| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 36133 = | 1690 (13.360) | 8 (0.070) | 4/284 | 6.9 | 0.49% | coding (419/675 nt) | tpn | IS431mec transposase |
| ? | CP000730 | 36148 = | 1642 (13.530) | coding (404/675 nt) | tpn | IS431mec transposase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
TATATCGTGCCATTGATGCAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP000730/36286‑36133‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaaggtGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAATGGCACGATATAAATAGCTCC > CP000730/36148‑36295 TATATCGTTCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACG < 2:1275750/149‑1 tgATCGTGCCATTAATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGA < 1:569937/147‑1 agtgCGTGCCATTGATGCAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGA < 2:486499/145‑1 ATATCGTGCCATTGATGCAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAAGGAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGA < 1:651430/149‑1 ATATCGTGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGA > 1:758108/1‑149 ATATCGTGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGA > 1:1161777/1‑149 ATATCGTGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGA > 1:1166953/1‑149 ATATCGTGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGA > 1:518204/1‑149 ATATCGTGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGA < 1:127180/149‑1 ATATCGTGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTATCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGA > 2:173466/1‑149 tactGTGCCATTGATGCAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAA < 1:67399/145‑1 tacCGTGCCATTGATGCAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAA < 1:1216757/146‑1 tacCGTGCAATTGATGCAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAA < 2:846446/146‑1 aATCGTGCCATTGATGCAGAGGGACATACATTAGAAATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAA < 1:294277/148‑1 aATCGTGCAATTGATACAGAGGGACAGACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGATTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAA < 1:1151350/148‑1 TATCGTGCCATTGATGCAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAA < 1:18159/149‑1 TATCGTGCCATTGATGCAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAA > 2:1188971/1‑149 TATCGTGCCATTGATGCAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAA < 2:808865/149‑1 TATCGTGCCATTGATGCAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAA < 2:793907/149‑1 TATCGTGCCATTGATGCAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAAGCACCCTCAAAGAA > 2:1196202/1‑149 TATCGTGCCATTGATGCAGAGGGACAGACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCAAATGCGTTTAGCAAACGTCTCATTAAACAATGTGGTAAACCTCAAAAGTTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAA < 1:818346/149‑1 TATCGTGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAA > 2:462975/1‑149 TATCGTGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAA > 1:1274343/1‑149 TATCGTGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTACAATGTAACAAGTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCACCGAA > 1:38778/1‑149 TATCGTGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGAAATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCACCGAA > 1:532242/1‑149 ATCGTGCCATTGATGCAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAG > 1:710899/1‑149 ATCGTGCCATTGATACAGGGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAG < 1:1348840/149‑1 ATCGTGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACTAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGCTAAGCATCAAAAGGTAGTTACAGATCATGCACCTTCAACGAAG > 1:945190/1‑149 ATCGTGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAG > 1:835459/1‑149 ATCGTGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACATTCAACGAAG > 1:1188828/1‑149 ATCGTGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATGAGGCACCTTCAACGAAG > 2:897340/1‑149 ATCGTGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAG > 1:186990/1‑149 TCGTGCCATTGATGCAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACACTTTGGTAACCCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGG > 2:1267725/1‑149 TCGTGCCATTGATGCAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGG > 1:242924/1‑149 CGTGGCATTGATGCAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCACAAAGAAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGT < 2:617725/149‑1 CGTGCCATTGATGCAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGT < 1:205574/149‑1 CGTGCCATTGATGCAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTAACGCTCAGGCACCTCCAACGAAGGa > 2:1265943/1‑148 CGTGCCATTGATGCAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGGTTATCAAACGGCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGa > 1:353131/1‑148 CGTGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCACAAAAGGTAGTTACAGCTCAGGCACCTTAAACCAAGGc > 2:854257/1‑148 CGTGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGa > 2:1027997/1‑148 CGTGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATGTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGc > 1:992394/1‑148 GTGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGca > 2:874526/1‑147 GTGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGca < 1:786259/149‑3 gGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGcag < 1:68975/148‑4 TGCCATTGATGCAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAGCGGAGGTGt < 2:229732/149‑2 TGCCATTGATACAGAGGGACATACATTCGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGcag > 2:290471/1‑146 TGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGcag < 2:621402/149‑4 TGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTAAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGcac > 1:473658/1‑146 TGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAACATATGCGGTTATCAAACGTGTCATTAAACAAATTGGTAAACCTCAAAAGGTAAATACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGatag > 2:516123/1‑145 TGCCATTGATACAGAGGGACATACATAAGAGAATTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGcag < 2:355282/149‑4 GCCATTGATACAGAGGGCCATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAAAGAGATAATAATTCAACAAATACGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGGACCTTCAACGAAGGcagc > 2:611470/1‑145 GCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGcagc > 1:1018309/1‑145 GCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGcagc < 2:173583/149‑5 GCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGcagc > 1:218591/1‑145 GCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGcagc > 2:979601/1‑145 GCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGcagc < 2:771974/149‑5 GCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGcagc < 1:912326/149‑5 GCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATGTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATAAGGAACCTTCAACTAAGGcaga > 1:622664/1‑145 GCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATCCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCCGGCACCTTCAACGCAGGcagc > 2:1070025/1‑145 TTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGAGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTAGAGGACGGGCAGCTTCAACGAAGGcggcaatg > 1:630054/1‑141 GATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGAGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCATGCACCTTCAAAGAAGGcagccatagc > 2:1302538/1‑139 ataCAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGcaccaatggtt > 2:437157/4‑138 CTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTGTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCCTATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATGTCTCATa > 2:98632/1‑148 GCACCTTCAACGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATGGCA > 2:818268/1‑149 GCACCTTCAACGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATGGCA > 2:544503/1‑149 GCACCTTCAACGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAATGGCA > 1:202623/1‑149 ttttgttaAAGGTGCCTGATTTTTTATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATGGCACGAT < 1:917802/141‑1 tcttttatGGTGCCTGATCTGAAACTACCTTTGAAGGCTTACCAAATTGTATAACGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATGGCACGATAT < 2:1220259/141‑1 tgcAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAATGGCACGATATAAAa > 2:1168812/4‑148 taatGTGCCTGATCTTTAATGTACTTTTGATGTTTAACAAATTGTTTAATGAGACGGTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATGGCACGATATAAATA < 1:538942/145‑1 gcAGGTTCCTGATCTGTAATTAACTTTTGAGGTTTACCATATTGTTTTTCGCCACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAATGGCACGATATAAATA < 1:373009/147‑1 GAAGGTGCCTGATCTGTATCTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATGGCACGATATAAATA < 1:235029/149‑1 GAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAATGGCACGATATAAATA < 1:1013873/149‑1 GAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATATCGTTGCTTAAGCAACCCAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATGGCAAGATATAAATA > 2:379573/1‑149 GAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATGGCACGATATAAATA > 1:430601/1‑149 GAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATGGCACGATATAAATA < 1:979147/149‑1 GAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATGGCACGATATAAATA > 1:452447/1‑149 GAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATGGCACGATATAAATA < 1:869829/149‑1 AAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATGGCCAGATATAAATAc > 2:479494/1‑148 AAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAATGGCACGATATAACTAG > 2:1187957/1‑149 AAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAATGGCACGATATAAATAG > 2:128415/1‑149 AAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCCCTGGATCAATGGCACGAAATAAATAG > 2:214931/1‑149 AAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATGGCACGATATAAATAG < 1:1208698/149‑1 AAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGACGATCATCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATGACACGATATACATgg > 2:953678/1‑147 AAGGTGCCTAATCTGTAATTACCTTTTGATTCTTACTAAATTGTTTAATGGGACGGGTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATGGCACGATATAAATAG < 1:179352/149‑1 AGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAATGGCACGATATAAATAGC > 1:1104320/1‑149 AGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATGGCACGGTATAAATAGC > 1:704046/1‑149 AGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATGGCACGATATAACTAac > 2:777690/1‑147 AGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATGGCACGATATAAATAGC > 1:699438/1‑149 GGTGCCTGATCTTTAACTCGCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATCAGACGTTTGATAAACGCATATGCTTAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATGGCAAGCTATAAATAGCT < 2:1234964/149‑1 GGTGCCTGATCTGTAATTACCCTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATGGCACGATATAAATAGCT < 2:194262/149‑1 GGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGCGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATGGCACGATATAAATAGCT < 2:1100667/149‑1 GGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATTTATGTCCCTCTGTCTCAATGGCACGATTTGAATAGCT > 2:726243/1‑149 GGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATGGCACGATATAAATAGCc > 2:267511/1‑148 GTGCCTGATCTTTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAATGGCACGATATAAATAGCTC < 2:1316063/149‑1 GTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAATGGCACGATATAAATAGCTC < 1:1330293/149‑1 GTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAATGGCACGATATAAATAGCTC < 1:157289/149‑1 GTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGGCCCTCTGCATCAATGGCACGATATAAATAGCgc > 1:1078851/1‑147 GTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATGGCACGATATAAATAGCTC < 2:1054135/149‑1 TGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATACTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATGGCACGATATAAATAGCTCC > 2:900449/1‑149 TATATCGTGCCATTGATGCAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP000730/36286‑36133‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaaggtGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAATGGCACGATATAAATAGCTCC > CP000730/36148‑36295 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |