| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 631,535 | G→A | 5.6% | intergenic (+161/‑341) | USA300HOU_0566 → / → proP | possible phosphatase/MFS family major facilitator transporter, proline/betaine:cation symporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 631,535 | 0 | G | A | 5.6% | 342.9 / 5.5 | 106 | intergenic (+161/‑341) | USA300HOU_0566/proP | possible phosphatase/MFS family major facilitator transporter, proline/betaine:cation symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (46/53); new base A (3/4); total (49/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
ACCATGGTTAAAATGCATATTCATAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCACTTACATG‑AAGTTATGTGCTATCGCTATTTTTAGTTATAATTCCAA > CP000730/631395‑631670 | cccATGGTTAAAATGCATATTCATAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTg < 1:742470/140‑1 (MQ=255)aCCATGGTTAAAATGCATATTCATAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTg > 1:924486/1‑141 (MQ=255) ccATGGTTAAAATGCATATTCATAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGt > 1:28940/1‑141 (MQ=255) ccATGGTTAAAATGCATATTCATAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGt < 1:254817/141‑1 (MQ=255) aTGGTTAAAATGCATATTCATAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTaa > 1:637023/1‑141 (MQ=255) gTTAAAATGCATATTCATAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTGTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTaaaaa < 2:1071555/141‑1 (MQ=255) ttAAAATGCATATTCATAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAaaat < 2:744799/141‑1 (MQ=255) tAAAATGCATATTCATAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTACAAaaata < 2:785702/141‑1 (MQ=255) aagaaTTCATATTGATAAACATTATATTATAATTAGAAATATTTAGCTTTAAATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTACAAaaata < 2:206909/138‑1 (MQ=255) aaTGCATATTCATAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAaaataaat > 1:692954/1‑141 (MQ=255) aaTGCATATTCATAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCATTGATAATTTATTTTTGTAAaaataaat > 2:130309/1‑141 (MQ=255) aaTGCATATTCATAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATGATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAaaataaat > 1:415351/1‑141 (MQ=255) aTGCATATTCATAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAAtt > 1:1033892/1‑141 (MQ=255) aTGCATATTCATAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAAtt > 1:1094748/1‑141 (MQ=255) aTGCATATTCATAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAAtt > 2:177793/1‑141 (MQ=255) tGCATATTCATAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTa < 1:759219/141‑1 (MQ=255) tGCATATTCATAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTa < 2:1046007/141‑1 (MQ=255) gCATATTCATAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTaa > 1:169466/1‑141 (MQ=255) tatTCATAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGt < 1:77518/141‑1 (MQ=255) tatTCATAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGt > 2:181573/1‑141 (MQ=255) tatTCATAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTCAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGt < 1:750922/141‑1 (MQ=255) tatTCATAAATAATCTAACATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGt < 1:64658/141‑1 (MQ=255) cATAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATg < 1:1013820/141‑1 (MQ=255) aTAAATATTAGATTATACTTAGCAATCCTTCGCTTTAGATTCGGAATTCAAAATACATCTTTATCAACCCCTATGACTTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGa < 1:713852/141‑1 (MQ=255) aTAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGa < 1:1023320/141‑1 (MQ=255) tAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGAc < 2:389738/141‑1 (MQ=255) tAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGAc < 1:933196/141‑1 (MQ=255) aaaTATTAGATTATAATTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTAATTTTTAAAAAAATAAATTAAAGTAATGACa < 2:906305/141‑1 (MQ=255) tatTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACaaaa > 2:213235/1‑140 (MQ=255) tatTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAg < 1:469334/141‑1 (MQ=255) atTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGt < 2:1169206/141‑1 (MQ=255) aTTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAAATTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATAAAAAAAAAAAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTg < 2:746854/141‑1 (MQ=255) ttAAACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAAAATTATGAATTTTTAAAGAATAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGa < 2:812577/141‑1 (MQ=255) tataCTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATATATTAAACATTATGAATTTTTAAATAGTAATGTCTGACTCGTCGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAATTTATTGaa > 2:304540/1‑141 (MQ=255) taCTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGt < 1:1184923/141‑1 (MQ=255) aCTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTa > 1:789777/1‑141 (MQ=255) aCTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTAGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTa > 2:86748/1‑141 (MQ=255) ttAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTaaa < 2:1052883/141‑1 (MQ=255) tAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAAt > 2:533631/1‑141 (MQ=255) tAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAAt > 2:1097413/1‑141 (MQ=255) aGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAAtt > 2:1021260/1‑141 (MQ=255) atatTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGt < 1:348940/141‑1 (MQ=255) tCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATaaa > 1:110468/1‑141 (MQ=255) gCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAGAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACa > 1:882817/1‑141 (MQ=255) gCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAgacacaata > 1:1168389/1‑133 (MQ=255) gCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACa > 2:917242/1‑141 (MQ=255) gCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACGCGGTTATTATTGATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACa > 1:713464/1‑141 (MQ=255) gCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCCGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACa > 2:434136/1‑141 (MQ=255) cTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACAt > 2:905161/1‑141 (MQ=255) tttAGATTAGGTATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTCATGACAAAGTTATTGAATTAAAGTTAGTATAAACAtt < 2:1004795/141‑1 (MQ=255) tttAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACAtt < 1:433052/141‑1 (MQ=255) tttAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACAtt < 1:224680/141‑1 (MQ=255) tttAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACAtt < 2:1160359/141‑1 (MQ=255) tttAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACAtt < 1:520769/141‑1 (MQ=255) ttAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACAttt < 1:474133/141‑1 (MQ=255) ttAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACAttt < 1:1134758/141‑1 (MQ=255) tAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTa < 2:460196/141‑1 (MQ=255) tAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATAc < 2:506888/141‑1 (MQ=255) ggAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAACATAAACTAAAGTAATCACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTCAATACGa > 1:1005635/1‑141 (MQ=255) aaTTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATg < 2:1090829/141‑1 (MQ=255) aaTTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATg < 2:1090818/141‑1 (MQ=255) ttAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCg < 1:464193/141‑1 (MQ=255) tAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGa < 1:1143395/141‑1 (MQ=255) tAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGa > 2:578674/1‑141 (MQ=255) aaataaatATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGaaa < 1:614606/141‑1 (MQ=255) aaataaatATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGaaa < 1:641041/141‑1 (MQ=255) aaataaatATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAAATACAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAGATTGAGTATAAACATTTATATACGATGTCGaaa > 1:941852/1‑141 (MQ=255) ttattaAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAg < 1:231335/141‑1 (MQ=255) aCATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCa > 1:208354/1‑141 (MQ=255) aCATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCa < 2:790917/141‑1 (MQ=255) aCATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCa > 1:1108163/1‑141 (MQ=255) aCATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCa > 1:420915/1‑141 (MQ=255) aCATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCa > 1:854432/1‑141 (MQ=255) cATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCAc < 1:341446/141‑1 (MQ=255) cATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCAc < 1:391162/141‑1 (MQ=255) aTGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCACTTAc > 1:2169/1‑141 (MQ=255) tGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCACTTACa < 1:999705/141‑1 (MQ=255) aaTTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCACTTACATg > 1:51610/1‑141 (MQ=255) ttttAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCACTTACATG‑AAg > 1:1167223/1‑141 (MQ=255) ttttAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCACTTACATG‑AAg < 1:1167654/141‑1 (MQ=255) ttttAAAGAGTAATGTCTGACGCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCACTTACATG‑AAg > 2:843554/1‑141 (MQ=255) tttAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCACTTACATG‑AAGt < 2:1014069/141‑1 (MQ=255) aaaGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCACTTACATG‑AAGTTAt < 1:660987/141‑1 (MQ=255) agTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGTGATAGCATATCACTTACATG‑AAGTTATGTGc < 2:637023/141‑1 (MQ=255) gTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATGTAAATACGATGTCGATAATGGCGATAGCATCTCACTTCCAGG‑ACGTTATGTGCt > 1:1173344/1‑141 (MQ=255) aaTGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTCTTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCACTTACATG‑AAGTTATGTGCTAt < 1:1129230/141‑1 (MQ=255) aaTGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCACTTACATG‑AAGTTATGTGCTAt > 1:322626/1‑141 (MQ=255) gTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCACTTACATG‑AAGTTATGTGCTATCGc < 2:1178402/141‑1 (MQ=255) gTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATAGCGATAGCACATAACTT‑CATGTAAGTGATATGCTATCGc < 1:999720/141‑1 (MQ=37) tCGTTAATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCACTTACATG‑AAGTTATGTGCTATCGCTAttttt < 2:350176/141‑1 (MQ=255) cGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCACTTACATG‑AAGTTATGTGCTATCGCTATTTTTa < 1:1080282/141‑1 (MQ=255) gTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCACTTACATG‑AAGTTATGTGCTATCGCTATTTTTAg < 2:220069/141‑1 (MQ=255) aTAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCACTTACATG‑AAGTTATGTGCTATCGCTATTTTTAGTtat > 2:158580/1‑141 (MQ=255) aaTTTATTTTTACAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCACTTACATG‑AAGTTATGTGCTATCGCTATTTTTAGTTATaa > 1:1078711/1‑141 (MQ=255) aaTTTATTTTTACAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCACTTACATG‑AAGTTATGTGCTATCGCGATTTTTAGTTATaa > 2:290674/1‑141 (MQ=255) aaTTTATTTTTACAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATAGAGAATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCACTTACATG‑AAGTTATATGCTCTCGCTATTTTTAGTTATaa > 2:855222/1‑141 (MQ=255) ttatttTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCACTTACATG‑AAGTTATGTGCTATCGCTATTTTTAGTTATAATTc > 1:547300/1‑141 (MQ=255) ttatttTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCACTTACATG‑AAGTTATGTGCTATCGCTATTTTTAGTTATAATTc > 2:42296/1‑141 (MQ=255) tttttGTAAATATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCACTTACATG‑AAGTTATGTGCTATCGCTATTTTTAGTTATAATTCCaa > 2:1039437/1‑141 (MQ=255) tttttGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCACTTACATG‑AAGTTATGTGCTATCGCTCTTTTTAGTTATAATTCCaa > 1:939522/1‑141 (MQ=255) | ACCATGGTTAAAATGCATATTCATAAATATTAGATTATACTTAGAAATATTTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCACTTACATG‑AAGTTATGTGCTATCGCTATTTTTAGTTATAATTCCAA > CP000730/631395‑631670 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |