| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,646,189 | G→C | A155G (GCA→GGA) | pepP ← | M24B family Xaa‑Pro dipeptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,646,189 | 0 | G | C | 99.1% | 349.7 / NA | 105 | A155G (GCA→GGA) | pepP | M24B family Xaa‑Pro dipeptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base C (41/63); total (42/63) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.00e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
TTTCAATAATTTTATCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTGCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGATATACGGCTTTTAT > CP000730/1646043‑1646333 | tttCAATAATTTTATCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGcctcct < 2:704831/149‑1 (MQ=255)tttCAATAATTTTATCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGcctcct < 2:756968/149‑1 (MQ=255) ataatTTTATCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGGCTCCTTTTac > 1:352902/1‑149 (MQ=255) ataatTTTATCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCATTTAATTCTTTTTCATTAATGCCTCCttttgc > 1:586433/1‑147 (MQ=255) ttttATCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTacaaca > 2:799269/1‑149 (MQ=255) tttATCACTTGCAATACCAGTTGGTAATGCACCTCTATGTTCATATGCTAATATCCTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTATCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAg < 1:178804/149‑1 (MQ=255) tttATCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGACGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTCGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTTATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAg < 1:601203/149‑1 (MQ=255) tatatcTTGCACCACCATGTGTTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTCTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGtt < 2:921467/144‑1 (MQ=255) tATCACTTGCCACCCCCTGTGGTCATGCCACCATCTGACCCAATCCTGCAAACTTATCCAATGAGTATCCATCTACGCCTAAGT‑‑CTAGCACTGTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGtt < 2:116533/149‑1 (MQ=255) tATCACTTGCAACACCATGTTGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTACTATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGtt < 1:169503/149‑1 (MQ=255) tATCACTTGCAACACCATGTCGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGtt < 1:835825/149‑1 (MQ=255) aTCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTa < 2:292225/149‑1 (MQ=255) tCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTaa < 1:820529/149‑1 (MQ=255) tCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTaa < 1:820779/149‑1 (MQ=255) tCACTTGCAACACCATGTAGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCAACAAACACCTTTTGTGATGGTCCATCTGCACCTACTT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCCTGCCTCCTTTTACAACAGTTaa < 1:701907/149‑1 (MQ=255) tCACCTGCAACACCATGTTGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTaa < 1:1067904/149‑1 (MQ=255) ctcTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTaaa < 2:174107/147‑1 (MQ=255) cACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTaaa < 2:492058/149‑1 (MQ=255) cACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTaaa < 2:1330822/149‑1 (MQ=255) aCTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTaaaa > 1:1008312/1‑149 (MQ=255) cTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAat < 1:1136653/149‑1 (MQ=255) cTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAat < 1:828089/149‑1 (MQ=255) tGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAaaat > 1:533781/1‑149 (MQ=255) aaCACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTACTATTGCCTTTGATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATAtt > 2:281796/1‑149 (MQ=255) acccaaTGTGGTAATGCACCTCTATGAACAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTc < 2:464138/144‑1 (MQ=255) acacCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGACGATACAATCCTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTc < 2:16119/149‑1 (MQ=255) cacCATGTTGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACCCTCGAATCGACCGATCTGATAGCTGCGCCGAATT‑‑CTAGCATTTTTCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCa < 2:945978/149‑1 (MQ=255) cacCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCa > 1:400961/1‑149 (MQ=255) cacCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGCAGCGCCTGCTCCTAATTCACCAGCAGCT‑‑CTTTCTAATATTACCGTGAATGCTTTTTTAGTCATTCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCa > 1:316253/1‑149 (MQ=255) acCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCAGGCGCTTATT‑‑CTAGCCTTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATACTTGTTCAGTCATACCTCCTTTTACAACAGTTAAACTATATTCat > 1:643307/1‑149 (MQ=255) gtgGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGtt < 1:110468/149‑1 (MQ=255) gtgGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGtt < 1:110579/149‑1 (MQ=255) ggTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTGTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACGGTTAAAATATATTCATATGtttt > 2:66459/1‑148 (MQ=255) tGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATcaa < 2:78122/149‑1 (MQ=255) ccccTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATcaaca < 1:1180512/147‑1 (MQ=255) ccTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAat < 2:1103471/149‑1 (MQ=255) tATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAGTGATGGTCCATCTGCTCCTAATA‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATAATGACTTTCACTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTa > 1:1003076/1‑149 (MQ=255) tATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGTCCTTCGGCCCCGGATATTGGCGTAAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCGTTTTACAACGGTTAAAATATATTCATATGTTTCATGAACAATATTa > 1:315923/1‑149 (MQ=255) tATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTa > 2:958163/1‑149 (MQ=255) tATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTa > 1:1343665/1‑149 (MQ=255) cccAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAgatg > 1:861743/2‑149 (MQ=255) aCCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTGTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTCAAATATATTACTTTTTTTCATCAACAATATTAgctg > 1:1251579/1‑149 (MQ=255) aCCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAAAAATATTAgctg > 1:132805/1‑149 (MQ=255) gATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCttt > 2:806405/1‑149 (MQ=255) aTGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCtttt < 2:1025720/149‑1 (MQ=255) aTGCTACAATCGTACCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATG‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCtttt < 2:708141/149‑1 (MQ=255) tGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCttttt < 2:162985/149‑1 (MQ=255) ttACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGa < 2:135134/148‑1 (MQ=255) cTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATCTTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGa < 1:531965/149‑1 (MQ=255) cTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGa < 1:884694/149‑1 (MQ=255) aCAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAAt < 2:131813/149‑1 (MQ=255) aTCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACATTATTAGCTGCTTTTTGAATTaa < 2:913585/149‑1 (MQ=255) aTCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTaa < 2:489750/149‑1 (MQ=255) aaTGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTACTATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTc < 1:578182/149‑1 (MQ=255) atgatgGTCCATCTGGTCCTAATT‑‑CTAGAATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTATAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTACTTTTTGAATTAAAGCAATTTCg > 1:846891/1‑149 (MQ=255) atgatgGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTct > 2:1158439/1‑148 (MQ=255) atgatgGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCg > 1:1298425/1‑149 (MQ=255) atgatgGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTACCTCAACAATATTAGCTGCTCTCTGAATTAAAGCAATTTCg < 2:888103/149‑1 (MQ=255) atgatgGTCCATCTGCTCCCAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCg < 2:653988/149‑1 (MQ=255) tgatgGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGt > 1:1037065/1‑149 (MQ=255) tCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCAt > 1:1078184/1‑149 (MQ=255) tCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCAt > 1:24644/1‑149 (MQ=255) tCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAAAAATATTAACTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCAt > 1:578871/1‑149 (MQ=255) ccATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTccgactc > 2:309101/1‑143 (MQ=255) aTCTGCGCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCtt < 2:249696/149‑1 (MQ=255) tCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCTGTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCCTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCttt < 1:549719/149‑1 (MQ=255) ccTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGtc < 1:1291864/149‑1 (MQ=255) ccTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGtc < 1:1345025/149‑1 (MQ=255) ccTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGtc < 1:806405/149‑1 (MQ=255) ccTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGtc < 1:704663/149‑1 (MQ=255) cTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGtct < 2:619922/149‑1 (MQ=255) aTT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTACCCTATTTTATTTATGGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTa > 1:373698/1‑149 (MQ=255) aTT‑‑CGAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGTCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCCATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTa < 2:916147/149‑1 (MQ=255) cTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAAtt < 2:1096862/149‑1 (MQ=255) cTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAAtt < 2:1033913/149‑1 (MQ=255) gCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTa < 1:1202015/149‑1 (MQ=255) cATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTAt < 2:561765/149‑1 (MQ=255) cATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTAt > 1:1251561/1‑149 (MQ=255) cATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTATCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCGTCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTAt < 2:748264/149‑1 (MQ=255) ttGCTTTCTAAGATGGCCTTTAATTCTTTTTCAGGCATGCCTCCTTTTACACTAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTAc < 1:309101/149‑1 (MQ=255) gCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAAAATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAg > 1:827974/1‑149 (MQ=255) tCTAAGATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTAtt > 2:164913/1‑149 (MQ=255) tAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAg < 1:281796/149‑1 (MQ=255) tatTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTATTTTTATCTACAGTTATAGaaa > 2:342678/1‑149 (MQ=255) tatTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGaaa > 1:750924/1‑149 (MQ=255) gCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCt < 2:1221868/149‑1 (MQ=255) ttAATTCTTTTTCAGTCATGCCTGCTTTTACAAGAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCttatt > 1:671436/1‑149 (MQ=255) tAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTTAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTTTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCttatta > 2:424353/1‑149 (MQ=255) tAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCGACGTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCGCTAATTTTATCTACCGTATTAGAAATGCtttttc > 2:916057/1‑148 (MQ=255) ttCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATg < 1:534827/149‑1 (MQ=255) ttCTTTTTCAGTCATGCCTCCCTCTTCAACCGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACCGTATTAGTAATGCTTATTAATg < 1:855841/149‑1 (MQ=255) ttttCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTTTTTTTTTTTAATTTCGTCAGCATCTTTGCCGTCTCTCATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTATTGatat > 2:1072376/1‑149 (MQ=255) ttttCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGatat > 1:788482/1‑149 (MQ=255) ttCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTCTTAGAAATGCTTATTACTGATATAc > 2:123444/1‑149 (MQ=255) cAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGATATAcag > 2:1060565/1‑147 (MQ=255) aGTCATTCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCTGCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGATATACGGc < 2:179105/149‑1 (MQ=255) tcgCCTCCCTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGCCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGATATACGGCtttt < 1:243725/147‑1 (MQ=255) aTGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGATATACGGCtttt < 1:580140/149‑1 (MQ=255) aTGCCTCCTGTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGATATACGGCtttt < 1:1245332/149‑1 (MQ=255) gCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGATATACGGCTtttat < 2:28331/149‑1 (MQ=255) | TTTCAATAATTTTATCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATT‑‑CTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTGCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGATATACGGCTTTTAT > CP000730/1646043‑1646333 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |