| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 111,560 | T→C | 11.4% | R210R (CGT→CGC) | USA300HOU_0110 → | possible staphylococcal tandem lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 111,560 | 0 | T | C | 11.4% | 206.4 / 13.4 | 87 | R210R (CGT→CGC) | USA300HOU_0110 | possible staphylococcal tandem lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (42/34); new base C (6/4); total (48/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
AAGTTTTTTGCGCAATATAGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAAATGAAAATATTTACTTTACTG > CP000730/111423‑111699 | aaGTTTTTTGCGCAATATAGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTaaa < 2:299414/141‑1 (MQ=255) aGTTTTTTGCGCAATATAGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGCaaaa > 2:84254/1‑141 (MQ=255) tttttttGCGCAATATAGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGCAAAAg < 2:471619/140‑1 (MQ=255) gTTTTTTGCGCAATATAGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAg < 1:286310/141‑1 (MQ=255) tGCGCAATTTTGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGa < 1:238781/141‑1 (MQ=255) tGCGCAATATAGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTAAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGa < 1:364018/141‑1 (MQ=255) gcgcAATATAGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAGAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGAA‑TATAATGTAAAACAATTACGCAAAAGATATGat > 2:765545/1‑140 (MQ=17) gcgcAATATAGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGAAGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGCAAAAGATATGat > 1:614702/1‑140 (MQ=255) cgcAATATAGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGCAAAAGATATGata < 2:364865/141‑3 (MQ=255) cgcAATATAGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATAACAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGCAAAAGATATGata < 1:279765/141‑3 (MQ=14) cgaaaTATATCAATTTTAAAGATTTAATGAAGTATAAAGATGGAGATGTATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATTATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACa < 2:63852/138‑1 (MQ=18) gcAATATAGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACAt > 1:734403/1‑141 (MQ=255) gcAATATAGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACAt < 1:320128/141‑1 (MQ=255) cAATATAGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGGTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGCTGAT‑TATAATGTAAAAAAATTACGCCAAAGATATGAtata > 1:79126/1‑141 (MQ=14) aataGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATCAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGCAAAAGATATGATATAccg < 2:382414/140‑2 (MQ=14) ataGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACaaa > 2:614496/1‑141 (MQ=255) aGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGCAAAAGATATGATATAcggacg > 2:419636/1‑136 (MQ=14) gCAATTTTAAAGGTTCAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAAAATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACcaacaa < 1:286491/141‑1 (MQ=255) gCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACcaacaa > 1:250268/1‑141 (MQ=255) cAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACaaa > 1:133188/1‑141 (MQ=255) cAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACaaa < 1:553466/141‑1 (MQ=255) tAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAgc > 1:804156/1‑141 (MQ=255) aaaGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACAAACAAATAAAgcg > 2:647661/1‑141 (MQ=255) aaGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAgcgc > 1:624413/1‑141 (MQ=255) aaGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCAGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAAAAAATAAAgagc > 2:304155/1‑141 (MQ=255) aGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAACTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGcc < 2:624731/141‑1 (MQ=255) ttAATGAATTATAAAGACGGAGATATATCATATAACCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCCCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAg < 1:145073/141‑1 (MQ=255) tGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCtgt > 2:456270/1‑141 (MQ=255) tGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCtgt > 2:775565/1‑141 (MQ=255) tGAAATATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATATAGCGCCGAAGCtgt > 1:598001/1‑141 (MQ=255) aaTTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCtgttg < 1:263393/141‑1 (MQ=255) aaaGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAATGTCATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGaaa < 1:575769/141‑1 (MQ=255) aaaGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGaaa < 2:705033/141‑1 (MQ=255) aaaGATGGAGACATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTATCTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGaaa < 2:212497/141‑1 (MQ=255) aGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGAGATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGACAgg > 2:588196/1‑141 (MQ=255) aatatatCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAggg < 2:324518/140‑1 (MQ=255) tatatCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGaa > 2:319548/1‑141 (MQ=255) atatCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTACTAATGAT‑TATAATATAAAACAATTACGTAAAAGATAAGACATCCCAACAAATAAAGCGACAAAGACAGTGCAGAAAGGAACAgggcaa > 2:659280/1‑138 (MQ=14) atatCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAAt > 2:379954/1‑141 (MQ=255) atatCATATAATCCAGAGGTGCCGAGATATACAGCTCAATTACAATTAACCAATGATGAT‑TATAATGTAAAAAAATTACGTAATAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAAt > 2:412429/1‑141 (MQ=17) tCACATAACCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATACCAATTAACCAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACCTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTa < 2:503417/141‑1 (MQ=14) aTCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGtt > 1:387304/1‑141 (MQ=255) aTCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGtt < 1:403226/141‑1 (MQ=255) cAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTtcat > 2:671213/1‑141 (MQ=255) agGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGCGGAG‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAg > 1:576411/1‑141 (MQ=255) agGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGGACAGAGAATTT‑AAAGGTTCATCGGt > 2:311475/1‑141 (MQ=255) gTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGtt > 2:17804/1‑141 (MQ=255) gTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGAAATTTAAAAGGTTCATCAGtt > 1:289519/1‑141 (MQ=255) gAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGata < 1:602715/141‑1 (MQ=255) ggTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGatat < 2:319887/140‑1 (MQ=255) tATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATaaa > 2:698854/1‑141 (MQ=255) aTTCAGCTCAATATCCATTGAATAAT‑ATAATAGATAATGTACAACAATTACGTAAAAGATATGACAGACCAACAAATAAAGATCCGAAGCTGGTGGTGAAAGGTAGAGGGTATTGAAAAGGTTCATCAGTTGGATATaaaa > 2:807279/1‑141 (MQ=14) aTTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGACGCTGTTGTTGAAAGTTACAGCGACTCTAAAAGGGTCATCAGTTGGATATgaaa > 2:337665/1‑141 (MQ=17) gCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATaaaaaaact > 2:836845/1‑139 (MQ=255) cTCAATATCAATAAACTAATGATGAT‑TATAAAGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGAAAATAAAAAAATTg < 2:254370/141‑1 (MQ=255) cAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGGTATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAAGTGaa < 1:570541/141‑1 (MQ=255) cAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGaa < 2:526914/141‑1 (MQ=255) cAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGaa < 2:721437/141‑1 (MQ=255) tCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAGAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTAc > 1:126515/1‑141 (MQ=255) tCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTAc > 1:552925/1‑141 (MQ=255) tCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGATGTTGTTGGAAGGTACAGGGAAATTAAAAGGTTCATCAGTCGGATCTAAAAAATATGAAtgtgc > 2:836085/1‑137 (MQ=14) aaTTAACTAATGATGAT‑TAAAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACtt < 2:450702/141‑1 (MQ=255) aTTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACttt > 2:12343/1‑141 (MQ=255) ttAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACtttt > 2:120764/1‑141 (MQ=255) aaCTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACtttttt < 1:489845/141‑1 (MQ=255) aaCTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACtttttt > 2:687136/1‑141 (MQ=255) tgatgaT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGaa > 1:80300/1‑141 (MQ=255) gatgat‑TATAATGTAAAACAGTTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAAt < 1:401049/141‑1 (MQ=255) gatgat‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAAt > 1:392348/1‑141 (MQ=255) gatgat‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAAt > 1:403151/1‑141 (MQ=255) atgat‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAGTTTACTTTTTTAGAGAATa > 1:7696/1‑141 (MQ=255) tgat‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTCAGAGAATaa < 1:614496/141‑1 (MQ=255) at‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACTAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATaaaa < 2:759256/141‑1 (MQ=255) ataATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAAATg < 2:247335/141‑1 (MQ=255) ataATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAAATg < 2:100592/141‑1 (MQ=255) aaTGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAACTgca > 2:206919/1‑139 (MQ=255) aTGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGAGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTGTTTAGAGAATAAAAATGaaa < 1:588196/141‑1 (MQ=255) tggaacaCAATTACGGAAAAGATATGACATACCAACAAATAAGGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTGAAAAGGTTCATCAGTTTGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTATAGAATAAAAATGaaaa < 2:495795/135‑1 (MQ=18) tAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAAATGAAAata < 1:319548/141‑1 (MQ=255) aaaCAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAAATGAAAATAtt > 1:53596/1‑141 (MQ=255) aTTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAAATGAAAATAtttactt > 1:467372/1‑141 (MQ=255) tACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAAATGAAAATAtttacttta > 1:141199/1‑141 (MQ=255) tACGTAAAAGATATGACATACAACTTAATAAATCGCCGACAATCAGGACAATCTGTATAGGGAATTTAAAAGGTTGATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAAATGAAAATAtttacttta < 1:604760/141‑1 (MQ=16) tACGCAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAAATGAAAATAtttacttta > 1:568855/1‑141 (MQ=255) aCGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAAATGAAAATAtttactttac < 2:738810/141‑1 (MQ=255) gTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAAATGAAAATATTTACTTTACTg > 1:343426/1‑141 (MQ=255) gTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAAATGAAAATATTTACTTTACTg > 1:804672/1‑141 (MQ=255) | AAGTTTTTTGCGCAATATAGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGAT‑TATAATGTAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAAATGAAAATATTTACTTTACTG > CP000730/111423‑111699 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |