| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 567,389 | 0 | A | T | 72.3% | 142.4 / 69.2 | 83 | Q95L (CAA→CTA) | ctsR | CtsR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (11/12); new base T (29/31); total (40/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.60e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTCACTAATGAACATGGTTATGAAATCGAAAGTAAACGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCAACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTAAAATGATTCAAGCAGTTATTGATAGAGAAACGCTATCAATGGATATGGTTTCTAGAGATATTATTAGAGCAA > CP000730/567253‑567526 | ttCACTAATGAACATGGTTATGAAATCGAAAGTAAACGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTctacaa > 2:160255/1‑141 (MQ=255) cTAATGAACATGGTTATGAAATCGAAAGTAAACGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAg > 1:673186/1‑141 (MQ=255) cTAATGAACATGGTTATGAAATCGAAAGTAAACGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCAACAACAAg > 1:979984/1‑141 (MQ=255) tAATGAACATGGTTATGAAATCGAAAGTAAACGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGc < 1:109917/141‑1 (MQ=255) tAATGAACATGGTTATGAAATCGAAAGTAAACGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCAACAACAAGc > 2:1007088/1‑141 (MQ=255) cATGGTTATGAAATCGAAAGTAAACGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTtattat > 1:785688/1‑141 (MQ=255) cATGGTTATGAAATCGAAAGTAAACGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTtattat < 2:757560/141‑1 (MQ=255) cATGGTTATGAAATCGAAAGTAAACGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTtattat > 2:811367/1‑141 (MQ=255) cATGGTTATGAAATCGAAAGTAAAC‑‑‑GTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTtattatatt > 2:821588/1‑141 (MQ=255) aTGGTTATGAAATCGAAAGTAAACGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTtattata < 1:299404/141‑1 (MQ=255) tGGTTATGAAATCGAAAGTAAACGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTtattatat > 2:952276/1‑141 (MQ=255) tGGTTATGAAATCGAAAGTAAACGTGGTGGTGGTGGTTACAGCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTGTATTACAGGTGCAAGCTtattatat < 2:529112/141‑1 (MQ=255) gTTATGAAATCGAAAGTAAACGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTtattatatta > 1:31434/1‑141 (MQ=255) aTGAAATCGAAAGTAAACGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTg > 2:170811/1‑141 (MQ=255) aTGAAATCGAAAGTAAACGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCAACAACAAGCTTATTATATTATTg > 2:403495/1‑141 (MQ=255) cGAAAGTAAACGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAg > 1:353088/1‑119 (MQ=255) cGAAAGTAAACGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAg < 2:353088/119‑1 (MQ=255) cGAAAGTAAACGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCt > 2:619758/1‑141 (MQ=255) gAAAGTAAACGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCtt > 2:443162/1‑141 (MQ=255) aaGTAAACGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCAACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCtttt > 2:140350/1‑141 (MQ=255) gTAAACGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAg > 1:128042/1‑141 (MQ=255) gTAAACGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAg < 1:891910/141‑1 (MQ=255) gTAAACGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCAACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAg < 2:1045690/141‑1 (MQ=255) gTAAACGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATAGAAAATAAAGATGCAACAGCTTATGTTAATCAATCGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCAACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAg < 1:829360/141‑1 (MQ=255) aaaCGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGAt < 2:634530/141‑1 (MQ=255) aaaCGTGGTGGTGGTGGTTACATACGAATCAATAAAACTGAAAATAAAGGTGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTATACAACAAGCTTATTATATGCTTGATGGGGNTTTAGAt > 2:784473/1‑141 (MQ=255) aaCGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATa < 2:257942/141‑1 (MQ=255) aCGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATaa < 2:379208/141‑1 (MQ=255) cGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATaaa > 1:465036/1‑141 (MQ=255) gtggtggtggtgGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATaaaa < 1:889484/141‑1 (MQ=255) tggtggtggtggTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAAt < 2:26629/141‑1 (MQ=255) tggtggtggtTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGtt > 2:915776/1‑141 (MQ=255) ggtggtggtTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTta < 2:569357/141‑1 (MQ=255) gtggtggtTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTtaa < 2:856719/141‑1 (MQ=255) gtggtggtTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTtaa > 1:926194/1‑141 (MQ=255) gtggtggtTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTtaa < 2:781168/141‑1 (MQ=255) tggtggtTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCAACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTtaat > 1:594627/1‑141 (MQ=255) tggtTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCAACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATaaa < 2:175246/141‑1 (MQ=255) tggtTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCAACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATaaa < 1:939231/141‑1 (MQ=255) ggtTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAAt > 1:44424/1‑141 (MQ=255) ggtTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAAt < 1:878852/141‑1 (MQ=255) aCATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAAc > 1:894028/1‑141 (MQ=255) tCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCAACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTg < 1:1040563/141‑1 (MQ=255) tCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCAACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTg < 1:436397/141‑1 (MQ=255) cGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGaa > 2:656753/1‑141 (MQ=255) aTCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCt < 1:424156/141‑1 (MQ=255) aTCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCt < 1:976615/141‑1 (MQ=255) aTCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCt > 2:111797/1‑141 (MQ=255) aCTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCAACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTaaa < 2:1020805/141‑1 (MQ=255) aCTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCAACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTaaa > 2:1031302/1‑141 (MQ=255) aCTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCAACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTaaa < 1:498092/141‑1 (MQ=255) aaaaTTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTAAAATg < 1:127408/141‑1 (MQ=255) aaaTTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTAAAATGa < 2:166401/141‑1 (MQ=255) tGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTAAAATGATTCa < 1:85907/141‑1 (MQ=255) aaaaTAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTAAAATGATTCAAg < 2:850405/141‑1 (MQ=255) aaaTAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTAAAATGATTCAAGc > 1:729068/1‑141 (MQ=255) aaaTAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCAACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTAAAATGATTCAAGc > 1:131033/1‑141 (MQ=255) aaTAAAGATGCAACAGTTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTGTAGATAAAATGTTAATAAAAGAACGTGAATCTAAAATGATTCAAGCa < 2:739114/141‑1 (MQ=255) aTGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTAAAATGATTCAAGCAGTTATTg < 2:158286/141‑1 (MQ=255) aGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTATACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTAAAATGATTCAAGCAGTTATTGATAgaga > 2:27010/1‑141 (MQ=255) tatTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTAAAATGATTCAAGCAGTTATTGATAGAGAAACGCt > 1:833100/1‑141 (MQ=255) ttAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTAAAATGATTCAAGCAGTTATTGATagcgtttctctat < 1:638871/141‑12 (MQ=255) ttAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTAAAATGATTCAAGCAGTTATTGATAGAGAAACGCTAt > 1:691999/1‑141 (MQ=255) tAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTAAAATGATTCAAGCAGTTATTGATAGAGAAACGCTATc < 2:1037962/141‑1 (MQ=255) tCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCAACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTAAAATGATTCAAGCAGTTATTGATAGAGAAACGCTATCAAt < 1:586127/141‑1 (MQ=255) tCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCAACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTAAAATGATTCAAGCAGTTATTGATAGAGAAACGCTATCAAt > 2:464048/1‑141 (MQ=255) ttGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTAAAATGATTCAAGCAGTTATTGATAGAGAAACGCTATCAATGGat < 2:894028/141‑1 (MQ=255) gCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTAAAATGATTCAAGCAGTTATTGATAGAGAAACGCTATCAATGGatat > 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tCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCAACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTAAAATGATTCAAGCAGTTATTGATAGAGAAACGCTATCAATGGATATGGt > 1:439052/1‑141 (MQ=255) cAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCAACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTAAAATGATTCAAGCAGTTATTGATAGAGAAACGCTATCAATGGATATGGtt < 2:957228/141‑1 (MQ=255) aGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTAAAATGATTCAAGCAGTTATTGATAGAGAAACGCTATCAATGGATATGGttt > 1:541150/1‑141 (MQ=255) cTGATTGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTAAAATGATTCAAGCAGTTATTGATAGAGAAACGCTATCAATGGATATGGTTTCt < 2:507710/141‑1 (MQ=255) aTTGGACCTTCTATTTCTCAACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTAAAATGATTCAAGCAGTTATTGATAGAGAAACGCTATCAATGGATATGGTTTCTaga < 2:761910/141‑1 (MQ=255) ttGGACCTTCTATTTCTCTACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTAAAATGATTCAAGCAGTTATTGATAGAGAAACGCTATCAATGGATATGGTTTCTagag < 1:523841/141‑1 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1:626580/141‑1 (MQ=255) | TTCACTAATGAACATGGTTATGAAATCGAAAGTAAACGTGGTGGTGGTGGTTACATCCGAATCACTAAAATTGAAAATAAAGATGCAACAGGTTATATTAATCATTTGCTTCAGCTGATTGGACCTTCTATTTCTCAACAACAAGCTTATTATATTATTGATGGGCTTTTAGATAAAATGTTAATAAATGAACGTGAAGCTAAAATGATTCAAGCAGTTATTGATAGAGAAACGCTATCAATGGATATGGTTTCTAGAGATATTATTAGAGCAA > CP000730/567253‑567526 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |