New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | 895785 = | 62 (0.680) | 27 (0.340) | 15/226 | NT | 32.6% | coding (806/822 nt) | metQ | ABC superfamily ATP binding cassette transporter, binding protein |
? | CP000730 | = 909740 | 58 (0.730) | intergenic (‑663/‑371) | ear/USA300HOU_0868 | Ear protein/hypothetical protein |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
GGTTGTTTTCAAGGGCAAAAAAAGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTACGGATAAAGTAAAATCCTATATGCATGCGTGCTAC > CP000730/909601‑909880 | ggTTGTTTTCAAGGGGAAAAAAAGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAt > 2:393602‑M2/1‑140 (MQ=255) ggTTGTTTTCAAGGGCAAAAAAAGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCGGGCTAAt < 2:15293‑M2/141‑2 (MQ=255) ggTTGTTTTCAAGGGCAAAAAAAGGGCATAATTCTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAt > 2:1057843‑M2/1‑140 (MQ=255) ggTTGTTATCAAGGCCAAAAAAAGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCACGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTGTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGCTAATCTGGCTAAt < 2:367719‑M2/141‑2 (MQ=255) ttgttTTCAAGGGCAAAAAAAGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAACTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAtta < 1:1042500‑M2/141‑4 (MQ=255) ttttCAAGGGCAAAAAAAGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattc < 2:535290‑M2/141‑7 (MQ=255) aaaGGGAAAAAACAGGGCATAATTTATAAACAAAGGGCAAGGATATGAATAATAAATTACCTTGAAAACTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTCGAATGACCTTGAACTTCCTTGATAATTTGGCTAATTATTcaaac < 2:837676/140‑5 (MQ=255) aGGGCAAAAAAAGGGCATAATTTTTAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACGATGTTGTGATTGCCCTTGAACTTCCGTGATAATCTGGCTAAttattcgtgcta < 1:705925‑M2/141‑13 (MQ=255) aGGGCAAAAAAAGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCCAAttattcctgcta > 1:721788‑M2/1‑129 (MQ=255) aGGGAAAAAAAAGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgcta > 2:88505‑M2/1‑129 (MQ=255) gCAAAAAAAGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaat > 2:40219‑M2/1‑126 (MQ=255) aaaaaaaagGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaata > 1:987607‑M2/2‑125 (MQ=255) aaaaaaaagGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaata < 2:131152‑M2/140‑17 (MQ=255) aaaaaaGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAACATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCtaaataaa > 1:979680/1‑141 (MQ=255) aaaaaaGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCtaaataaa > 1:28502/1‑141 (MQ=255) aaaaGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATc < 1:215068/141‑1 (MQ=255) aGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaa < 2:12238‑M2/141‑24 (MQ=255) aGGGCATAAATTTGAAGCAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAAGTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCACTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCata < 1:107371/141‑1 (MQ=255) gggCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAACTAAATCatat > 2:910576/1‑141 (MQ=255) gggCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCatat > 1:773345/1‑141 (MQ=255) gggCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCatat > 1:773395/1‑141 (MQ=255) aTAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCGTGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaa < 1:256899‑M2/141‑29 (MQ=255) tttGAAACAAATGGCAAGAGTATATATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGATCTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaa > 2:788579‑M2/1‑108 (MQ=255) agcAAAGGGCAAGGGTATGAATTATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATAGAAGAATGTTTTGAGTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTaa < 2:58503/139‑1 (MQ=255) aaCAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTCTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTaa < 2:823517/141‑1 (MQ=255) cAAAGGTGAATGGTATGAATAATCAATTATCTTGAACATTTTATAAATGCATATATAACAATTTTTTGATTGCCTTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATTGCTCAGTAACg < 2:722927/141‑1 (MQ=255) aGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGa < 1:983722/141‑1 (MQ=255) gggCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaatcacctttat < 1:103161‑M2/141‑45 (MQ=255) gggCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaataaaataaaaataccctttaa < 2:938499‑M2/141‑45 (MQ=255) gggCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCACATATCCAACTGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcccgccaaataataccaattaactacaaatcccctttaa < 2:1005077‑M2/141‑45 (MQ=255) gggCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTCAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaattaccctttaa < 2:407744‑M2/141‑45 (MQ=255) ggCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAACTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATg < 2:1042500/141‑1 (MQ=255) gCAAGGGTATGAATAATACATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGt < 2:664474/141‑1 (MQ=255) cAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGTTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGtt > 2:258936/1‑141 (MQ=255) cAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTCACGTGATGtt > 2:252001/1‑141 (MQ=255) aaGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAGTGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataac < 1:211703‑M2/141‑49 (MQ=255) aaGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataatccccattaattaaaaataccctgtaataac < 2:546314‑M2/141‑49 (MQ=255) aaGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttattaac < 1:391788‑M2/141‑49 (MQ=255) tGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATGATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCt < 1:281655/141‑1 (MQ=255) ataattAATTATCTTGAGAATGTTATAAATGCATATATAACCATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCtttt < 2:772641/141‑1 (MQ=255) ataataAATTATCTTGATAATTTTATAAATGCATATATAAAACTGTCATGCCCGACCCTGCTATTGCTTGATAATCTGGCTAATTTTTTCTGTTAAATTATTCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCtttt < 2:1062463/141‑1 (MQ=255) ataataAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCtttt < 2:806177/141‑1 (MQ=255) agaataaATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCtttt < 2:28361/139‑1 (MQ=255) aaaTTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTtttaatt < 1:300294/141‑1 (MQ=255) aTCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACCAGGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAAc < 1:473192/141‑1 (MQ=255) aTCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTCCatcttcgcgcaagataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttt < 1:255555‑M2/141‑69 (MQ=255) tCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGTCCTTGAACTTCCTTGATAATCGGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCGTATTAATGGCTGAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAGCa > 1:1058467/1‑141 (MQ=255) tCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACa > 2:474013/1‑141 (MQ=255) ttGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAgg < 1:144476/141‑1 (MQ=255) ttGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGCTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAACTCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAgg < 1:740476/141‑1 (MQ=255) tGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggcgttattttgttg < 1:641015‑M2/141‑73 (MQ=255) tGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCGGGGCTTTTTAAGTTAAACAGGt > 1:834951/1‑141 (MQ=255) aaaaTTTTATAAATGCATATATAACGATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTACACAATCTTGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTAt > 1:479920/1‑141 (MQ=255) aaTTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTAttt > 2:330691/1‑141 (MQ=255) ttttATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTtat < 1:594371/141‑1 (MQ=255) tgtagacataACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATAttt < 1:333223/134‑1 (MQ=255) tatataACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGa < 2:236626/141‑1 (MQ=255) tatataACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGa < 1:466636/141‑1 (MQ=255) atataACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGaa < 2:637902/141‑1 (MQ=255) atataACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGATCGGTTACTTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGaa < 1:1038223/141‑1 (MQ=255) tataACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAAt < 2:409305/141‑1 (MQ=255) ataACAAGGTGTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAAGCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTTAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATg < 1:37397/141‑1 (MQ=255) aaaatgTTTTGACTGCCCTTGAACTTCCGTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttttgtggtattgaaaataaaaaagggcacaa > 2:247870‑M2/3‑44 (MQ=255) aCAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATCTTTAGGACTgcgt > 1:763789/1‑138 (MQ=255) aaTGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttttgtggtattgaaaataaaaaagggcacaaaa > 1:267032‑M2/1‑42 (MQ=255) tttttGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTa < 2:589878/140‑1 (MQ=255) ttGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATACTCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTa < 1:375711/141‑1 (MQ=255) ttGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGGATGAGATGCTATTa > 1:420400/1‑141 (MQ=255) ttGATTGCCCTTGAACTTCCTTCCGGAGCTGGCGAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTa > 1:535677/1‑141 (MQ=255) tGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTAc > 2:566195/1‑141 (MQ=255) tGATTGCCCTTGAACTTCCTTGAGAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGATGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTAc > 2:791321/1‑141 (MQ=255) tGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTACGGAt < 1:177722/141‑1 (MQ=255) gtccttGAACTCCCCTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaattacaacgattaaggggttatttttgtggtattgaaaataaaaaagggcacaaaaggggcagtatat > 2:379795‑M2/3‑30 (MQ=255) gCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttttgtggtattgaaaataaaaaagggcacaaaaggggcagtatat > 2:385106‑M2/1‑30 (MQ=255) gCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCAAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttttgtggtattgaaaataaaaaagggcacaaaaggggcagtatat > 1:230556‑M2/1‑30 (MQ=255) ccTTTAACTGTCTGGATAATCTGGCCACttagtcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaccgattaaggggttattcttgtggtattgaaaagaaaaaagggcaccaaaggggcagtatatgc > 2:337282‑M2/1‑28 (MQ=255) ccTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTACGGATaaa > 2:1028353/1‑141 (MQ=255) cTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTACGGATAAAg < 2:883167/141‑1 (MQ=255) tGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttttgtggtattgaaaataaaaaagggcacaaaaggggcagtatatgcaaa < 1:782082‑M2/141‑117 (MQ=255) ttCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGTCTCAGTAACATGATTTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGGTATTTAGGTATGAGATGCTATTACGGATAAAGTAAAATc > 1:151208/1‑141 (MQ=255) ttCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGCTGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATGTTTAGGGATGAGATGCTATTACGGCTAAAGTAAAATc > 1:151603/1‑141 (MQ=255) agatccaagcgtgcaagtattcctgctaaataataccaaataaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttttgtggtattgaaaataaaaaagggcacaaaaggggcagtatatgcaaattatcgaat > 2:866281‑M2/15‑16 (MQ=255) tGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattatataaacataacctttaataacaacgattaaggggttatttttgtggtattgaaaataaaaaagggcacaaaaggggcagtatatgcaaattattgaatt < 1:757611‑M2/141‑127 (MQ=255) tGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaatagaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttttgtggtattgaaaataaaaaagggcacaaaaggggcagtatatgcaaattatcgaatt < 1:758207‑M2/141‑127 (MQ=255) tGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttattttttttgttttttaaataaaaaagggcaaaaaaggggcggtatatgtaaattatcgaatt < 2:819598‑M2/141‑127 (MQ=255) tGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttttgtggtattgaaaataaaaaagggcacaaaaggggcagtatatgcaaattatcgaatt < 2:483025‑M2/141‑127 (MQ=255) tGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttttgtggtattgaaaataaaaaagggcacaaaaggggcagtatatgcaaattatcgaatt < 2:819493‑M2/141‑127 (MQ=255) gATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttttgtggtattgaaaataaaaaagggccccaaaggggcagtatatgcaaattatcgaattt < 2:76502‑M2/141‑128 (MQ=255) gATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGATATGCTATTACGGATAAAGTAAAATCCTatat > 2:174048/1‑141 (MQ=255) tAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttttgtggaattgaaaataaaaaagggcacaaaaggggcagtatatgcaaattatcgaatttta < 1:108960‑M2/141‑130 (MQ=255) cTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAACTCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTACGGATAAAGTAAAATCCTATatgcatgg > 2:1060960/1‑140 (MQ=255) cTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTACGGATAAAGTAAAATCCTATatgcatgc < 1:953431/141‑1 (MQ=255) ggCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTACGGATAAAGTAAAATCCTATATGCATGCGt > 1:280512/1‑141 (MQ=255) ggCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTACGGATAAAGTAAAATCCTATATGCATGCGt < 2:163317/141‑1 (MQ=255) tAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTACGGATAAAGTAAAATCCTATATGCATGCGTGCt < 1:350628/141‑1 (MQ=255) tAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTAAAACATGTATTCAAATCACATGGAGTAATGAGATGCTATTACGGATAAAGTAAAATCCTATATGCATGCGTGCt < 1:258936/141‑1 (MQ=255) attattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttttgtggtattgaaaataaaaaagggcacaaaaggggcagtatatgcaaattatcgaattttaaacaaaaaaat > 1:1048767‑M2/1‑1 (MQ=255) attattCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGGTGGTCTTTTTAATTTAAACAGGTCTTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTACGGATAAAGTAAAATCCTATATGCAAGGGTGcgtc > 2:98212/1‑138 (MQ=255) attattCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTACGGATAAAGTAAAATCCTATATGCATGCGTGCTAc > 2:430875/1‑141 (MQ=255) attattCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTACGGATAAAGTAAAATCCTATATGCATGCGTGCTAc < 1:1014441/141‑1 (MQ=255) | GGTTGTTTTCAAGGGCAAAAAAAGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTACGGATAAAGTAAAATCCTATATGCATGCGTGCTAC > CP000730/909601‑909880 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |