BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	CP000730	36,124	G→A	56.7%	A143V (GCT→GTT)	tpn ←	IS431mec transposase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	CP000730	36,124	0	G	A	56.7%	205.3 / inf	617	A143V (GCT→GTT)	tpn	IS431mec transposase
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (134/131); new base A (185/164); total (320/297)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.69e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.31e-01

Only 100 of 621 total aligned reads displayed.

AAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCC  >  CP000730/35984‑36264

aaGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAg                                                                                                                                              >  1:175560/1‑141 (MQ=255)

  gTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGcc                                                                                                                                            >  1:171054/1‑141 (MQ=255)

  gTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATAACGGTGCTCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTAAAAGGAGAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGcc                                                                                                                                            >  2:442294/1‑141 (MQ=14)

  gTATTCTTCGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCCTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGcc                                                                                                                                            <  2:776217/141‑1 (MQ=14)

    aTTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCAt                                                                                                                                          >  2:14711/1‑141 (MQ=255)

      tCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTg                                                                                                                                        <  2:278395/141‑1 (MQ=255)

         ttGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAGGTTTAAAAGCTTTTATTACTTTAACCTTTGCtt                                                                                                                                     >  2:424251/1‑140 (MQ=14)

           gCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTAcc                                                                                                                                   >  2:259596/1‑141 (MQ=255)

           gCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTAcc                                                                                                                                   <  1:361372/141‑1 (MQ=255)

           gCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTAcc                                                                                                                                   <  1:486158/141‑1 (MQ=255)

            cTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCt                                                                                                                                  >  2:117907/1‑141 (MQ=255)

             tGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCtt                                                                                                                                 >  2:741840/1‑141 (MQ=255)

                 ttGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTACTTACTTTAACCATTGCTACCTTCGtt                                                                                                                             >  2:344538/1‑141 (MQ=255)

                 ttGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTCCGtt                                                                                                                             >  1:475674/1‑141 (MQ=255)

                 ttGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTCCTACCTTCGtt                                                                                                                             >  2:218895/1‑141 (MQ=255)

                   gATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGa                                                                                                                           <  1:437670/141‑1 (MQ=255)

                   gATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGATTAAGTTTAAAAGCTTTACTTAATTTAACCATTGCTACCTTCGttta                                                                                                                           >  2:367224/1‑139 (MQ=14)

                    aTACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTTCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGAAGTACAATGGCTTTCAGGTTTTACTTTAAAAGCTTTAAATACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGag                                                                                                                          >  2:102754/1‑140 (MQ=14)

                     tACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATCTGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAg                                                                                                                         <  2:534365/141‑1 (MQ=255)

                     tACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAg                                                                                                                         <  2:824236/141‑1 (MQ=255)

                     tACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAg                                                                                                                         <  1:596133/141‑1 (MQ=40)

                     aaCTGTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGGTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAg                                                                                                                         <  1:144271/140‑1 (MQ=255)

                      aCTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTCCTTTAACCATTGATCCCTTCGTTggcgg                                                                                                                        <  2:616125/141‑5 (MQ=14)

                      aCTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAgg                                                                                                                        <  1:305058/141‑1 (MQ=255)

                      aCTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAgg                                                                                                                        <  1:446929/141‑1 (MQ=255)

                          tGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGGTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCGTCGTTGAAGGTGcc                                                                                                                    >  1:650898/1‑141 (MQ=11)

                           gATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCATATATTTCGATTTACAATGACAGTCAGATTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGGTGCCTTCGTTGAAGGTGCCt                                                                                                                   >  1:72428/1‑141 (MQ=11)

                           gATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCt                                                                                                                   <  1:267163/141‑1 (MQ=255)

                           gATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTACGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCt                                                                                                                   <  2:716607/141‑1 (MQ=255)

                           gATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTACACTATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTAAAGGTGccg                                                                                                                   >  2:326686/1‑140 (MQ=11)

                              aCCTTGTCTTTCTTACTTTAGTAGGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGAt                                                                                                                >  2:632949/1‑141 (MQ=255)

                                cTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCt                                                                                                              <  2:746813/141‑1 (MQ=255)

                                cTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCGTGCTCAATGAGGTGATTCAGATAGTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTGAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCTGTTGCTACCTTAGTTTAAGTTGACGGATCt                                                                                                              >  2:707478/1‑141 (MQ=11)

                                cTTCTCTTTCTTTCTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCt                                                                                                              <  2:391854/141‑1 (MQ=255)

                                 ttGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTg                                                                                                             >  2:836542/1‑141 (MQ=255)

                                 ttGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTAATCtt                                                                                                             >  2:4023/1‑140 (MQ=255)

                                 ttGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTg                                                                                                             >  2:65156/1‑141 (MQ=255)

                                   ttctttcttACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTa                                                                                                           <  1:284610/140‑1 (MQ=255)

                                   gTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTa                                                                                                           <  1:120162/141‑1 (MQ=255)

                                     ttttcttACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTTAATGAGGTTCCTGATCAAAATCTATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTaac                                                                                                         <  1:605360/140‑2 (MQ=11)

                                     ttttcttACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTaac                                                                                                         <  2:192021/140‑2 (MQ=255)

                                      tttcttACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAAtt                                                                                                        >  2:298633/1‑141 (MQ=255)

                                        tcttACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTAc                                                                                                      >  1:40143/1‑141 (MQ=255)

                                        tcttACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTAc                                                                                                      <  1:577306/141‑1 (MQ=255)

                                         cttACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTAcc                                                                                                     >  2:555456/1‑141 (MQ=255)

                                         cttACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTAcc                                                                                                     >  1:709129/1‑141 (MQ=255)

                                          ttACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCt                                                                                                    <  1:810648/141‑1 (MQ=255)

                                           tACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAATTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCtt                                                                                                   <  1:2107/141‑1 (MQ=11)

                                                 aaTATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATGTTTAGATGTAAAATGGCAGGCAGATTCCGTTCGAAGAGCTTTAATTACTTTGATTTTTGCTACCTTGCTTCAAGGTGCCTGATCGGTAATTACCTTTTGAgt                                                                                             >  1:826782/1‑140 (MQ=2)

                                                 aaTATCGCGGTGATCTTGCTCAATGAGGCTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAGGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAgg                                                                                             <  1:189392/141‑1 (MQ=11)

                                                   tatGACGGTGATCTTTCTCTATGTGCTTTTTCAGAGCTTTCGATGCCCAATGGCATTAAGGTGTAAGTTTAAAAGCTTTAATTGTTCTATCCATTGCTACCTGCGTTGAAGGTGCCGGATCTGTAATTACCTTTTGAGGtt                                                                                           <  2:315454/141‑1 (MQ=2)

                                                   tatGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAggct                                                                                           <  1:29432/141‑3 (MQ=255)

                                                    atGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGttt                                                                                          <  1:520124/141‑1 (MQ=255)

                                                    atGACGGTGATCTTGCTCAAGGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGttt                                                                                          <  2:813996/141‑1 (MQ=21)

                                                      gACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTAc                                                                                        >  1:734527/1‑141 (MQ=11)

                                                       aCGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTCATTACTTTAGCCATTGCTATCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTAcc                                                                                       <  2:177721/141‑1 (MQ=255)

                                                         ggTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCaa                                                                                     >  1:629907/1‑141 (MQ=18)

                                                          gTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCaaa                                                                                    <  1:227267/141‑1 (MQ=11)

                                                           tGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCGAAt                                                                                   >  1:239019/1‑141 (MQ=11)

                                                            gATCTTGCTCAATGGGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAAtt                                                                                  <  2:687160/141‑1 (MQ=17)

                                                             aTCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTg                                                                                 >  2:123411/1‑141 (MQ=17)

                                                              tCTTGCTCAATGAGGATATCCAGATATTTCGATGTACAATGACAGCCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGCAACTTCCTTTTGAGGCTTACCAAATTGt                                                                                >  2:171565/1‑141 (MQ=11)

                                                               cTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGGTCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGtt                                                                               >  2:382419/1‑141 (MQ=12)

                                                               cTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGtt                                                                               >  2:586969/1‑141 (MQ=12)

                                                                ttGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACAAAATTGttt                                                                              >  2:797033/1‑141 (MQ=255)

                                                                  gCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTATTTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTaa                                                                            >  1:342773/1‑141 (MQ=11)

                                                                   cTCAATGAGTTTATTCAGAGATTGCTATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAATAGCTTTAATTACTTTAACGATTGCTACCGTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGGTATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAAt                                                                           <  2:51421/141‑1 (MQ=11)

                                                                     cAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATga                                                                         <  2:608864/141‑1 (MQ=17)

                                                                         gAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACg                                                                     >  1:741942/1‑141 (MQ=17)

                                                                          gggTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGt                                                                    <  2:450594/140‑1 (MQ=12)

                                                                          aGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATCTTAGCCATTGCTGTCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGCAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGt                                                                    <  2:544839/141‑1 (MQ=11)

                                                                            gTTATTCAGATATTTGTATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGttt                                                                  <  2:595351/141‑1 (MQ=17)

                                                                            gTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGttt                                                                  >  2:273123/1‑141 (MQ=12)

                                                                            gTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTCAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGttt                                                                  >  1:769975/1‑141 (MQ=12)

                                                                             ttATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAACTTGTTTAATGAGACGTTTg                                                                 >  1:502036/1‑141 (MQ=11)

                                                                              tATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGa                                                                <  2:9225/141‑1 (MQ=17)

                                                                              tATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGa                                                                <  1:88161/141‑1 (MQ=12)

                                                                               aTTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGCTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCCTTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGCTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGCTAGAt                                                               >  2:500316/1‑141 (MQ=11)

                                                                               aTTCAGATATTTCGATGTACAATGAGAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGAt                                                               <  1:563122/141‑1 (MQ=11)

                                                                                ttCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATa                                                              <  2:235248/141‑1 (MQ=17)

                                                                                ttCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTTATCTTGAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATa                                                              <  2:48016/141‑1 (MQ=11)

                                                                                 tCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATaa                                                             >  2:465247/1‑141 (MQ=17)

                                                                                 tCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAACTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATaa                                                             >  1:458182/1‑141 (MQ=12)

                                                                                 tCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATaa                                                             <  1:321157/141‑1 (MQ=11)

                                                                                  cagttattgccagctACAGTGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATaaa                                                            <  1:680928/127‑1 (MQ=11)

                                                                                     atatTTCTATGTACAATGGCAGTCAGGTATAAGCTTAAACGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCATCGTTGAAGATGCCTGATCTGTAATTACCTATTAAGGTTTACCAAATTGTTTAATCAAACAGTTGAAAAACga                                                         >  2:570950/1‑140 (MQ=11)

                                                                                     atatTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGc                                                         >  2:758774/1‑141 (MQ=12)

                                                                                      tatTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAAGGCa                                                        >  2:786744/1‑141 (MQ=12)

                                                                                         ttCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGGGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCatat                                                     >  2:213645/1‑141 (MQ=11)

                                                                                          tCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATg                                                    <  1:658325/141‑1 (MQ=17)

                                                                                          tCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATg                                                    >  1:792248/1‑141 (MQ=17)

                                                                                            gATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCt                                                  >  1:102724/1‑141 (MQ=11)

                                                                                            gATGTACAATGACAGTCAGGGTTAAGTTAAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCt                                                  >  1:543090/1‑141 (MQ=11)

                                                                                              tGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGa                                                >  1:135585/1‑141 (MQ=32)

                                                                                               gTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGaa                                               <  1:419923/141‑1 (MQ=32)

                                                                                                 aCAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTTAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATg                                             <  2:414020/141‑1 (MQ=12)

                                                                                                 aCAATGGCAGTCAGGTTGATGTTTAAAAGCTTTAATTCCTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACATTTGATAAACGCATATGCTGAATg                                             <  1:534774/141‑1 (MQ=11)

                                                                                                      gACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTAt                                        <  1:258382/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                        tttAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAatgtatg      <  1:383292/141‑1 (MQ=2)

                                                                                                                                        tttAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAatgtatg      <  2:668500/141‑1 (MQ=11)

AAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCC  >  CP000730/35984‑36264

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 12 ≤` `ATCG/ATCG` `< 13 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`