BRESEQ :: Evidence

New junction evidence
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Only 100 of 181 total aligned reads displayed.

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gtcacacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaa                                                                                                                                                 <  1:1051141‑M1/1‑1 (MQ=255)

 tcacacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttagaaaatacaatggacaagataaaa                                                                                                                                                <  1:1314795‑M1/2‑1 (MQ=255)

  cacacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagcgcagaaatgtgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaaaa                                                                                                                                               <  1:1356632‑M1/3‑1 (MQ=255)

   acacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaaaaa                                                                                                                                              <  1:232761‑M1/4‑1 (MQ=255)

   acacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaaaaa                                                                                                                                              <  1:911687‑M1/4‑1 (MQ=255)

    cacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaaaaaa                                                                                                                                             >  1:1164006‑M1/137‑141 (MQ=255)

     gTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAg                                                                                                                                            >  1:517826/1‑141 (MQ=255)

       ctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGtt                                                                                                                                          >  1:1092027‑M1/134‑141 (MQ=255)

       ctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGtt                                                                                                                                          >  1:1341602‑M1/134‑141 (MQ=255)

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            aCAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGa                                                                                                                                     <  1:436914/141‑1 (MQ=255)

              catgccgaacacagacgttaagctccttagcgtcgatcgtagtagaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaacttttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAGAAGTTATGGACt                                                                                                                                   >  1:972327‑M1/127‑141 (MQ=255)

              catgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACt                                                                                                                                   <  1:187553‑M1/15‑1 (MQ=255)

                    gaacacagaagttaagctccttagcgtcgatgttagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATg                                                                                                                             >  1:475347‑M1/121‑141 (MQ=255)

                    gaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATg                                                                                                                             >  1:433222‑M1/121‑141 (MQ=255)

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                    caacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATg                                                                                                                             >  1:108271‑M1/121‑141 (MQ=255)

                    cAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAAtt                                                                                                                             >  1:164071/1‑140 (MQ=255)

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                          agaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttcatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTtgata                                                                                                                       <  1:1002627‑M1/27‑1 (MQ=255)

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                                 aagctgcttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagtacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGta                                                                                                                <  1:189247‑M1/34‑1 (MQ=255)

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                                                                                 aacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GAc                                                             <  1:1170466‑M1/82‑1 (MQ=255)

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                                                                                              aactcaactTAAGAAATAACTCGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGt                                                <  1:313670/141‑1 (MQ=255)

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                                                                                                       atcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGTTAATTCCaa                                       >  1:579171‑M1/38‑141 (MQ=255)

                                                                                                       atcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGTTAATTCCaa                                       >  1:60302‑M1/38‑141 (MQ=255)

                                                                                                        aaGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTACAAGCATCAAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAACCT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGTTAATTCCaaa                                      <  1:1002195/141‑1 (MQ=37)

                                                                                                        aaGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAATAAAAATGAACATTGAAAACT‑CAAT‑‑GACAATATGTCCACGTTAATTCCaaa                                      <  1:732789/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                        aaGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGTTAATTCCaaa                                      <  1:218417/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                          aaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaaa                                    >  1:366259‑M1/35‑141 (MQ=255)

                                                                                                            attgtggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAAc                                  <  1:690037‑M1/109‑1 (MQ=255)

                                                                                                               ttggttaaaaaataaaatggaaaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTa                               >  1:504316‑M1/30‑141 (MQ=255)

                                                                                                               aaCTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGTTAATTCCAAACACCGTa                               >  1:951409/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                 ggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAAc                             >  1:243402‑M1/28‑141 (MQ=255)

                                                                                                                 ggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAAc                             >  1:72141‑M1/28‑141 (MQ=255)

                                                                                                                   ttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGGCTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGTTCATTCCGACAAACGTACCta                           <  1:1059886‑M1/116‑1 (MQ=255)

                                                                                                                     aaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACtata                         >  1:580537‑M1/24‑141 (MQ=255)

                                                                                                                        tACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAGTAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTTTAAGt                      >  1:1075433/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                        tACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAATTGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGt                      >  1:1003889/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                        tACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACAATAAGt                      >  1:425510/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                        aaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGt                      >  1:536375‑M1/21‑141 (MQ=255)

                                                                                                                         aCTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAAAA‑‑‑AAAGCTATAATAGGACGATATGTCCACGTTAATTTCAAAAAACGTAACTATAAGtt                     >  1:994852/1‑141 (MQ=25)

                                                                                                                          ataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTa                    <  1:355873‑M1/123‑1 (MQ=255)

                                                                                                                            aaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACa                  >  1:1070002‑M1/17‑141 (MQ=255)

                                                                                                                            aaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACa                  >  1:514452‑M1/17‑141 (MQ=255)

                                                                                                                            aaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAAATAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACa                  >  1:526758‑M1/17‑141 (MQ=255)

                                                                                                                            aaCGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACa                  <  1:1304771/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                               atggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAGCGTTAATTCCAAAAAACGAAACTATAAGTTAcaaaa               <  1:62899‑M1/128‑2 (MQ=255)

                                                                                                                               aaaaaTTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTGACTATAAGTTACAAAc               <  1:818634/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                   attaattaTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACatta           >  1:866610/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                           aAAAAAGTTATTGACTTCAATCGAGCGAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTAt   <  1:329898‑M1/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                            aaaaaGTTATTGACGTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GACT‑‑GACACCATTTTTTCTTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTGACAAACATTATTTAGTAtt  >  1:716646/1‑141 (MQ=21)

AGGGCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACT‑GAAT‑‑GACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATT  >  CP000730/512480‑512760

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 12 ≤` `ATCG/ATCG` `< 22 ≤` `ATCG/ATCG` `< 37 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.