,337,959	C→T	intergenic (‑125/‑119)	adhR ← / → USA300HOU_2196	possible MerR family transcriptional regulator/hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	CP000730	2,337,959	0	C	T	100.0%	415.4 / NA	123	intergenic (‑125/‑119)	adhR/USA300HOU_2196	possible MerR family transcriptional regulator/hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (87/36); total (87/36)

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TAGTTTTCATTGCGACTATCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTACATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGAAAATTTGGGTGA  >  CP000730/2337825‑2338096

tAGTTTTCATTGCGACTATCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTAAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAAGATTTTATATTTCa                                                                                                                                     >  2:716336/1‑141 (MQ=255)

    tttCATTGCGACTATCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGt                                                                                                                                 >  1:420976/1‑141 (MQ=255)

      tCATTGCGACTATCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATCTTTAATCAttt                                                                                                                               >  2:32625/1‑141 (MQ=255)

       cATTGCGACTATCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGtttt                                                                                                                              <  1:910406/141‑1 (MQ=255)

       cATTGCGACTATCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGtttt                                                                                                                              >  2:692128/1‑141 (MQ=255)

           gCGACTATCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCCTCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTGACATTTTATATTTCATCGTTTTTAAt                                                                                                                          >  1:600497/1‑141 (MQ=255)

           gCGACTATCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAACTTTAAATAGG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAAt                                                                                                                          >  1:673297/1‑141 (MQ=255)

           gCGACTATCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATTTTTCATAGTTTTTAAt                                                                                                                          >  1:359542/1‑141 (MQ=255)

                     tttCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTaaaa                                                                                                                >  2:590266/1‑141 (MQ=255)

                     tttCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTaaaa                                                                                                                >  1:23193/1‑141 (MQ=255)

                      ttCAGTTATGTTTCGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTaaaaa                                                                                                               <  2:386849/141‑1 (MQ=255)

                          gTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGt                                                                                                           >  1:753035/1‑141 (MQ=255)

                          gTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGt                                                                                                           >  1:207170/1‑141 (MQ=255)

                              tGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TATCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTTATTACTTTAAAAATTGTATaa                                                                                                       >  2:92690/1‑141 (MQ=255)

                                      cgtcTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAata                                                                                               >  2:389513/1‑141 (MQ=255)

                                      cgtcTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAata                                                                                               >  1:478691/1‑141 (MQ=255)

                                        tcTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATAtt                                                                                             <  2:502438/141‑1 (MQ=255)

                                        tcTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATAtt                                                                                             >  1:344642/1‑141 (MQ=255)

                                        tcTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATAtt                                                                                             >  1:821104/1‑141 (MQ=255)

                                        tcTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATAtt                                                                                             <  1:634326/141‑1 (MQ=255)

                                        tcTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATAtt                                                                                             >  1:433125/1‑141 (MQ=255)

                                            aaGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTaaa                                                                                         >  2:922994/1‑141 (MQ=255)

                                               tAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTATATTACTCAAATTTCAATTTGAGAACTTTTTAACCATATTGTA‑TTCTTCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAACGTTTAAAATg                                                                                      <  1:727769/141‑1 (MQ=255)

                                                aaTGTTGACTTACATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATCTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGa                                                                                     <  2:735226/141‑1 (MQ=255)

                                                          tatataTTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACt                                                                           <  1:512546/141‑1 (MQ=255)

                                                               atTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTACAATTTTTATAACTTAACTATTTAAAATGATATAATCACTAAgtt                                                                      >  2:594753/1‑139 (MQ=255)

                                                               atTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGAt                                                                      >  2:162504/1‑141 (MQ=255)

                                                               atTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGAt                                                                      >  1:255976/1‑141 (MQ=255)

                                                               atTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGAt                                                                      >  1:975461/1‑141 (MQ=255)

                                                               acggTCATCTTCGTTTGAATACTGCTTATTGTATTACTCAAATTTAAATTGG‑TCCCTTTGTTAAAATTTTATATTTCATCGTTTATATTAACGTTACAAATTTTATAACTGACATATTTAAAATGTATTAAGCACTGAGAt                                                                      >  2:787743/4‑141 (MQ=255)

                                                                ttGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTATTTACTTTAAGCTTTGTGTAATTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGAtt                                                                     >  1:673136/1‑141 (MQ=255)

                                                                 tGTCATCTTCGTTTGAGTACTTCTTATTTTATTACTCAGATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGAttt                                                                    >  1:554522/1‑140 (MQ=255)

                                                                 tGTCATCTTCGTTTGAGTACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTg                                                                    >  1:492864/1‑141 (MQ=255)

                                                                 tGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTg                                                                    >  1:418332/1‑141 (MQ=255)

                                                                    cATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGata                                                                 >  1:279724/1‑141 (MQ=255)

                                                                     aTCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGTTTTAATCACTatgtttttttt                                                                >  2:549728/1‑131 (MQ=255)

                                                                      tCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTTTTTTTTTTTATTTCATCGATTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGGTTTTATCACATAGATTGttaat                                                               >  2:820090/1‑141 (MQ=255)

                                                                      tCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGataat                                                               >  1:852860/1‑141 (MQ=255)

                                                                         tCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATAtt                                                            >  1:898664/1‑141 (MQ=255)

                                                                         tCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATAtt                                                            >  1:13108/1‑141 (MQ=255)

                                                                         tCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATAtt                                                            >  1:13261/1‑141 (MQ=255)

                                                                          cGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTTTTTTTTTTTATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAATATTGATAATAttt                                                           >  2:262637/1‑141 (MQ=255)

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                                                                          cGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATAttt                                                           >  1:296152/1‑141 (MQ=255)

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                                                                           gTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCCCTAAGATTGATAATATTTa                                                          >  1:203497/1‑141 (MQ=255)

                                                                           gTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATATTTTTTa                                                          >  2:811159/1‑141 (MQ=255)

                                                                           gTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTa                                                          >  2:344304/1‑141 (MQ=255)

                                                                           gTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTa                                                          >  1:782227/1‑141 (MQ=255)

                                                                           gTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTa                                                          >  1:245226/1‑141 (MQ=255)

                                                                           gTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGAACATATTTa                                                          >  1:465166/1‑141 (MQ=255)

                                                                            tttGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATGTAATCACTAAGATTGATAATATTTaa                                                         >  1:608849/1‑141 (MQ=255)

                                                                               gAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAAttt                                                      >  1:835651/1‑141 (MQ=255)

                                                                               gAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAAttt                                                      >  1:7654/1‑141 (MQ=255)

                                                                               gAATACTGCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTATTTTTTTTTTTATATCATCATATTTATTTATTTTAAAAAGGCCAGAACAAAAAGATTGAAAATGATTTATTCTCTTATATTGATTATATTTAGttt                                                      >  2:700909/1‑141 (MQ=255)

                                                                                aaTACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAAtttt                                                     >  2:382621/1‑141 (MQ=255)

                                                                                  tACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAAtttttt                                                   >  1:279485/1‑141 (MQ=255)

                                                                                   aCTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTGTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTg                                                  >  1:798722/1‑141 (MQ=255)

                                                                                     ttcttATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTTTCTTTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTTAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATATTCCTTATGTTTGATAATATTTAAttttatatt                                                >  2:149226/1‑136 (MQ=255)

                                                                                     ttcttATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTCATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTTATAATATTTAAttttttact                                                >  2:244781/1‑138 (MQ=255)

                                                                                     ttcttATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGGTTGATAATATTTAATTTTTTGaa                                                >  2:111025/1‑141 (MQ=255)

                                                                                     ttcttATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATAACTAAGATTGATATTATTTAATTTTTTTaa                                                >  2:591143/1‑141 (MQ=255)

                                                                                     ttcttATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCCCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAACATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTATTTTaa                                                >  2:300960/1‑141 (MQ=255)

                                                                                      tcttATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGaaa                                               <  2:515935/141‑1 (MQ=255)

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                                                                                                               tttG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTGAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGt                      >  1:197684/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                               tttG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGt                      >  2:648023/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                               tttG‑TCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGt                      >  1:530062/1‑141 (MQ=255)

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                                                                                                                       tttttttAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGAGTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCgg               <  2:18530/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                       ctTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCgg               <  1:684529/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                            ttAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGAAAAt          >  2:811763/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                 aTTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGAAAATTTggg     <  1:281333/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                  ttttATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGAAAATTTGGGt    <  2:673297/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                   tttATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAGATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGAAAATTTGGGTg   >  2:657663/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                   tttATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTTTTTATTTTTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGAAAAATTGGGTg   >  2:871450/1‑141 (MQ=255)

TAGTTTTCATTGCGACTATCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTG‑TCTCTTTTTTAACATTTTACATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGAAAATTTGGGTGA  >  CP000730/2337825‑2338096

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 12 ≤` `ATCG/ATCG` `< 13 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`