| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | CP000730 | 58661 | 58848 | 188 | 5 [4] | [4] 8 | USA300HOU_0049/USA300HOU_0050 | hypothetical protein/hypothetical protein |
GTTTAATTAGAAAATATATTTAAGAATTATGAATTTAGTTCTTATTAATGTTAAAGATCATCAATTATTTTGTCACATTATCTTGAGAGGATTACCTTATGAGGTAGCCTTTTATTTGTCACCTAATATTGCTCTAAGGCTA > CP000730/58790‑58931 | gTTTAATTAGAAAATATATTTAAGAATTATGAATTTAGTTCTTATTAATGTTAAAGATCATCAATTATTTTGTCACATTa > 1:175299/1‑80 (MQ=255)gTTTAATTAGAAAATATATTTAAGAATTATGAATTTAGTTCTTATTAATGTTAAAGATCATCAATTATTTTGTCACATTa < 2:175299/80‑1 (MQ=255) aGATCATCAATTATTTTGTCACATTATCTTGAGAGGATTACCTTATGAGGTAGCCTTTTATTTGTCACCTAATATTGCTCTAAGGCta > 1:513514/1‑88 (MQ=255) aGATCATCAATTATTTTGTCACATTATCTTGAGAGGATTACCTTATGAGGTAGCCTTTTATTTGTCACCTAATATTGCTCTAAGGCta < 2:513514/88‑1 (MQ=255) atcaATTATTTTGTCACATTATCTTGAGAGGATTActta > 1:479863/1‑36 (MQ=255) atcaATTATTTTGTCACATTATCTTGAGAGGATTActta > 1:479649/1‑36 (MQ=255) atcaATTATTTTGTCACATTATCTTGAGAGGATTActta < 2:479649/39‑4 (MQ=255) atcaATTATTTTGTCACATTATCTTGAGAGGATTActta < 2:479863/39‑4 (MQ=255) | GTTTAATTAGAAAATATATTTAAGAATTATGAATTTAGTTCTTATTAATGTTAAAGATCATCAATTATTTTGTCACATTATCTTGAGAGGATTACCTTATGAGGTAGCCTTTTATTTGTCACCTAATATTGCTCTAAGGCTA > CP000730/58790‑58931 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |