| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 36133 = | 1477 (15.550) | 7 (0.080) | 6/274 | 9.4 | 0.48% | coding (419/675 nt) | tpn | IS431mec transposase |
| ? | CP000730 | 36148 = | 1478 (16.240) | coding (404/675 nt) | tpn | IS431mec transposase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1488 total aligned reads displayed.
AGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAATGGCACG > CP000730/35985‑36281 | tATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTAcc > 2:430711/1‑149 (MQ=255) ttCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCtt > 2:933661/1‑149 (MQ=255) tCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTc > 2:863011/1‑149 (MQ=40) ttGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGtt > 2:163221/1‑149 (MQ=255) gccgTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGa < 2:589195/146‑1 (MQ=255) gCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGa > 2:395209/1‑149 (MQ=255) gCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGa < 2:118459/149‑1 (MQ=40) tGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAg > 2:245310/1‑149 (MQ=255) cgTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGAGAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGACATTTCTGCCTTCGTTGAAg > 2:186134/2‑149 (MQ=14) gTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTc > 1:1042797/1‑141 (MQ=255) tggATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGtt > 1:604007/3‑141 (MQ=255) gATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCt > 2:270721/1‑149 (MQ=255) aTACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGaa > 1:885207/1‑141 (MQ=255) tACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTAGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAg > 1:639747/1‑141 (MQ=255) attttGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGAAGGTTATTTTGTTCCATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAgg < 1:411165/139‑1 (MQ=11) cTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAAACATTGCTCCCTTCGTTGAAgtg > 1:851000/1‑139 (MQ=255) tttGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTTAGTGCGTTTATTCATG‑TATTTCTATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTg < 1:68093/141‑1 (MQ=11) ttGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTg < 2:141152/149‑1 (MQ=255) tGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCAATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAACTTTAATTACTTTAACCATATCTACATTTGTTGAAAGTTcc > 1:465097/1‑141 (MQ=11) atatCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGCGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGACAGTCCGGTTTCAGTTTAAAGGCTTTACTTATTTTCGTTCCTGTAGCCTTCGTTGAAGGTGCCTg > 1:1136673/1‑141 (MQ=11) tatcTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTTAAGGTGCCTGATCTTTaac > 2:352189/4‑148 (MQ=11) aCCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAAtt < 2:524189/149‑1 (MQ=255) ccTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATc < 1:264416/141‑1 (MQ=255) cTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCt > 1:949478/1‑141 (MQ=255) cTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTAc > 2:473253/1‑149 (MQ=255) tGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTTATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGCTGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAACGTGCCTGATCTGTAACTACCt > 2:209105/1‑149 (MQ=11) tGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCt < 2:534580/149‑1 (MQ=38) tctttcttACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTaa > 1:538435/1‑141 (MQ=255) ctttcttACGTTAATATGACGGGGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCtttt < 2:510574/149‑1 (MQ=11) tttACTTTAATATGACGGTGATCGTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGACGGTGCCTGATCTGTAACTAcc < 1:11004/140‑1 (MQ=11) cttACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAgg < 2:795061/149‑1 (MQ=255) ttACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCt < 1:77468/141‑1 (MQ=255) gtACTGTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCt > 1:310603/2‑141 (MQ=255) aCTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTCAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCttt > 1:700850/1‑141 (MQ=255) cTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTa < 2:609496/149‑1 (MQ=255) tttACTATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTACTTACTGTAACCATTGCTCCCTGCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTAc < 2:448473/149‑1 (MQ=11) tttAATATTACGGTGATCTTCCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAATCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTg < 1:145587/141‑1 (MQ=11) tttAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTAc < 2:329599/149‑1 (MQ=19) tAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACAATTGCTGCTTTCGGTGAAGGTGCATGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCa > 2:634480/1‑149 (MQ=11) atatGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCAATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGATTTACCaaa > 2:312773/1‑149 (MQ=255) atGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGTCATTGCTGCTTTGGGTTAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTCTTGAGGCTTACCAAAtt < 2:685471/149‑1 (MQ=11) atGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGctt > 1:900083/1‑141 (MQ=255) gACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTAc > 1:1084869/1‑141 (MQ=255) aCGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAACGCTTTACTTACTGTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTAcc < 1:722408/141‑1 (MQ=11) aCGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCTTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTAcc < 1:865755/141‑1 (MQ=255) aCGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTAcc > 1:156676/1‑141 (MQ=255) aCGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTAcc < 1:740329/141‑1 (MQ=35) aTCTTGCTCCATGAGGATAGTCAGACCATTATGTTG‑ACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTACAGGATCTGTAATAACCTTTTGAGGTTTACAAAATTg > 1:203004/1‑141 (MQ=11) cTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGtt > 1:1158659/1‑141 (MQ=32) ttGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGttt > 1:129491/1‑141 (MQ=17) ttGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGttt > 1:1015637/1‑141 (MQ=12) tGCTCAATGAGGTTATTAAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTACTACATTCGTGGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTGTGAGGTTTACCAAATTATTTa > 1:168404/1‑141 (MQ=11) cTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGtt < 2:815338/149‑1 (MQ=32) cTCAATGAGGTTATTCAAA‑TATTTCGAAGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAAt < 1:350346/141‑1 (MQ=11) taaTGAGGTTATTCAGA‑TATTTTGATGTACAATGGCAGTCATGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTACTTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTGAATga < 1:1062252/140‑1 (MQ=11) gaaTGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTAAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGCTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTg < 2:657318/148‑1 (MQ=255) cAATGAGGTTATTCAAA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATga < 1:422182/141‑1 (MQ=255) aggAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGCAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATgaga < 1:580119/139‑1 (MQ=11) aTGAGGTTATTCAGA‑TATTTAGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTAAAGCATGCCTGCCTTCGTTGAAGGTCCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATgaga < 1:693937/141‑1 (MQ=11) ggTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTGAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTGGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGtt > 1:788596/1‑141 (MQ=255) ggTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAACTCGTTTAATGAGACGtt > 1:186024/1‑141 (MQ=255) ggTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGtt < 1:438661/141‑1 (MQ=11) ggTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGtt < 1:296141/141‑1 (MQ=11) gTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACg < 2:743363/149‑1 (MQ=17) gTTATTCAGA‑AATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACg < 2:413341/149‑1 (MQ=12) ttATTCAGA‑TATTTGTATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGGGACGTTTg < 1:392570/141‑1 (MQ=11) ttATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTCATTACTTGAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGc < 2:726373/149‑1 (MQ=255) tCAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATaa > 1:486596/1‑141 (MQ=17) cAGA‑TATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATg > 2:673418/1‑149 (MQ=12) gA‑TATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGACACGTTTGATAAACGCATATGCt < 2:487082/149‑1 (MQ=11) atTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCat < 1:627691/141‑1 (MQ=12) atTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGaa < 2:835464/149‑1 (MQ=12) atTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCat < 1:1180266/141‑1 (MQ=255) tttCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCCAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACgacta > 1:52888/1‑137 (MQ=17) tCGATGTACAATGGCAGTCAGTTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTATCTTCGTTGAAGGTGCCTGTTCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATg < 1:91692/141‑1 (MQ=11) tCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAAGTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGGGCCTGATCTGCAATCACCTTTTGACGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATg < 1:5085/141‑1 (MQ=11) cGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGc < 1:830560/141‑1 (MQ=12) cGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGc < 1:656089/141‑1 (MQ=17) cGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTAATAAACGCATATGc > 1:377551/1‑141 (MQ=255) gATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCAACTGCt > 1:933647/1‑141 (MQ=11) aCAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATg > 1:219333/1‑141 (MQ=255) cAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGa > 1:1120670/1‑141 (MQ=11) aaTGGCAGTCATGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGTTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGAt < 1:818036/141‑1 (MQ=9) aaTGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGt < 2:769311/149‑1 (MQ=14) ttACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTccc > 2:230492/1‑149 (MQ=17) tttAACCATTGCTACCTTCGCTGAAGGTGCCTGATCTGTAATCACCTATTCAGGGTGACCAAATCGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAatgtatg < 1:804/141‑1 (MQ=11) tggaGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGCTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTg < 2:6988/146‑1 (MQ=11) taaccATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTgta < 2:555506/146‑3 (MQ=17) ccATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCct < 1:327016/141‑1 (MQ=32) cATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCctc < 1:972274/141‑1 (MQ=255) cATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCaa < 2:370014/149‑1 (MQ=17) ttGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGTATCAATg < 2:893696/149‑1 (MQ=255) ttGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCActcag > 1:564488/1‑139 (MQ=11) tGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTgt > 1:284908/1‑140 (MQ=17) tGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTgt > 1:237813/1‑140 (MQ=17) tGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGc > 1:761526/1‑141 (MQ=32) gCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGTTCTGTCCCTACCTTTTAAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAAACGTTTGATAAACACATATTCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTgta < 1:993542/141‑3 (MQ=11) tACCTTCGTTGAAGGTGTCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTATCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAATGGCAc < 2:296248/149‑1 (MQ=17) tACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTGCGCAACCAAATATCTAATGTAGGTGCCTCTGCagc > 1:1000018/1‑139 (MQ=12) tACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAATGGCAc > 2:783673/1‑149 (MQ=32) | AGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGA‑TATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAATGGCACG > CP000730/35985‑36281 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |