Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ CP000730 1960901 1961020 120 6 [4] [4] 5 USA300HOU_1820/USA300HOU_1821 hypothetical bacteriophage protein/hypothetical protein

CACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTAATTACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACTAACTCCTGGTTATGCTACGCTTTACTTTATAATCCGCACGTAGATGCCGAT  >  CP000730/1960789‑1960961
                                                                                                               |                                                             
cacaTAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTAATTACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACTAACTCCTGGTTATGCTACg                                  <  1:559962/141‑1 (MQ=255)
                   cACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTAATTACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACTAACTCCTGGTTATGCTACGCTTTACTTTATAATCCGCa               <  2:370297/141‑1 (MQ=255)
                        gTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTAATTACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATttatta                                                               >  1:348730/1‑88 (MQ=255)
                        gTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTAATTACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATttatta                                                               <  2:348730/88‑1 (MQ=255)
                            gCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTAATTACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACTAACTCCTGGTTATGCTACGCTTTACTTTATAATCCGCACGTAGATGc      <  1:62960/141‑1 (MQ=255)
                                ttCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTAATTACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACTAACTCCTGGTTATGCTACGCTTTACTTTATAATCCGCACGTAGATGCCgat  <  1:642872/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                               |                                                             
CACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTAATTACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACTAACTCCTGGTTATGCTACGCTTTACTTTATAATCCGCACGTAGATGCCGAT  >  CP000730/1960789‑1960961

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: