Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	CP000730	346091	346160	70	2 [1]	[1] 2	USA300HOU_0310/USA300HOU_0311	hypothetical membrane protein/hypothetical protein

AAGACAAAATAATGAGTAGGAGTTAATGAGATGGAAAACCAAAAACAAGGCAATGGCTTAAAAATTGCAACATGGGTATTTATTGTATTAACAGTAGTTACACCGCTATTTGGTATTGGAAGTATTGTTTGTAGTATTAATTATAA  >  CP000730/346156‑346301      |                                                                                                                                             aaGACAAAATAATGAGTAGGAGTTAATGAGATGGAAAACCAAAAACAAGGCAATGGCTTAAAAATTGCAACATGGGTATTTATTGTATTAACAGTAGTTACACCGCTATTTGGTATTGGAAGTATTGTTTGTAGTattaat       >  1:260385/1‑141 (MQ=255)      aaaaTAATGTGTAGGTGTTAATAAGAAGGAAAACCATAAACAAGGTGATGGCTCAAAAATTGCAACATAGGAATTTATTGTATTAACAGTAGTTACAGCGCTATTTGGTAGTGGAAGTAATGTTTGTAGTATTAATTACaa  >  2:81813/1‑141 (MQ=255)      |                                                                                                                                             AAGACAAAATAATGAGTAGGAGTTAATGAGATGGAAAACCAAAAACAAGGCAATGGCTTAAAAATTGCAACATGGGTATTTATTGTATTAACAGTAGTTACACCGCTATTTGGTATTGGAAGTATTGTTTGTAGTATTAATTATAA  >  CP000730/346156‑346301

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑