Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	CP000730	346033	346149	117	5 [4]	[2] 6	[USA300HOU_0310]	[USA300HOU_0310]

AATTATAAATAGTTAAATAAATTGAAAGACAAAATAATGAGTAGGAGTTAATGAGATGGAAAACCAAAAACAAGGCAATGGCTTAAAAATTGCAACATGGGTATTTATTGTATTAACAGTAGTTACACCGCTATTTGGTATTGGAAGTATT  >  CP000730/346131‑346281                    |                                                                                                                                    aaTTATAAATAGTTAAATAAATTGAAAGACAAAATAATGAGTAGGAGTTAATGAGATGGAAAACCAAAAACAAGGCAATGGCTTAAAAATTGCAACATGGGTATTTATTGTATTAACAGTAGTTACACCGCTATTTGGTAt            >  2:468979/1‑141 (MQ=255)           aGTTAAATAAATTGAAAGACAAAATAATGAGTAGGAGTTAATGAGATGGAAAACCAAAAACAAGGCAATGGCTTAAAAATTGCAACATGGGTATTTATTGTATTAACAGTAGTTACACCGCTATTTGGTATTGGAAGTAtt  >  2:563948/1‑141 (MQ=255)                    aatTGAAAGACAAAATAATGAGTAGGAGTTAATGAGATGGAAAACCAAAAACAAGGCAATGGCTTAAAAATTGCAACATGGGtatt                                                >  1:428608/1‑86 (MQ=255)                    aatTGAAAGACAAAATAATGAGTAGGAGTTAATGAGATGGAAAACCAAAAACAAGGCAATGGCTTAAAAATTGCAACATGGGtatt                                                >  1:428631/1‑86 (MQ=255)                    aatTGAAAGACAAAATAATGAGTAGGAGTTAATGAGATGGAAAACCAAAAACAAGGCAATGGCTTAAAAATTGCAACATGGGtatt                                                <  2:428608/86‑1 (MQ=255)                    aatTGAAAGACAAAATAATGAGTAGGAGTTAATGAGATGGAAAACCAAAAACAAGGCAATGGCTTAAAAATTGCAACATGGGtatt                                                <  2:428631/86‑1 (MQ=255)                    |                                                                                                                                    AATTATAAATAGTTAAATAAATTGAAAGACAAAATAATGAGTAGGAGTTAATGAGATGGAAAACCAAAAACAAGGCAATGGCTTAAAAATTGCAACATGGGTATTTATTGTATTAACAGTAGTTACACCGCTATTTGGTATTGGAAGTATT  >  CP000730/346131‑346281

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑