Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP000730 | 76,322 | 0 | G | A | 49.0% | 27.9 / 287.1 | 226 | intergenic (+380/‑754) | USA300HOU_0072/USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase |
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Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
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ataTCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTG‑GTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATaa < 1:106540/140‑1 (MQ=255) aaTCTAAGATATTCATTGAGCTAACGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTG‑GTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATaaa < 2:104296/140‑1 (MQ=11) aGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTG‑GTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATaaaaaagct > 2:339999/1‑137 (MQ=11) aGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTG‑GTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATaaaaaaact > 2:69117/1‑137 (MQ=11) atatGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTG‑GTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAACAAGCATaaaaaagctta > 1:327324/1‑135 (MQ=11) tGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTG‑GTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTaa > 1:128938/1‑140 (MQ=40) tGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTG‑GTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTAc < 1:232084/141‑1 (MQ=255) tATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTG‑GTGTAAACGTTAATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTa > 1:12623/1‑141 (MQ=255) cGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTG‑GTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTAttt > 1:191059/1‑140 (MQ=39) atatatCTGAAATATTAAGGGAACGTG‑GTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCCATTGTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATtgatga < 1:103729/141‑1 (MQ=255) tatatCTGAAATATTAAGGGAACGTG‑GTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATgag > 1:220074/1‑141 (MQ=38) | AGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTG‑GTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAA > CP000730/76184‑76457 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |