| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 587,957 | G→T | A621S (GCG→TCG) | rpoB → | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 587,957 | 0 | G | T | 84.7% | 225.5 / 46.2 | 98 | A621S (GCG→TCG) | rpoB | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (5/10); new base T (30/53); total (35/63) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.57e-01 | |||||||||||
ACAAGCAAACTCTAAATTAGATGAAAATGGTCGTTTCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCAGCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTTGATGAATCCAGAAGCACCATTTGTTGGTACAGGTATGGAACACG > CP000730/587818‑588086 | acaAGCAAACTCTAAATTAGATGAAAATGGTCGTTTCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCagcagc > 2:660705/1‑141 (MQ=255) aaCTCTAAAATAGAAAAAAAAACTCGTTTCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTAAAAAAAAAAAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCa < 2:360257/141‑1 (MQ=255) ctAAATTAGATGAAAATGGTCGTTTCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTa > 1:787472/1‑141 (MQ=255) ctAAATTAGATGAAAATGGTCGTTTCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTa > 2:809952/1‑141 (MQ=255) aaaTTAGATGAAAATGGTCGTTTCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGACGTATCGCCGAAGCAAGTTGTCTCAGCAGCGACAGCATGTact > 2:186404/1‑139 (MQ=255) aTTAGATGAAAATGGTCGTTTCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTcc > 2:138040/1‑141 (MQ=255) tAGATGAAAATGGTCGTTTCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCAGCGACAGCATGTATTCCAt < 1:660705/141‑1 (MQ=255) gATGAAAATGGTCGTTTCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTACAGAAAAAATGGGAGATATGGAGGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTc > 1:470805/1‑141 (MQ=255) gATGAAAATGGTCGTTTCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTc > 2:836538/1‑141 (MQ=255) tGAAAATGGTCGTTTCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCtt < 1:137111/141‑1 (MQ=255) tGAAAATGGTCGTTTCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCtt < 1:840006/141‑1 (MQ=255) gAAAATGGTCGTTTCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTa < 2:484127/141‑1 (MQ=255) gAAAATGGTCGTTTCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCAGCGACAGCATGTATTCCATTCTTa < 2:81622/141‑1 (MQ=255) aaaaTGGTCGTTTCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAg > 1:978601/1‑141 (MQ=255) aaaaTGGTCGTTTCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAg > 2:875552/1‑141 (MQ=255) aaaTGGTCGTTTCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGa < 1:1025732/141‑1 (MQ=255) aaaTGGTCGTTTCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGa < 1:341182/141‑1 (MQ=255) tGGTCGTTTCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTAAGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGaaaa < 2:744791/141‑1 (MQ=255) tCGTTTCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAatga < 2:489368/141‑1 (MQ=255) cGTTTCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAatgat > 1:882103/1‑141 (MQ=255) gTTTCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTTGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAatgatg < 2:900473/141‑1 (MQ=255) gTTTCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCAGCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAatgatg < 1:480594/141‑1 (MQ=255) tttCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAAtgatga > 1:110801/1‑141 (MQ=255) tttCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAAtgatga > 2:577332/1‑141 (MQ=255) ttCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTGAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGAc > 1:283370/1‑141 (MQ=255) aTGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCa > 2:484792/1‑141 (MQ=255) ggATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCAGCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCaaa > 2:561223/1‑141 (MQ=255) gatgatGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGATAAAAAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAAc < 2:1016857/141‑1 (MQ=255) atgatgAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTA‑ATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCAGCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCg < 2:257114/141‑1 (MQ=255) tgatgaAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCg < 1:964741/141‑1 (MQ=255) gatgaAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGt < 1:367226/141‑1 (MQ=255) gaAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCa < 1:867956/141‑1 (MQ=255) gaAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCa < 2:761475/141‑1 (MQ=255) gaAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCa < 1:402793/141‑1 (MQ=255) aaGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCAt < 2:911523/141‑1 (MQ=255) aaGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCCAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCAt > 2:899496/1‑141 (MQ=255) aGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCAtt < 1:689921/141‑1 (MQ=255) aGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCAtt < 2:527937/141‑1 (MQ=255) gTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTg < 1:601915/141‑1 (MQ=255) gTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATg < 2:106774/141‑1 (MQ=255) gTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTAAAAATAAAAAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATg < 2:106450/141‑1 (MQ=255) aTGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATggg < 2:258332/141‑1 (MQ=255) aTGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATggg > 1:105275/1‑141 (MQ=255) tGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGt > 1:293689/1‑141 (MQ=255) cGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGCAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCg < 1:968914/141‑1 (MQ=255) cGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCg < 2:391197/141‑1 (MQ=255) ttCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAAc > 2:762030/1‑141 (MQ=255) tCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCAGCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACa < 2:520387/141‑1 (MQ=255) ccGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACAt < 2:295547/141‑1 (MQ=255) ccGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACAt < 2:295548/141‑1 (MQ=255) cGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCAGCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATg > 1:370572/1‑141 (MQ=255) gTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGc < 1:671412/141‑1 (MQ=255) tGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCa < 1:203014/141‑1 (MQ=255) gTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAAc > 2:794560/1‑141 (MQ=255) tAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACg < 1:704889/141‑1 (MQ=255) aaCAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGt < 1:585949/141‑1 (MQ=255) aTACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCAGCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAg > 2:182815/1‑141 (MQ=255) acagaaaaaaaaaaaGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCAGCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCa < 2:67665/129‑1 (MQ=255) aCAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCa > 2:842239/1‑141 (MQ=255) cAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAg < 1:668570/141‑1 (MQ=255) cAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAg < 2:451801/141‑1 (MQ=255) cAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAg < 2:890298/141‑1 (MQ=255) cAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAg < 1:343636/141‑1 (MQ=255) cAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCAGCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAg < 1:759478/141‑1 (MQ=255) aGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCAGCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGt < 2:874498/141‑1 (MQ=255) gTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTg > 2:386516/1‑141 (MQ=255) gTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTg > 2:506498/1‑141 (MQ=255) tATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGcc < 1:638118/141‑1 (MQ=255) tGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCtt > 2:802494/1‑141 (MQ=255) tAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTtgat > 2:9740/1‑141 (MQ=255) aaaGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTtgatg < 1:850455/141‑1 (MQ=255) aaaGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTtgatg < 1:644561/141‑1 (MQ=255) aaaGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTtgatg < 1:135088/141‑1 (MQ=255) aaaGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTtgatg < 1:809851/141‑1 (MQ=255) aaaGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTtgatg < 1:300818/141‑1 (MQ=255) aaaaTTTATGATATCGATGTATCGCCGAAGCAAGGTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAATACTATTGTTCAATGCTTTTATATATTTTTGCGAACATGCAACTTCAGGCAGTGCCTTTTATGAATCCa < 2:833385/141‑1 (MQ=255) aaaTGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTTGATGAATCCAg > 1:872075/1‑141 (MQ=255) tGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTTGATGAATCCAGAAg < 2:110801/141‑1 (MQ=255) gATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTTGATGAATCCAGAAGCa < 1:138040/141‑1 (MQ=255) gATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTTGATGAATCCAGAAGCa < 1:820782/141‑1 (MQ=255) gATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTTGATGAATCCAGAAGCa > 2:121914/1‑141 (MQ=255) gATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTTGATGAATCCAGAAGCa < 1:234235/141‑1 (MQ=255) aTTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCAATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTTGATGAATCCAGAAGCAc < 2:207364/141‑1 (MQ=255) tatGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTTGATGAATCCAGAAGCACCAtt < 1:279124/141‑1 (MQ=255) atGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTTGATGAATCCAGAAGCACCAttt < 1:291729/141‑1 (MQ=255) atGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCAGCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTTGATGAATCCAGAAGCACCAttt > 1:136837/1‑141 (MQ=255) tGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGGAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTTGATGAATCCAGAAGCACCATTTGTTgg > 1:532244/1‑141 (MQ=255) cGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCAGCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTTGATGAATCCAGAAGCACCATTTGTTGGTACAg < 1:101897/141‑1 (MQ=255) gCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTTGATGAATCCAGAAGCACCATTTGTTGGTACAgg > 1:372211/1‑141 (MQ=255) gCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTTGATGAATCCAGAAGCACCATTTGTTGGTACAgg < 2:1519/141‑1 (MQ=255) ccGAAGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTTGATGAATCCAGAAGCACCATTTGTTGGTACAGGt > 1:630173/1‑141 (MQ=255) aGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTTGATGAATCCAGAAGCACCATTTGTTGGTACAGGTATgg < 2:843471/141‑1 (MQ=255) aGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTTGATGAATCCAGAAGCACCATTTGTTGGTACAGGTATgg < 1:228582/141‑1 (MQ=255) aGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTTGATGAATCCAGAAGCACCATTTGTTGGTACAGGTATgg < 1:134934/141‑1 (MQ=255) aGCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTTGATGAATCCAGAAGCACCATTTGTTGGTACAGGTATgg < 2:419259/141‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTTGATGAATCCAGAAGCACCATTTGTTGGTACAGGTATGGa > 1:250469/1‑141 (MQ=255) gCAAGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTTGATGAATCCAGAAGCACCATTTGTTGGTACAGGTATGGa > 2:281545/1‑141 (MQ=255) aGTTGTTTCAGCATCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTTGATGAATCCAGAAGCACCATTTGTTGGTACAGGTATGGAacc > 2:608060/1‑140 (MQ=255) ttgttTCAGCAGCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTTGATGAATCCAGAAGCACCATTTGTTGGTACAGGTATGGAACACg < 1:263909/141‑1 (MQ=255) | ACAAGCAAACTCTAAATTAGATGAAAATGGTCGTTTCATGGATGATGAAGTTGTATGTCGTTTCCGTGGTAACAATACAGTTATGGCTAAAGAAAAAATGGATTATATGGATGTATCGCCGAAGCAAGTTGTTTCAGCAGCGACAGCATGTATTCCATTCTTAGAAAATGATGACTCAAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAAGCAGTGCCTTTGATGAATCCAGAAGCACCATTTGTTGGTACAGGTATGGAACACG > CP000730/587818‑588086 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |