Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	CP000730	2,337,959	C→T	intergenic (‑125/‑119)	adhR ← / → USA300HOU_2196	possible MerR family transcriptional regulator/hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	CP000730	2,337,959	0	C	T	98.5%	216.6 / NA	68	intergenic (‑125/‑119)	adhR/USA300HOU_2196	possible MerR family transcriptional regulator/hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  major base T (45/22);  minor base A (0/1);  total (45/23)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.38e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

GACTTCTTTAGTTTTCATTGCGACTATCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTACATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGAAAATTTGGGTGATCGATTGT  >  CP000730/2337817‑2338104                                                                                                                                               |                                                                                                                                                  gACTTCTTTAGTTTTCATTGCGACTATCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCa                                                                                                                                             >  1:901804/1‑149 (MQ=255)            ttttCATTGCGACTATCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTGTTATGCCTATTGTAATGTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAAt                                                                                                                                  >  1:1048835/1‑149 (MQ=255)            ttttCATTGCGACTATCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTCGAGGACGAAGGTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAAt                                                                                                                                  >  1:1049275/1‑149 (MQ=255)                   tGCGACTATCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGACTACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTTTATTTCATCGTTTTTTATTACtttt                                                                                                                           >  1:84041/1‑148 (MQ=255)                   tGCGACTATCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTa                                                                                                                           >  1:895928/1‑149 (MQ=255)                   tGCGACTATCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTa                                                                                                                           >  1:645830/1‑149 (MQ=255)                     cGACTATCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTGATATATTGTCCTATTCGTTTGAGTACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTaaa                                                                                                                         >  1:766574/1‑149 (MQ=255)                           tCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAAGTTAAATTTGTCTCTTTTTTCACATTTTATCTTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGt                                                                                                                   >  1:539068/1‑149 (MQ=255)                           tCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCCAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAACATTGt                                                                                                                   >  1:562616/1‑149 (MQ=255)                               ttCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATaa                                                                                                               >  1:911373/1‑149 (MQ=255)                                  aGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACtt                                                                                                            >  1:229931/1‑149 (MQ=255)                                  aGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACtt                                                                                                            >  1:253268/1‑149 (MQ=255)                                    ttATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTTTGTAACTTaa                                                                                                          >  1:173396/1‑149 (MQ=255)                                       tGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTATTTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAatt                                                                                                       >  1:733568/1‑148 (MQ=255)                                          ttGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTACTTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATAttt                                                                                                    >  1:315359/1‑149 (MQ=255)                                          ttGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTGATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACCTTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTGTAACTTAAATAttt                                                                                                    >  1:55421/1‑149 (MQ=255)                                             gtcgtcTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATGACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATGACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTaaa                                                                                                 >  1:753294/1‑149 (MQ=255)                                               cgtcTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAAt                                                                                               >  1:359246/1‑149 (MQ=255)                                                 tcTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTACAAATTGTATAACTTAAATTTTTAAAATgt                                                                                             >  1:394794/1‑148 (MQ=255)                                                    aaaGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGatat                                                                                          >  1:1068465/1‑149 (MQ=255)                                                       gTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAAt                                                                                       <  1:296887/149‑1 (MQ=255)                                                       gTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAAt                                                                                       >  1:446134/1‑149 (MQ=255)                                                       gTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAAt                                                                                       <  1:308253/149‑1 (MQ=255)                                                            gTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTa                                                                                  >  1:185014/1‑149 (MQ=255)                                                            gTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTa                                                                                  >  1:451959/1‑149 (MQ=255)                                                            gTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTa                                                                                  >  1:931111/1‑149 (MQ=255)                                                              tGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTaaa                                                                                >  1:989082/1‑148 (MQ=255)                                                              tGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTaaa                                                                                >  1:950021/1‑148 (MQ=255)                                                              tGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAg                                                                                >  1:249403/1‑149 (MQ=255)                                                               gCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGa                                                                               >  1:1094945/1‑149 (MQ=255)                                                                  ttATATATTTTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAATTTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTg                                                                            <  1:259921/149‑1 (MQ=255)                                                                  ttATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTg                                                                            <  1:512798/149‑1 (MQ=255)                                                                      ttatTGTCATCTTCGTTGGAACATTTCTTATTTTTTTTCTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCATTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGataa                                                                        <  1:687293/148‑1 (MQ=255)                                                                      atatTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGataa                                                                        >  1:1025377/1‑149 (MQ=255)                                                                        atTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGataata                                                                      >  1:158493/1‑149 (MQ=255)                                                                        atTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGataata                                                                      >  1:1019875/1‑149 (MQ=255)                                                                            tCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTCAATATTTAAAATGATATTATCACTACGATTGTTAATAtttt                                                                  >  1:173848/1‑148 (MQ=255)                                                                            tCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTGCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTa                                                                  >  1:171058/1‑149 (MQ=255)                                                                                 ttCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAAtttt                                                             <  1:757920/149‑1 (MQ=255)                                                                                               tcttATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTAtttt                                               <  1:1105267/149‑1 (MQ=255)                                                                                                cttATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTa                                              >  1:988953/1‑149 (MQ=255)                                                                                                    ttttattACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTg                                          >  1:190223/1‑149 (MQ=255)                                                                                                       tattaCTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGcct                                       >  1:329696/1‑147 (MQ=255)                                                                                                          taCTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAAttt                                    >  1:901522/1‑149 (MQ=255)                                                                                                             tCAAATTTAAATTTGTCTTTTTTTCCACATCTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTg                                 <  1:921792/149‑1 (MQ=255)                                                                                                              cAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTTACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTgg                                >  1:629847/1‑149 (MQ=255)                                                                                                              cAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTgg                                >  1:1063944/1‑149 (MQ=255)                                                                                                              cAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACGAAGATTGATAATATTTAGTTTTTTGAGAATGATTTTAGTTGCACTTTTTgg                                >  1:58216/1‑149 (MQ=255)                                                                                                               aaatttaaatttGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTggg                               >  1:714943/1‑149 (MQ=255)                                                                                                                     aaatttGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGc                         <  1:696132/149‑1 (MQ=255)                                                                                                                     aaatttGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGc                         >  1:211031/1‑149 (MQ=255)                                                                                                                     aaatttGGCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTACAATTATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGc                         <  1:434403/149‑1 (MQ=255)                                                                                                                      aatttGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCg                        >  1:332900/1‑149 (MQ=255)                                                                                                                      aatttGTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTGAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGATAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCg                        <  1:716118/149‑1 (MQ=255)                                                                                                                           gTCTCTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATACTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGaaaa                   <  1:262335/149‑1 (MQ=255)                                                                                                                            tctcTTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTCCAATTTTTGGGTGATGCGGAAAAt                  <  1:626990/149‑1 (MQ=255)                                                                                                                              tctTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTATTTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGAAAAttt                >  1:1048501/1‑149 (MQ=255)                                                                                                                              tctTTTTTAACACTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGAAAAttt                <  1:978788/149‑1 (MQ=255)                                                                                                                               ctTTTTTAACATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGAAAATTTg               <  1:415037/149‑1 (MQ=255)                                                                                                                                      aaaaTTTAAAATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTTAGATTGATAAGATTTAATGTTTTGAAAATTATTTAAGCTTCAATTGTTGGGTGATGCGGAAAATTTGGGTGATc        <  1:382914/146‑1 (MQ=255)                                                                                                                                      aaCATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGAAAATTTGGGTGATc        <  1:514864/149‑1 (MQ=255)                                                                                                                                      aaCATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGAAAATTTGGGTGATc        <  1:1086961/149‑1 (MQ=255)                                                                                                                                      aaCATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGAAAATTTGGGTGATc        <  1:790853/149‑1 (MQ=255)                                                                                                                                        cATTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAGATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGAAAATTTGGGTGATCGa      <  1:496736/149‑1 (MQ=255)                                                                                                                                         tttttATATTTCATCGTTTTTAATTACTTCAAAAATTGTATAACTTGAAGATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATGATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGAAAATTTGGGTGATCGAt     <  1:865254/148‑1 (MQ=255)                                                                                                                                         aTTTTATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGAAAATTCGGGGGATCGAt     >  1:859823/1‑149 (MQ=255)                                                                                                                                           tttATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGAAAATTTGGGTGATCGATTg   <  1:230799/149‑1 (MQ=255)                                                                                                                                            ttATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGGATAACTTCAATATTTAAAATGATACAATCACAAAGATTGGGAATATTTAATTTTTTGTAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGAAAATTTGGGTGATCGATTGt  <  1:325390/149‑1 (MQ=255)                                                                                                                                               |                                                                                                                                                  GACTTCTTTAGTTTTCATTGCGACTATCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTTACATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGAAAATTTGGGTGATCGATTGT  >  CP000730/2337817‑2338104

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑