| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,486,381 | G→T | Q5215K (CAA→AAA) | ebh ← | extracellular matrix binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,486,381 | 0 | G | T | 96.1% | 261.3 / 0.3 | 77 | Q5215K (CAA→AAA) | ebh | extracellular matrix binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/2); new base T (34/40); total (35/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TAAGTTATTCAAGTTGTTTTTCGCAGTTGTCTTAGCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTGATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGTTTTGACCTGCTTTAATTGTTGCTTCATTCGCAATACTATCTCTTAAGCCTTTCATCGCTGT > CP000730/1486244‑1486516 | tAAGTTATTCAAGTTGTTTTTCGCAGTTGTCTTAGCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTAtt < 1:562467/141‑1 (MQ=255) aGTTATTCAAGTTGTTTTTCGCAGTTGTCTTAGCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTaa > 1:245627/1‑141 (MQ=255) aGTTATTAAAGATGTATTTCGCAGTTGTCTTAGCTTGAGCTACGTTTCACGCACCACTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACCTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTACGAGGTTTTATTaa > 2:594099/1‑141 (MQ=255) gTTATTCAAGTTGTTTTTCGCAGTTGTCTTAGCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAAt < 2:1017928/141‑1 (MQ=255) aTTCGAGTTGGGTTTCTCAGTTGTCTTAGCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTGGTGATGTTACTGTCTTAATAGTATTTGGGTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGAt < 2:94195/141‑1 (MQ=255) aTTCAAGTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTAGCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGAt > 2:781207/1‑141 (MQ=255) aTTCAAGTTGTTTTTCGCAGTTGTCTTAGCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGAt < 2:193212/141‑1 (MQ=255) tCAAGTTGTTTTTCGCAGTTGTCTTAGCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTg > 1:365641/1‑141 (MQ=255) cAAGTTGTTTTTCGCAGTTGTCTTAGCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGc > 2:485740/1‑141 (MQ=255) aaGTTGTTTTTCGCAGTTGTCTTAGCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCt > 2:883584/1‑141 (MQ=255) aGTTGTTTTTCGCAGTTGTCTTAGCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCtt > 1:986091/1‑141 (MQ=255) gttgttTTTCGCAGTTGTCTTAGCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCttt > 2:539693/1‑141 (MQ=255) ttCGCAGTTGTCTTAGCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCa < 1:349322/141‑1 (MQ=255) ttCGCAGTTGTCTTAGCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCa < 1:271392/141‑1 (MQ=255) ttCGCAGTTGTCTTAGCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCa > 1:445467/1‑141 (MQ=255) ttCGCAGTTGTCTTAGCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCa > 2:703976/1‑141 (MQ=255) ttCGCAGTTGTCTTAGCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCa < 2:116647/141‑1 (MQ=255) cGCAGTTGTCTTAGCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGt < 2:467311/141‑1 (MQ=255) gCAGTTGTCTTAGCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTa < 2:507093/141‑1 (MQ=255) aGTTGTCTTAGCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAAc < 1:548249/141‑1 (MQ=255) gTTGTCTTAGCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACt < 2:539658/141‑1 (MQ=255) tttttttAGCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTTCGTATTTGTTTTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTg > 2:997657/6‑141 (MQ=255) ttAGCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTg > 2:335882/1‑141 (MQ=255) aGCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATGTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGta < 1:978211/141‑2 (MQ=255) gCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAAc > 2:119843/1‑131 (MQ=255) gCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAAc < 1:119843/131‑1 (MQ=255) gCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGCTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCg < 2:721426/141‑1 (MQ=255) ctcaaGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGt > 2:1008227/5‑141 (MQ=255) caaGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTAc > 2:534414/3‑141 (MQ=255) gAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACt > 1:342643/1‑141 (MQ=255) aGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTAc < 1:811860/141‑1 (MQ=255) tttCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGa < 1:367418/141‑1 (MQ=255) tttCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGa < 2:245627/141‑1 (MQ=255) ttCGCGCACCATTTAATGCCAGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGat < 2:245308/141‑1 (MQ=255) ttCGCGCACCATTTAATGCCAGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGat < 2:655369/141‑1 (MQ=255) gcgcACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGattat > 1:684457/1‑141 (MQ=255) cgcACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGattatt > 1:966509/1‑141 (MQ=255) ccATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTTGCTTGTGATGTTACTTGCGTATTAGTATTTGGTTCTATCGTTGGGTGCGATGCTTTATTAATGATTGCTTTTGCTTCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGTTTTTTTGGa > 2:1028753/1‑141 (MQ=255) ccATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGa > 1:79866/1‑141 (MQ=255) ccattAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGAc > 1:786155/4‑141 (MQ=255) cATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGAc < 1:615343/141‑1 (MQ=255) aTTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACt < 2:985998/141‑1 (MQ=255) aTTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTGATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACt < 2:765657/141‑1 (MQ=255) tAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGa < 1:835926/127‑1 (MQ=255) tAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGa > 2:835926/1‑127 (MQ=255) ccTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTtgctg < 2:326759/93‑1 (MQ=255) ccTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTtgctg > 1:326759/1‑93 (MQ=255) cTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAgt < 2:701191/141‑1 (MQ=255) tGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAgtg < 2:556480/141‑1 (MQ=255) gTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAgtgt < 1:901809/141‑1 (MQ=255) tCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAg > 2:987312/1‑141 (MQ=255) cTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGt > 1:649017/1‑141 (MQ=255) cTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGt > 1:583248/1‑141 (MQ=255) cTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGt < 1:50454/141‑1 (MQ=255) tAGTTGTCTCTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCCTCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGtttt < 2:920428/141‑1 (MQ=255) aGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCATTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGTTTTg < 1:539693/141‑1 (MQ=255) aGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGttttt > 2:80606/1‑140 (MQ=255) tCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGTTTTGACCTg > 2:786269/1‑141 (MQ=255) cACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGTTTTGACCTGc > 1:138821/1‑141 (MQ=255) gtgATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGTTTTGACCTGCTTTaa < 1:700542/141‑1 (MQ=255) gtgATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGTTTTGACCTGCTTTaa > 2:919393/1‑141 (MQ=255) ggtGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGGTGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGTTTTGACCTGCTTTAAtt < 2:121929/139‑1 (MQ=255) gATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGTTTTGACCTGCTTTAAtt > 1:666913/1‑141 (MQ=255) gATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGTTTTGACCTGCTTTAAtt < 1:987312/141‑1 (MQ=255) ttACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGTTTTGACCTGCTTTAAttgttg < 2:243549/141‑1 (MQ=255) aCTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGTTTTGACCTGCTTTAATTGTTGCt < 2:138821/141‑1 (MQ=255) cTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGTTTTGACCTGCTTTAATTGTTGCtt < 1:441159/141‑1 (MQ=255) ttGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGTTTTGACCTGCTTTAATTGTTGCTTc > 1:48804/1‑141 (MQ=255) aaTAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGTTTTGACCTGCTTTAATTGTTGCTTCATTCGc < 1:824473/141‑1 (MQ=255) aGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGTTTTGACCTGCTTTAATTGTTGCTTCATTCGCAAt > 1:837760/1‑141 (MQ=255) ggTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGTTTTGACCTGCTTTAATTGTTGCTTCATTCGCAATACTAtct < 1:1013127/141‑1 (MQ=255) gTTCCATCGTTGGGTTAGATGTTTGATTAATGATTTCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGTTTTGACCTGCTTTAATTGTTGCTTCATTCGCAATACTAtctc < 2:719207/141‑1 (MQ=255) aTCGTTGGGTTCGATGTTTGATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGTTTTGACCTGCTTTAATTGTTGCTTCATTCGCAATACTATCTCTTAAg > 1:944187/1‑141 (MQ=255) gTTCGATGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGTTTTGACCTGCTTTAATTGTTGCTTCATTCGCAATACTATCTCTTAAGCCTTTCAt > 2:554817/1‑141 (MQ=255) tGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTTGACTTGCGTCAGTGTAGTTTTGACCTGCTTTAATTGTTGCTTCATTCGCAATACTATCTCTTAAGCCTTTCATCGCTGt < 2:250328/141‑1 (MQ=255) tGTTTTATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGTTTTGACCTGCTTTAATTGTTGCTTCATTCGCAATACTATCTCTTAAGCCTTTCATCGCTGt < 2:250306/141‑1 (MQ=255) tGTTTTAGTAATTATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGTTTTGACCTGCTTTAATTGTTGCTTCATTCGCAATACTATCTCTTAAGCCTTTCATCGCTGt < 2:299942/141‑1 (MQ=255) | TAAGTTATTCAAGTTGTTTTTCGCAGTTGTCTTAGCTTGAGCTAAGTTTCGCGCACCATTTAATGCCTGTTCTTTAGTTGTCACTTGTGATGTTACTTGCGTAATAGTATTTGGTTCCATCGTTGGGTTCGATGTTTGATTAATGATTGCTTTTGCTGCAGTAACTGCACTGTCGTACTCGTTACGATTATTTGGACTTGCGTCAGTGTAGTTTTGACCTGCTTTAATTGTTGCTTCATTCGCAATACTATCTCTTAAGCCTTTCATCGCTGT > CP000730/1486244‑1486516 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |