New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | = 1205323 | 72 (0.810) | 39 (0.610) +AGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAG |
9/194 | 6.7 | 42.8% | intergenic (+459/‑365) | yfiE/lspA | possible lactoylglutathione lyase/A8 family signal peptidase II |
? | CP000730 | 1426517 = | 73 (0.830) | intergenic (‑248/+724) | pstS/yitL | phosphate ABC superfamily ATP binding cassette transporter, binding protein/hypothetical protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
ATTGTTAAGAAAATGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTTGATGACGGG > CP000730/1426380‑1426655 | aTTGTTAAGAAAATGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAAca > 2:485199/1‑141 (MQ=255) gTTAAGAAAATGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAAcagca > 1:835607/1‑141 (MQ=255) ttAAGAAAATGTAAATATTAATTTTTGTTTATTTTAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAAaaccag > 2:807612/1‑141 (MQ=255) ttAAGAAAATGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAAcagcag > 2:791229/1‑141 (MQ=255) aaGAAAATGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTa > 2:945806/1‑141 (MQ=255) aaaTGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGAt < 2:297812/141‑1 (MQ=255) aaaTGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGAt < 1:60526/141‑1 (MQ=255) aTGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATaa > 2:504059/1‑141 (MQ=255) aTGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATaa < 2:735238/141‑1 (MQ=255) aaTATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTc > 1:528367/1‑141 (MQ=255) ttAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AAtt < 1:290340/141‑1 (MQ=255) tttttGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGaa > 1:626802/1‑141 (MQ=255) tttttGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTctaattgaaa < 1:572275/141‑10 (MQ=255) gTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAa‑ttat < 1:581944/141‑4 (MQ=38) ttAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATc > 1:93781/1‑141 (MQ=255) aTCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTa > 1:661942/1‑141 (MQ=255) aaaaaaTATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTActgc < 2:709325/141‑1 (MQ=255) aaaaaaTATTGCTTCATTAATAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTActgc < 2:709202/141‑1 (MQ=255) aaaaaTATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATTGAAAAT‑TATCTTActgct < 2:1007643/141‑1 (MQ=37) aaaaaGATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAANAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATATTTTCT‑AATT‑GAAAATTATCNTActgct < 2:904607/141‑1 (MQ=25) aaTATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAt‑tattaagtacactat > 2:229652/1‑129 (MQ=37) atatTACATCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAAAAAAAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTtc < 2:970583/141‑1 (MQ=25) tatTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTtct < 1:178024/141‑1 (MQ=255) tatTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTtct < 1:176924/141‑1 (MQ=255) atTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTtctc < 2:588602/141‑1 (MQ=255) ttGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTctct > 2:758960/1‑141 (MQ=255) tGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTa < 2:521437/141‑1 (MQ=255) ttAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAc < 1:606792/141‑1 (MQ=255) aGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACaa < 2:844311/141‑1 (MQ=255) aGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACaa < 1:832871/141‑1 (MQ=255) ataaaattaaaatGCTTCCTAAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTAGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAAt < 2:124138/140‑1 (MQ=255) taaaattaaaatGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑ACTTAGAAAA‑GATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATa < 1:28087/141‑1 (MQ=255) aaaaattaaaatGCTTACTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCATAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATa < 2:170051/140‑1 (MQ=255) aaaattaaaatGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATAc > 1:606858/1‑141 (MQ=255) attaaaatGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTc < 1:632735/141‑1 (MQ=255) aatGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAAcagca < 1:479979/77‑1 (MQ=255) aatGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAAcagca > 2:479979/1‑77 (MQ=255) gCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGaa < 1:791229/141‑1 (MQ=255) gCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGaa > 1:882527/1‑141 (MQ=255) cTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAAt < 2:157395/141‑1 (MQ=255) tCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATgg < 2:902762/141‑1 (MQ=255) gAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTc > 2:545444/1‑141 (MQ=255) gAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACCGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTc < 1:621603/141‑1 (MQ=255) aaTCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATTGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTGCTTATTGAATGGCTTCGCtt < 1:668344/141‑1 (MQ=255) atcGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTCTACAATACTTCGTATTGAATGGCTTAGCtttcct > 2:63829/1‑138 (MQ=255) atcGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGcc < 2:305336/141‑1 (MQ=255) atcGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGcc < 1:1020983/141‑1 (MQ=255) tttAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGt < 1:391740/141‑1 (MQ=255) ttAAATATGAATACAACAATGGCAGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTGCTCTATTTATACAATACTTCGTAGTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTc < 1:736362/141‑1 (MQ=255) aaaTATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTCGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGCCTTCGCTTTGCCCGTCTGTcac > 2:307201/1‑141 (MQ=255) atatGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACAt < 1:509303/141‑1 (MQ=255) tGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTAc < 2:615464/141‑1 (MQ=255) aaTACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTg < 2:36531/141‑1 (MQ=255) aaTACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTg < 1:721606/141‑1 (MQ=255) tACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTa < 1:303407/141‑1 (MQ=255) cAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTaaa < 2:70271/141‑1 (MQ=255) ggCTGGGACATAAATACCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCGGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTAAAATTCtat < 1:856587/141‑1 (MQ=255) tGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACAtt < 1:828283/123‑1 (MQ=255) tGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACAtt > 2:828283/1‑123 (MQ=255) gggACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTAAAATTCTATAAAt < 1:1016165/141‑1 (MQ=255) gggACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTAAAATTCTATAAAt < 1:55412/141‑1 (MQ=255) gACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTAAAATTCtatttatag < 1:193955/141‑7 (MQ=255) gACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAg < 2:93781/141‑1 (MQ=255) gACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAg < 1:13199/141‑1 (MQ=255) aCATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGa < 1:807612/141‑1 (MQ=255) aaaTCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAAttt < 1:838532/141‑1 (MQ=255) tCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTtg < 2:902193/141‑1 (MQ=255) cccTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAAttt > 2:373425/1‑137 (MQ=255) cccTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAAttt < 1:373425/137‑1 (MQ=255) ccTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTtgat < 2:373502/141‑1 (MQ=255) cTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTtgatg < 1:146033/141‑1 (MQ=40) aaaaaaCAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTTGATGACg < 1:945806/141‑1 (MQ=39) aaaaCAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTTGATGACggg > 2:730715/1‑141 (MQ=17) | ATTGTTAAGAAAATGTAAATATTAATTTTTGTTAATCTAAAAAATATTGCTTCATTAGTAAAATTAAAATGCTTCCTGAAAAATCATCGAAATTTAAATATGAATACAAAAATGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTGCCCGTCTGTCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTTGATGACGGG > CP000730/1426380‑1426655 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |