| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 36142 = | 1549 (16.300) | 7 (0.080) | 7/274 | 8.9 | 0.88% | coding (410/675 nt) | tpn | IS431mec transposase |
| ? | CP000730 | = 76626 | 93 (1.020) | intergenic (+684/‑450) | USA300HOU_0072/USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTATATCGTGCCATTGATGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCAAAATATCAATACAGCAAAG > CP000730/76478‑76774 | ttATATCGTGGCAATTATGCCGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAAc < 2:387244/149‑1 (MQ=255) tatCGTGCCATTGATGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGaa > 2:3071/1‑149 (MQ=32) atCGTGCCATTGATACAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAg < 2:40995/149‑1 (MQ=12) tCGTGCCATTGATGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAgg > 2:225814/1‑149 (MQ=32) ccATTGATGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCa > 2:602875/1‑149 (MQ=32) ttgaatcgagtgaatatTCATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAAACATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCCAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAgg < 1:52728/128‑1 (MQ=11) gATGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGACGGTa < 1:826253/141‑1 (MQ=17) gATGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTa > 1:808337/1‑141 (MQ=32) aaTGCAAAGGCATATCCATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGc < 2:868924/148‑1 (MQ=12) tGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGc > 1:141062/1‑141 (MQ=32) agCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCCTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTa < 2:614321/148‑1 (MQ=17) ccagcggtacctgcATTAGATCTTTGCTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCa < 1:620829/128‑1 (MQ=1) gagagGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCaa < 1:951196/140‑1 (MQ=17) cAGAGGGATATGCATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCaa < 1:384285/141‑1 (MQ=17) agagGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAg < 2:740130/149‑1 (MQ=32) agagGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAg > 2:247764/1‑149 (MQ=32) agagGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAACTTGGTAAGCCTCAAAATGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGCAGCAAt < 1:1087189/141‑1 (MQ=11) gagGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGt < 2:611643/149‑1 (MQ=32) ggggATATAAAGTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATgg < 1:69779/140‑1 (MQ=17) ggATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAAt > 2:63568/1‑149 (MQ=32) ggATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAAt > 2:775723/1‑149 (MQ=32) atatACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTaa > 1:1096271/1‑141 (MQ=31) tataCATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGGGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTaca > 1:118400/1‑139 (MQ=11) tataCATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGAGCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTaaa < 1:237867/141‑1 (MQ=11) tataCATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTCTATCAAACGCCCCAGTGAAATCTGAGTTAAACCTCAAAAGGTAATTGCAGATCAGGCACCTTCAACGGAGGAAGCAATTGATaaa > 1:129283/1‑141 (MQ=11) tgacgttcggTTGCGGAAGCAACGAGATAATCATTCAGCAGATGCGTTTATCAAACGGCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGTTAAAGTAATTaa < 1:713862/133‑1 (MQ=1) atttttttGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATACGTTTATCAAACGTCACATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTCCATATCAGGCACTTTCAACGAAAGTAGCAATGGTAAAAGAAATAAAAGCt > 1:781258/7‑141 (MQ=1) gcttacgCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTt‑taaact > 1:1056815/7‑141 (MQ=1) aggaaCGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGCAGCAATGGCTAAAATAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGt < 2:273927/146‑1 (MQ=1) agaaaCGAAATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGTTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTgc < 2:445175/146‑2 (MQ=0) cagcGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGTTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCt < 1:520165/138‑1 (MQ=1) aaCGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTAt > 2:767986/1‑149 (MQ=32) gagaTAATCATTCAGCATATGCGTTTCTCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCTCCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGTTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGt < 2:570645/149‑1 (MQ=12) gaaaTAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGt < 2:148249/146‑1 (MQ=17) ggaTAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTGATGAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTa < 2:929375/148‑1 (MQ=17) agaTAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTa > 2:696884/1‑149 (MQ=32) aTAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACa < 2:276910/149‑1 (MQ=32) aTAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTAGGAAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACa < 2:54961/149‑1 (MQ=17) tCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGa > 2:557152/1‑149 (MQ=32) cATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTGGTGAAAGCTCAAAAGGTAATTACATATCAGTCACCTTGAACGAAGGTAGCAATGGTTAAGGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTCAAccgtactaccattgt < 1:471967/141‑14 (MQ=11) aTTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGCTTCAAGCTGGGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGaaa > 2:444387/1‑149 (MQ=11) ttCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGCAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTGT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGtcc > 1:711360/1‑139 (MQ=12) tCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTTTACa > 1:14707/1‑141 (MQ=17) cAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTCCAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGCGTAAAGTAGTGAAAGCTTT‑TAAACGTAAACCTGACTgccctagtacat > 1:485401/1‑130 (MQ=11) gCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCg < 1:946780/141‑1 (MQ=32) atatGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGaa > 1:297963/1‑141 (MQ=32) ccGTCTAACAAACGTCTAATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAAACTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATaa < 2:97563/148‑1 (MQ=255) cGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAAc > 2:244140/1‑149 (MQ=32) tttATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATTTGAGTAACCt > 2:74453/1‑149 (MQ=17) tttATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCt < 2:892711/149‑1 (MQ=32) tttATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCt > 2:817747/1‑149 (MQ=32) tttATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCt < 2:551477/149‑1 (MQ=32) tATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCa < 2:667031/149‑1 (MQ=32) tCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAACCCTCAAAAGGTAATTACAGATCATGCACCTTGAACGAGGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTGCATCGAAATATCTGAATAACCTCAtt > 2:569936/1‑149 (MQ=11) aaaCGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTACTTAAAGAAAAAAAAACTTCAACGAAGTTAACCATTAAACAAG‑AAAAGAAGCTTTGGTTACTTAAACTTGACTTTTATTGTACATCGAAATATCTTAAAAAc > 1:1144766/1‑141 (MQ=2) aaaCGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAAc > 1:406604/1‑141 (MQ=32) aaaCGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAAc > 1:1159733/1‑141 (MQ=32) aaCGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAAcc < 1:528705/141‑1 (MQ=32) aaCGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAAcc > 1:313988/1‑141 (MQ=32) aaCGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCGAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAAcc > 1:956371/1‑141 (MQ=17) ctctcATTAAACAATTTTGTAAACCACAAACTGTAATAATAAATCAGGCACCATCAACAAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAAATAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCAGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCaa < 2:171217/148‑1 (MQ=11) cATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATc < 2:494571/149‑1 (MQ=32) aTTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCa > 2:434334/1‑149 (MQ=32) ttAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCAc < 2:125659/149‑1 (MQ=32) ttAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCGCATTGAGCAAGATCAc > 2:827174/1‑149 (MQ=17) aaCAATTTGGCAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAg < 1:800538/141‑1 (MQ=17) tttGGAAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTAAAATCGGACGGTTATTGTAGATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCatat < 2:448310/149‑1 (MQ=11) gTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTc < 1:230846/141‑1 (MQ=35) gTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTc < 1:424178/141‑1 (MQ=35) gTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTaaa > 2:609552/1‑149 (MQ=35) aaaCCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCat > 1:1139564/1‑141 (MQ=34) aaCCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTGGCAATGGCTAAAGTAATTAAAACTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATGGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAATATCACTGTTATATTAAAATa > 2:289173/1‑149 (MQ=11) ccTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAACCCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATAtt < 1:1180465/141‑1 (MQ=25) cAAAAGGTAATTACAGATCAGGAACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGAACACTGTCATATTAAAATaagaaa < 2:121539/149‑1 (MQ=255) aaaGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAAt < 1:1132957/141‑1 (MQ=38) tAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCCTTGATTAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAgg < 2:688212/149‑1 (MQ=255) aaTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGt < 2:818241/149‑1 (MQ=38) aTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATaagaaag < 1:793656/141‑1 (MQ=38) aTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTa < 2:498224/149‑1 (MQ=39) ttACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCATT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATAGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTAt < 2:198196/149‑1 (MQ=255) tACAGATCGGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTGT‑TAAACTTAAACCCGACTGCTATTGTACATCGAAATATTTGAATAACCCCATTGAGCAGAATCACTGTCATATTCAAATAAGAAGGAc > 1:737775/1‑141 (MQ=11) aCAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATAGCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACa < 1:152283/141‑1 (MQ=38) cAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCaa < 2:347852/149‑1 (MQ=39) cAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTAt < 1:449566/141‑1 (MQ=39) cAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTAt < 1:137198/141‑1 (MQ=39) aggaaacTTAAACGAAGGTAGCAATGGTTAAAGTAATTAAAGATTT‑TAAAATTAACGCTGACTGCAATTGTACATCGAAATATCTGAATAAACTCATTGAGAACGATGACCGAAAAATCATTATAAGCAAGACAAGGTAta > 1:833646/7‑140 (MQ=0) ggCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCAAAATATCa > 2:77198/1‑149 (MQ=255) gCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGACAGACAAGGTATCaa < 1:811636/141‑1 (MQ=255) gCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGCCAATGTATCaa > 1:941690/1‑141 (MQ=255) gCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGAATCaa > 1:939835/1‑141 (MQ=38) gCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCGAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCaa < 1:148570/141‑1 (MQ=38) cACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCAAAATATCAAt > 2:455316/1‑149 (MQ=40) ccTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAAACAAGGTATCaaaaa > 1:102157/1‑140 (MQ=255) ccTTCAACGAAGAAAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGATATTGAAAATCAAAATATATGAATAACAACATTGAGAAAGATCACTGTCGTATTAAAATAAGAAGGGCAAGGAATCAAAat > 1:207248/1‑141 (MQ=14) tCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTGCATTTGT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCAAAATATCAAAACAGc > 2:931023/1‑149 (MQ=14) tCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCAAAATATc < 1:178756/141‑1 (MQ=255) aaCGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCAAAATATCaa > 1:427631/1‑141 (MQ=40) cGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGCCAAGGTATCAAAATATCAATACAGCAAAg > 2:399871/1‑149 (MQ=255) | TTATATCGTGCCATTGATGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTT‑TAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCAAAATATCAATACAGCAAAG > CP000730/76478‑76774 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |