| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,854,538 | T→A | 5.9% | intergenic (+236/+177) | 2486 → / ← rarD | DASS family divalent anion:sodium (Na+) symporter/DMT superfamily drug/metabolite transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,854,538 | 0 | T | A | 5.9% | 418.5 / 3.6 | 127 | intergenic (+236/+177) | 2486/rarD | DASS family divalent anion:sodium (Na+) symporter/DMT superfamily drug/metabolite transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (50/67); new base A (2/8); total (52/75) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.97e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
TACGTTTATCCTTTAAATCATTGCGTGCTTCACTGAAAATTTGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGCACACATACCTCAGTCTCACCTCATCATGACACAAAGG > CP000730/2854398‑2854678 | aCGTTTATCCTTTAAATCATTGCGTGCTTCACTGAAAATTTGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATa > 1:1170269/1‑141 (MQ=255) tCCTTTAAATCATTGCGTGCTTCACTGAAAATTTGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑Caaaaaa < 1:796026/141‑1 (MQ=255) tCCTTTAAATCATTGCGTGCTTCACTGAAAATTTGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑Caaaaaa < 1:314473/141‑1 (MQ=255) ccTTTAAATCATTGCGTGCTTCACTGAAAATTTGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAac < 2:1147072/141‑1 (MQ=255) tAAATCATTGCGTGCTTCACTGAAAATTTGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCt > 2:154274/1‑141 (MQ=255) tAAATCATTGCGTGCTTCACTGAAAATTTGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCt > 1:1046502/1‑141 (MQ=255) aTCATTGCGTGCTTCACTGAAAATTTGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCg < 1:1180652/141‑1 (MQ=255) aTCATTGCGTGCTTCACTGAAAATTTGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAAAAAAAAAA‑AAAAAAACACCTTCg < 2:57696/141‑1 (MQ=255) cATTGCGTGCTTCACTGAAAATTTGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGtt < 1:809426/141‑1 (MQ=255) cATTGCGTGCTTCACTAAAAATTTGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTACACTAATCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATAAAAAAA‑CAAAAAACACCTTCGtt < 2:668682/141‑1 (MQ=255) ttGCGTGCTTCACTGAAAATTTGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTa > 2:1044120/1‑141 (MQ=255) ttGCGTGAATAACAGAAAATATGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTAATTAACATTACGTATGCCCTCATAAAAAAAAAAA‑AAAAAAACACCTTCGTTTa < 2:824702/141‑1 (MQ=255) cGTGCTTCACTGAAAATTTGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAAt > 2:775373/1‑141 (MQ=255) tGCTTCACTGAAAATTTGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTc > 1:27631/1‑141 (MQ=255) cTTCACTGAAAATTTGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCAt < 1:776087/141‑1 (MQ=255) cTTCACTGAAAATTTGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCAt > 1:137445/1‑141 (MQ=255) cTTCACTGAAAATTTGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTCAAATTCAt < 1:465147/141‑1 (MQ=255) ttCACTGAAAATTTGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCAtt < 1:167975/141‑1 (MQ=255) cacttcaaaTTGGTTTAAATATTTAATTCATTACGTAACATCACATAAAATACAGTTCTATACTATTCCGCCTCTTTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAAACAAAAAA‑AAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCAtttt < 2:62510/135‑1 (MQ=255) cACTGAAAATTTGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCAtttt < 1:239559/141‑1 (MQ=255) cTGAAAATTTGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTaa < 2:581446/141‑1 (MQ=255) aaaaTTTGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTg < 1:354674/141‑1 (MQ=255) aaaaTTTGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTg < 1:536104/141‑1 (MQ=255) agatgggTATAAAGAGTGAAGTCATTACGGAAAATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCTTTGCTTAACATTACGTATGCCCTCATAAAAAAAAAAA‑AAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGc < 2:531288/135‑1 (MQ=255) aaaTTTGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGc < 1:604025/141‑1 (MQ=255) tttGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGaa > 2:966037/1‑141 (MQ=255) gTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTc > 1:9386/1‑141 (MQ=255) tataAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCa > 1:1188075/1‑141 (MQ=255) ataAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCaa > 1:991788/1‑141 (MQ=255) aTTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAg < 1:62739/141‑1 (MQ=255) aTTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAg > 2:805586/1‑141 (MQ=255) tAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGc < 2:1031742/141‑1 (MQ=255) aaGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGcc > 2:69792/1‑141 (MQ=255) aaGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGcc > 2:91769/1‑141 (MQ=255) aaGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTATATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTGCGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGtt > 1:619999/1‑105 (MQ=255) aGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATACATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTATTTGCGAATTCAACGAAAGTGCCt > 2:808460/1‑141 (MQ=255) aGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCt > 1:341830/1‑141 (MQ=255) aGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCt > 2:765314/1‑141 (MQ=255) aGTCATTACCTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCt < 2:730336/141‑1 (MQ=255) gTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGGATTCAACGAAAGTGCCtt > 1:308554/1‑141 (MQ=255) gTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCtt > 1:308426/1‑141 (MQ=255) tCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTa < 1:1027616/141‑1 (MQ=255) ttACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTAttt < 1:194505/141‑1 (MQ=255) ttACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTCCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAAAAAAAAAA‑AAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTAttt < 2:594485/141‑1 (MQ=255) aaCATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATAtt < 1:932649/141‑1 (MQ=255) aaCATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATAtt < 1:1029001/141‑1 (MQ=255) aaCATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATAtt < 2:959764/141‑1 (MQ=255) aaCATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATAtt > 2:156626/1‑141 (MQ=255) aCATCACATAAAATACATTTTTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATAttt < 1:665424/141‑1 (MQ=255) aTCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTaa < 1:374048/141‑1 (MQ=255) aTCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTaa < 1:439209/141‑1 (MQ=255) aTCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTaa < 1:648431/141‑1 (MQ=255) acaTAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGt < 1:964028/141‑1 (MQ=255) aTAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGttt < 2:1188684/141‑1 (MQ=255) aaTACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCaaa < 1:964514/141‑1 (MQ=255) aTACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAAt > 1:524102/1‑141 (MQ=255) tACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAAtt < 2:761292/141‑1 (MQ=255) tACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAAtt < 2:970148/141‑1 (MQ=255) cATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTta < 1:883238/141‑1 (MQ=255) cATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTta > 2:209656/1‑141 (MQ=255) cATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTta < 2:51166/141‑1 (MQ=255) aTTTCTATACTATTCCGTTTCATTGATCAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATGAAATAAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAAGTGCGAATTCAACGAAAGTGATTTATTTCATATTCAATGTTTTAAATTta > 1:412286/1‑141 (MQ=255) aTTTCTATACTATTCCGTTTCATTGATCAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATGAAATAAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAAGTGCGAATTCAACGAAAGTGATTTATTTCATATTCAATGTTTTAAATTta > 1:795718/1‑141 (MQ=255) tttCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTtata < 1:1111583/141‑1 (MQ=255) tttCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTtata > 1:842137/1‑141 (MQ=255) ttCTATANTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTTCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATCTATAc < 2:894555/141‑1 (MQ=255) aTTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCAc < 2:879550/141‑1 (MQ=255) ccGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGt < 2:204604/141‑1 (MQ=255) ccGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGt > 1:890374/1‑141 (MQ=255) ccGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGt < 2:707226/141‑1 (MQ=255) ccGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGt < 1:154927/141‑1 (MQ=255) cATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGc < 2:1017009/141‑1 (MQ=255) cATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGc < 1:74604/141‑1 (MQ=255) aTTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGca > 1:667156/1‑141 (MQ=255) ttGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGcac < 2:524628/141‑1 (MQ=255) tGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCAAA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGcaca < 2:666923/141‑1 (MQ=255) gATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTAttt > 2:337279/1‑94 (MQ=255) gATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGcacac < 2:148496/141‑1 (MQ=255) aTTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGcacaca < 1:34684/141‑1 (MQ=255) ttAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGCACACAt < 2:933859/141‑1 (MQ=255) aCATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGCACACATAcc < 1:161261/141‑1 (MQ=255) aTTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGCACACATACCTc > 1:521200/1‑141 (MQ=255) aTTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGCACACATACCTc < 2:1134711/141‑1 (MQ=255) cGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAACCACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGCACACATACCTCAGtc > 2:1065546/1‑141 (MQ=255) cGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGCACACATACCTCAGtc > 2:161130/1‑141 (MQ=255) gTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACCGTTACTGCACACATACCTCAGtct > 2:879174/1‑141 (MQ=255) tATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGCACACATACCTCAGtctc > 1:402235/1‑141 (MQ=255) aTGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAATACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGCACACATACCTCAGTCTCa < 1:760488/141‑1 (MQ=255) tGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGca < 1:292940/123‑1 (MQ=255) tGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGca > 2:292940/1‑123 (MQ=255) tAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGCACACATACCTCAGTCTCACCTcatcat > 1:276976/1‑141 (MQ=255) aaaTCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGCACACATACCTCAGTCTCACCTCATCATg < 1:39105/141‑1 (MQ=255) aaTCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGCACACATACCTCAGTCTCACCTCATCATGa < 2:98764/141‑1 (MQ=255) atcatcATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGCACACATACCTCAGTCTCACCTCATCATGac > 1:1171420/1‑141 (MQ=255) atcatcATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGGTACAAATTTATACGCCTGTCACTGTTACTGCACACATACCTCAGGCTCACCTCATCATGac > 1:949809/1‑141 (MQ=255) catcatA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGCACACATACCTCAGTCTCACCTCATCATGacac < 1:99919/141‑1 (MQ=255) catcatA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGCACACATACCTCAGTATCACCTCATCATGacac > 1:664909/1‑141 (MQ=255) atcagA‑CAAAAAACCCCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGCACACATACCTCAGTCTCACCTCAGCATGAcaca < 2:48172/141‑1 (MQ=255) catA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCTAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGCACACATACCTCAGTCTCACCTCATCATGACACaaa < 1:240956/141‑1 (MQ=255) tA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGCACACATACCTCAGTCTCACCTCATCATGACACAAAgg > 1:133826/1‑141 (MQ=255) | TACGTTTATCCTTTAAATCATTGCGTGCTTCACTGAAAATTTGTATAAAGATTTAAGTCATTACGTAACATCACATAAAATACATTTCTATACTATTCCGCTTCATTGATTAACATTACGTATGCCCTCATAAATCATCATA‑CAAAAAACACCTTCGTTTAAATTCATTTTAATTGCGAATTCAACGAAAGTGCCTTATTTCATATTTAATGTTTCAAATTTATACGTCTGTCACTGTTACTGCACACATACCTCAGTCTCACCTCATCATGACACAAAGG > CP000730/2854398‑2854678 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |