| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP000730 | 618,759 | T→C | 11.1% | D1287D (GAT→GAC) | sdrD → | Ser‑Asp rich fibrinogen/bone sialoprotein‑binding protein SdrD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 618,759 | 0 | T | C | 11.1% | 234.8 / 5.7 | 98 | D1287D (GAT→GAC) | sdrD | Ser‑Asp rich fibrinogen/bone sialoprotein‑binding protein SdrD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (42/44); new base C (7/5); total (49/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.59e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGAC‑‑‑‑‑‑TCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCGGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATGCAGGTAAGCACACACCTGTTAAACCAATGAGTACTA > CP000730/618619‑618898 | gattcagatAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGAC‑‑‑‑‑‑TCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCGGATAGTGAt > 2:435389/1‑141 (MQ=255)gattcagatAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGAC‑‑‑‑‑‑TCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCGGATAGTGAt > 1:230553/1‑141 (MQ=255) ttcagatAGCGATTCGGCCTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGAC‑‑‑‑‑‑TCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGCCTCGGATAGTGATTc > 1:133131/1‑141 (MQ=255) tcagatAGTGTTTCAGACTCAGATAGTGATTCAGATTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGAC‑‑‑‑‑‑TCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCGGATAGTGATTCa < 2:472313/141‑1 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(MQ=255) cTCAGACTCGGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATGCAGGTAAGCACACACCTGt < 1:567906/141‑1 (MQ=255) cTCAGACTCGGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATGCAGGTAAGCACACACCTGt < 1:331320/141‑1 (MQ=255) cTCAGACTCGGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACGCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATGCAGGTAAGCACACACCTGt < 1:349101/141‑1 (MQ=255) aCTCGGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATGCAGGTAAGCACACACCTGTTAAAc < 2:530392/141‑1 (MQ=255) aCTCGGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATGCAGGTAAGCACACACCTGTTAAAc > 2:1176553/1‑141 (MQ=255) tCGGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATGCAGGTAAGCACACACCTGTTAAACCa > 2:642749/1‑141 (MQ=255) cGGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATGCAGGTAAGCACACACCTGTTAAACCaa > 1:608352/1‑141 (MQ=255) gATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATGCAGGTAAGCACACACCTGTTAAACCAATg > 2:116233/1‑141 (MQ=255) gATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATGCAGGTAAGCACACACCTGTTAAACCAATGAGtact > 2:1119430/1‑141 (MQ=255) aTTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATGCAGGTAAGCACACACCTGTTAAACCAATGAGtacta < 1:151402/141‑1 (MQ=255) aTTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATGCAGGTAAGCACACACCTGTTAAACCAATGAGtacta < 1:468081/141‑1 (MQ=255) | GATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGAC‑‑‑‑‑‑TCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCGGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATGCAGGTAAGCACACACCTGTTAAACCAATGAGTACTA > CP000730/618619‑618898 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |