| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP000730 | 478,502 | C→A | D342E (GAC→GAA) | ndhF → | NADH dehydrogenase (ubiquinone) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 478,502 | 0 | C | A | 99.4% | 559.5 / NA | 176 | D342E (GAC→GAA) | ndhF | NADH dehydrogenase (ubiquinone) |
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Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
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cGATTCAATATTCAAAAACAAGCATCTGCTAAAGAAGCTTATGGCTGGATTGTCATGGGACGTGTATTAGCTATTA‑TCGTGGCATTTCTATTTTGGATGAGTAGTGACAGAAGTGCATAAGAAGTGTTAAGTGCACTCATTCTAGGATg > 2:605935/1‑149 (MQ=255) aaTATTCCAAAACAAGCATCTGCTAAAGAAGCTTATGGCTGGATTGTCATGGGACGTGTATTAGCTATTA‑TCGTGGCATTTCTATTTTGGATGAGTAGTGACAGAAGTGCATATGAAGTGTTAAGTGCACTCATTCTAGGATGGTCAtt < 1:1339803/149‑1 (MQ=255) atatTCCAAAACAAGCATCTGCTAAAGAAGCTTATGGCTGGATTGTCATGGGACGTGTATTAGCTATTA‑TCGTGGCATTTCTATTTTGGATGAGTAGTGACGGAAGTGCATATGAAGTGTTAGGTGCACTCATTATGGGATGCGCATTa > 2:322534/1‑149 (MQ=255) atatTCCAAAACAAGCATCTGCTAAAGAAGCTTATGGCTGGATTGTCATGGGACGTGTATTAGCTATTA‑TCGTGGCATTTCTATTTTGGATGAGTAGTGACAGAAGTGCATATGAAGTGTTAAGTGCACTCATTCTAGGATGGTCATTa > 1:298773/1‑149 (MQ=255) atatTCCAAAACAAGCATCTGCTAAAGAAGCTTATGGCTGGATTGTCATGGGACGTGTATTAGCTATTA‑TCGTGGCATTTCTATTTTGGATGAGTAGTGACAGAAGTGCATATGAAGTGTTAAGTGCACTCATTCTAGGATGGTCATTa > 1:725229/1‑149 (MQ=255) aaCAAGCATCTGCTAAAGAAGCTTATGGCTGGATTGTCATGGGACGTGTATTAGCTATTA‑TCGTGGCATTTCTATTTTGGATGAGTAGTGACAGAAGTGCATATGAAGTGTTAAGTGCACTCATTCTAGGATGGTCATTACTTGTATCt < 1:96611/149‑1 (MQ=255) aaCAAGCATCTGCTAAAGAAGCTTATGGCTGGATTGTCATGGGACGTGTATTAGCTATTA‑TCGTGGCATTTCTATTTTGGATGAGTAGTGACAGAAGTGCATATGAAGTGTTAAGTGCACTCATTCTAGGATGGTCATTACTTGTATCt < 1:1238609/149‑1 (MQ=255) gCATCTGCTAAAGAAGCTTATGGCTGGATTGTCATGGGACGTGTATTAGCTATTA‑TCGTGGCATTTCTATTTTGGATGAGTAGTGACAGAAGTGCATATGAAGTGTTAAGTGCACTCATTCTAGGATGGTCATTACTTGTATCTTGGaa > 2:1181447/1‑149 (MQ=255) cATCTGCTAAAGAAGCTTATGGCTGGATTGTCATGGGACGTGTATTAGCTATTA‑TCGTGGCATTTCTATTTTGGATGAGTAGTGACAGAAGTGCATATGAAGTGTTAAGTGCACTCATTCTAGGATGGTCATTACTTGTATCTTGGAAt > 1:1160932/1‑149 (MQ=255) cATCTGCTAAAGAAGCTTATGGCTGGATTGTCATGGGACGTGTATTAGCTATTA‑TCGTGGCATTTATATTTTGGATGAGTAGTGACAGAAGTGCATATGAAGTGTTAAGTGCACTCATTCTAGGATGGTCATTACTTGTTTCTTGGGAt > 1:516932/1‑149 (MQ=255) aGAAGCTTATGGCTGGATTGTCATGGGACGTGTATTAGCTATTA‑TCGTGGCATTTCTATTTTGGATGAGTAGTGACAGAAGTGCATATGAAGTGTTAAGTGCACTCATTCTAGGATGGTCATTACTTGTATCTTGGAATCAAATGGTAg < 1:930334/149‑1 (MQ=255) | TTATGTTAGTTCAATGTGCATTGGGTGTATATTCAGCAGCGATTATTCATTTAATATTGCACGGTATTTTTAAAGCAACATTATTTTTACAATCAGGTTCTATCGTGAAGCGATTCAATATTCCAAAACAAGCATCTGCTAAAGACGCTTATGGCTGGATTGTCATGGGACGTGTATTAGCTATTA‑TCGTGGCATTTCTATTTTGGATGAGTAGTGACAGAAGTGCATATGAAGTGTTAAGTGCACTCATTCTAGGATGGTCATTACTTGTATCTTGGAATCAAATGGTAG > CP000730/478357‑478647 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |